126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1637 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1637  histidine decarboxylase  100 
 
 
383 aa  805    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02100  histidine decarboxylase  62.37 
 
 
386 aa  503  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_2217  predicted protein  40.29 
 
 
364 aa  268  8e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3028  histidine decarboxylase  34.75 
 
 
398 aa  243  3e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.726503  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0354  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.87 
 
 
448 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0272  glutamate decarboxylase  26.58 
 
 
456 aa  116  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1436  Pyridoxal-dependent decarboxylase  24.8 
 
 
374 aa  109  8.000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.687898  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0827  glutamate decarboxylase  25.8 
 
 
592 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1545  L-tyrosine decarboxylase  26.32 
 
 
365 aa  103  4e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0671702  hitchhiker  0.0000867545 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2166  L-tyrosine decarboxylase  26.79 
 
 
365 aa  100  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1636  L-tyrosine decarboxylase  25.73 
 
 
384 aa  99.4  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1848  L-tyrosine decarboxylase  28.37 
 
 
365 aa  94  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2080  L-tyrosine decarboxylase  25.46 
 
 
363 aa  89.7  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0977  L-tyrosine decarboxylase  25.33 
 
 
395 aa  87  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1039  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.21 
 
 
412 aa  82.8  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1732  L-tyrosine decarboxylase  23.17 
 
 
379 aa  79.7  0.00000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1008  L-tyrosine decarboxylase  23.68 
 
 
390 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.461391  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1136  L-tyrosine decarboxylase  22.03 
 
 
384 aa  76.6  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0805  Pyridoxal-dependent decarboxylase  23.57 
 
 
361 aa  76.3  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1807  Pyridoxal-dependent decarboxylase  25.74 
 
 
789 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000170312  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2599  Pyridoxal-dependent decarboxylase  23.59 
 
 
365 aa  75.5  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1581  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.14 
 
 
475 aa  74.3  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4546  pyridoxal-dependent decarboxylase conserved domain protein  26.64 
 
 
472 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0851794  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2743  L-tyrosine decarboxylase  23.02 
 
 
349 aa  72  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2611  L-tyrosine decarboxylase  23.83 
 
 
369 aa  70.9  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0591  L-tyrosine decarboxylase  25.59 
 
 
355 aa  71.2  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0146124  normal  0.883082 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2995  L-tyrosine decarboxylase  24.37 
 
 
349 aa  70.5  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0606  non-ribosomal peptide synthetase module-containing protein  26.12 
 
 
462 aa  68.2  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0883  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  24.65 
 
 
461 aa  67  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.354437  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0661  pyridoxal-dependent decarboxylase  22.92 
 
 
484 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000151703  normal  0.871149 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2007  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.04 
 
 
403 aa  65.1  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2138  putative diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  26.83 
 
 
967 aa  65.1  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00227594  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2354  Pyridoxal-dependent decarboxylase  24.91 
 
 
495 aa  63.5  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0161317  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1038  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  23.96 
 
 
483 aa  63.5  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1130  L-tyrosine decarboxylase  22.75 
 
 
384 aa  63.5  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55334  glutamate decarboxylase 2  29.85 
 
 
507 aa  63.2  0.000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1547  L-tyrosine decarboxylase  20.72 
 
 
384 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.875736  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10619  glutamate decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11120)  26.13 
 
 
577 aa  61.6  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0303168  normal  0.118033 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2539  decarboxylase, pyridoxal-dependent  24.07 
 
 
484 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2724  decarboxylase, pyridoxal-dependent  24.07 
 
 
484 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2734  decarboxylase, pyridoxal-dependent  24.07 
 
 
484 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08514e-18 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2059  Pyridoxal-dependent decarboxylase  24.91 
 
 
495 aa  60.8  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00190827  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1124  aromatic amino acid decarboxylase, putative  23.64 
 
 
491 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4221  pyridoxal-dependent decarboxylase  22.62 
 
 
488 aa  60.5  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.488782 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0134  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  22.49 
 
 
515 aa  60.1  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2418  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.1 
 
 
490 aa  59.7  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000894226  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16491  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  25.27 
 
 
470 aa  59.7  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.360036 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2555  decarboxylase, pyridoxal-dependent  23.65 
 
 
484 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100435 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09431  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  25.82 
 
