275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1039 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1039  Pyridoxal-dependent decarboxylase  100 
 
 
412 aa  856    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2166  L-tyrosine decarboxylase  30.65 
 
 
365 aa  149  8e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1136  L-tyrosine decarboxylase  30.45 
 
 
384 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1636  L-tyrosine decarboxylase  27.94 
 
 
384 aa  146  8.000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1547  L-tyrosine decarboxylase  30.53 
 
 
384 aa  144  3e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.875736  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2080  L-tyrosine decarboxylase  29.75 
 
 
363 aa  143  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0977  L-tyrosine decarboxylase  28.78 
 
 
395 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1436  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.68 
 
 
374 aa  139  7.999999999999999e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.687898  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1130  L-tyrosine decarboxylase  29.74 
 
 
384 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1848  L-tyrosine decarboxylase  30.08 
 
 
365 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2007  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.96 
 
 
403 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0821  L-tyrosine decarboxylase  29.48 
 
 
384 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.750414  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1008  L-tyrosine decarboxylase  28.15 
 
 
390 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.461391  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0805  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28 
 
 
361 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1545  L-tyrosine decarboxylase  27.79 
 
 
365 aa  127  3e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0671702  hitchhiker  0.0000867545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2611  L-tyrosine decarboxylase  28.89 
 
 
369 aa  127  5e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1732  L-tyrosine decarboxylase  26.91 
 
 
379 aa  125  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2599  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.08 
 
 
365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2743  L-tyrosine decarboxylase  29 
 
 
349 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2995  L-tyrosine decarboxylase  27.08 
 
 
349 aa  114  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02100  histidine decarboxylase  27.24 
 
 
386 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0591  L-tyrosine decarboxylase  26.74 
 
 
355 aa  106  6e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0146124  normal  0.883082 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_2217  predicted protein  27.15 
 
 
364 aa  105  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3028  histidine decarboxylase  24.16 
 
 
398 aa  99.4  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.726503  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0806  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.45 
 
 
411 aa  98.6  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.168032 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1500  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.94 
 
 
500 aa  97.4  4e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.112242  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2190  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.41 
 
 
474 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1637  histidine decarboxylase  26.48 
 
 
383 aa  93.2  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0304  pyridoxal-dependent decarboxylase  22.86 
 
 
581 aa  92.4  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0782914 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0606  non-ribosomal peptide synthetase module-containing protein  24.11 
 
 
462 aa  91.7  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0934  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.66 
 
 
466 aa  89.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000218274  decreased coverage  0.000132275 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3373  Pyridoxal-dependent decarboxylase  24.86 
 
 
494 aa  87.4  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0563875  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1072  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.02 
 
 
474 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3073  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.34 
 
 
514 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.441347  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87778  dihydrosphingosine-1-phosphate lyase  24.01 
 
 
603 aa  84  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3961  Pyridoxal-dependent decarboxylase  24.25 
 
 
478 aa  82.8  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1867  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.4 
 
 
498 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1873  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.2 
 
 
472 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.044289  normal  0.812242 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1171  pyridoxal-dependent decarboxylase  22.32 
 
 
475 aa  81.3  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0333328 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1282  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.6 
 
 
477 aa  80.9  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0661  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.9 
 
 
484 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000151703  normal  0.871149 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0159  Pyridoxal-dependent decarboxylase  23.98 
 
 
513 aa  80.9  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2555  decarboxylase, pyridoxal-dependent  23.3 
 
 
484 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100435 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2157  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.77 
 
 
479 aa  80.1  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2734  decarboxylase, pyridoxal-dependent  23.01 
 
 
484 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08514e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2539  decarboxylase, pyridoxal-dependent  23.01 
 
 
484 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2724  decarboxylase, pyridoxal-dependent  23.01 
 
 
484 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1624  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.11 
 
 
552 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4065  Pyridoxal-dependent decarboxylase  22.6 
 
 
529 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.125159  normal  0.183613 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1469  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.6 
 
 
549 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.899491  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1603  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.54 
 
 
549 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00702468  normal  0.288093 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09421  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  24.11 
 
 
461 aa  77.4  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2744  glutamate decarboxylase  24.41 
 
 
468 aa  77.4  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0749502  hitchhiker  0.000505067 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2288  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.05 
 
 
494 aa  76.6  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.715836  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3418  pyridoxal-dependent decarboxylase  23.94 
 
 
472 aa  76.6  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.3739  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3467  glutamate decarboxylase  24.35 
 
 
457 aa  76.6  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.43113  normal  0.0785631 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2774  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.37 
 
 
549 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267346 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1574  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.37 
 
 
549 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2535  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.65 
 
 
546 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1569  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.6 
 
 
549 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2916  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  29.95 
 
 
510 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122607 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2115  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  23.96 
 
 
489 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0372  glutamate decarboxylase  28.96 
 
 
466 aa  75.5  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.231865  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3171  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.03 
 
 
505 aa  75.1  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.902274  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2448  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  27.89 
 
 
515 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2953  glutamate decarboxylase  24 
 
 
464 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2547  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.89 
 
 
515 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3190  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  27.89 
 
 
515 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.399603  normal  0.0148161 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55334  glutamate decarboxylase 2  25.44 
 
 
507 aa  75.1  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0883  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  23.23 
 
 
461 aa  74.3  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.354437  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1055  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.4 
 
 
530 aa  74.7  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0590  putative L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  30.1 
 
 
484 aa  74.7  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.126403  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1200  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.78 
 
 
560 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1241  pyridoxal-dependent decarboxylase  23.8 
 
 
466 aa  73.9  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2588  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.47 
 
 
549 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2562  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.5 
 
 
468 aa  73.9  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000400331  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15730  predicted protein  25.49 
 
 
442 aa  73.9  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0024811  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2686  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.35 
 
 
549 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.555524 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1007  putative decarboxylase  23.77 
 
 
543 aa  72.8  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2835  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.67 
 
 
507 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.579316  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0981  Pyridoxal-dependent decarboxylase  24.29 
 
 
541 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2520  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.35 
 
 
549 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.212789 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1051  hypothetical protein  26.94 
 
 
636 aa  72.4  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.922424  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04970  decarboxylase, pyridoxal-dependent  31.79 
 
 
479 aa  71.6  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.421495  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22660  PLP-dependent enzyme, glutamate decarboxylase  26.24 
 
 
483 aa  71.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1766  glutamate decarboxylase  25.63 
 
 
460 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.184514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8660  glutamate decarboxylase  22.71 
 
 
463 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0134  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  26.73 
 
 
515 aa  72.4  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09431  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  22.92 
 
 
461 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1769  glutamate decarboxylase, putative  26.3 
 
 
533 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18041  glutamate decarboxylase  24.71 
 
 
479 aa  70.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.171895 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1807  Pyridoxal-dependent decarboxylase  23.34 
 
 
789 aa  70.5  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000170312  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119543  Sphingosine-1-phosphate lyase  23.06 
 
 
532 aa  70.1  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1102  pyridoxal-dependent decarboxylase  22.43 
 
 
492 aa  70.1  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.967255  normal  0.206901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4546  pyridoxal-dependent decarboxylase conserved domain protein  24.46 
 
 
472 aa  69.7  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0851794  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0460  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.81 
 
 
552 aa  69.7  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362513  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0076  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.55 
 
 
458 aa  68.9  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3135  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.36 
 
 
551 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0142161 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2531  Pyridoxal-dependent decarboxylase  22.87 
 
 
460 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00114613  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1197  glutamate decarboxylase beta  23.33 
 
 
464 aa  68.9  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>