 
461 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1232  aminotransferase, class III/decarboxylase, group II  24.01 
 
 
961 aa  59.3  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000122861  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0821  L-tyrosine decarboxylase  20.72 
 
 
384 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.750414  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0934  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.79 
 
 
466 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000218274  decreased coverage  0.000132275 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2288  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.42 
 
 
494 aa  58.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.715836  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09421  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  26.23 
 
 
461 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1171  pyridoxal-dependent decarboxylase  22.7 
 
 
475 aa  57.8  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0333328 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02632  glutamate decarboxylase  26.72 
 
 
548 aa  58.2  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1261  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  23.33 
 
 
483 aa  56.6  0.0000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1209  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  24.46 
 
 
469 aa  56.6  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2714  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.49 
 
 
488 aa  55.5  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216735  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1738  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.21 
 
 
474 aa  55.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1282  pyridoxal-dependent decarboxylase  22.02 
 
 
477 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03010  PLP-dependent enzyme, glutamate decarboxylase  24.91 
 
 
442 aa  55.1  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0076  Pyridoxal-dependent decarboxylase  22.14 
 
 
458 aa  55.5  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1055  pyridoxal-dependent decarboxylase  22.97 
 
 
530 aa  54.7  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2115  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  26.59 
 
 
489 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4339  Pyridoxal-dependent decarboxylase  24.76 
 
 
517 aa  54.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.843861  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2916  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  22.34 
 
 
510 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122607 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2838  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  23.13 
 
 
522 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0758155  normal  0.28501 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07761  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  24.7 
 
 
456 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0845725  normal  0.0349206 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3171  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.37 
 
 
505 aa  53.9  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.902274  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04970  decarboxylase, pyridoxal-dependent  26 
 
 
479 aa  53.9  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.421495  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0144  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  23.87 
 
 
456 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2032  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.64 
 
 
547 aa  53.5  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0351867  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0927  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  26.69 
 
 
511 aa  53.5  0.000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0831  pyridoxal-dependent decarboxylase  23.57 
 
 
573 aa  53.5  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00169678  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2547  pyridoxal-dependent decarboxylase  23.44 
 
 
515 aa  53.5  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10001  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  25.99 
 
 
460 aa  53.1  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.450995  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003759  glutamate decarboxylase eukaryotic type  25.97 
 
 
548 aa  53.1  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02741  hypothetical protein  23.9 
 
 
963 aa  52.8  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2157  pyridoxal-dependent decarboxylase  22.43 
 
 
479 aa  52.8  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6749  Pyridoxal-dependent decarboxylase  25.35 
 
 
574 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0719  putative glutamate decarboxylase  26.79 
 
 
548 aa  52.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1074  Pyridoxal-dependent decarboxylase  24.89 
 
 
551 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.433316 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3190  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  23.05 
 
 
515 aa  52  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.399603  normal  0.0148161 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2448  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  23.05 
 
 
515 aa  51.2  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3330  Pyridoxal-dependent decarboxylase  25.57 
 
 
503 aa  50.8  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.405304  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003101  diaminobutyrate-pyruvate transaminase/L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  23.41 
 
 
958 aa  50.1  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15730  predicted protein  25.1 
 
 
442 aa  49.7  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0024811  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0961  decarboxylase, group II  25.42 
 
 
557 aa  49.7  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000836659  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36228  predicted protein  24.23 
 
 
453 aa  48.9  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1500  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.81 
 
 
500 aa  49.7  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.112242  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2983  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  23.37 
 
 
496 aa  48.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0590  putative L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  22.64 
 
 
484 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.126403  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4065  Pyridoxal-dependent decarboxylase  22.41 
 
 
529 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.125159  normal  0.183613 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119543  Sphingosine-1-phosphate lyase  24.62 
 
 
532 aa  47.4  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1305  Pyridoxal-dependent decarboxylase  23.01 
 
 
480 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2223  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  24.7 
 
 
470 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0898505  normal  0.960692 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2551  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.39 
 
 
534 aa  46.6  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.547739 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0309  glutamate decarboxylase  25.48 
 
 
455 aa  46.2  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0520233  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0196  Pyridoxal-dependent decarboxylase  24.47 
 
 
484 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.6927  normal  0.0347054 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>