124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0272 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0272  glutamate decarboxylase  100 
 
 		 456 aa  937    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0354  Pyridoxal-dependent decarboxylase  64.38 
 
 		 448 aa  596  1e-169  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0827  glutamate decarboxylase  30.06 
 
 		 592 aa  212  9e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3028  histidine decarboxylase  27.54 
 
 		 398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.726503  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02100  histidine decarboxylase  27.43 
 
 		 386 aa  129  8.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_2217  predicted protein  27.08 
 
 		 364 aa  129  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1637  histidine decarboxylase  26.67 
 
 		 383 aa  124  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1436  Pyridoxal-dependent decarboxylase  23.33 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.687898  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1545  L-tyrosine decarboxylase  22.25 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0671702  hitchhiker  0.0000867545 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1261  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  28.83 
 
 		 483 aa  73.6  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2080  L-tyrosine decarboxylase  24.16 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1008  L-tyrosine decarboxylase  20.5 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.461391  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1769  glutamate decarboxylase, putative  27.36 
 
 		 533 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2520  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.36 
 
 		 549 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.212789 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2686  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.36 
 
 		 549 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.555524 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2588  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.04 
 
 		 549 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09431  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  23.36 
 
 		 461 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16491  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  27.91 
 
 		 470 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.360036 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1007  putative decarboxylase  26.23 
 
 		 543 aa  64.3  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1469  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.08 
 
 		 549 aa  64.3  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.899491  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1807  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.08 
 
 		 789 aa  63.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000170312  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0178  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.15 
 
 		 462 aa  62.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1055  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.6 
 
 		 530 aa  62.8  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10619  glutamate decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11120)  25.65 
 
 		 577 aa  62  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0303168  normal  0.118033 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0883  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  21.85 
 
 		 461 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.354437  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1574  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.43 
 
 		 549 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09421  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  22.85 
 
 		 461 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1569  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.43 
 
 		 549 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2774  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.43 
 
 		 549 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267346 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0977  L-tyrosine decarboxylase  21 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1848  L-tyrosine decarboxylase  22.56 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1168  Pyridoxal-dependent decarboxylase  23.21 
 
 		 482 aa  60.8  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0831  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.86 
 
 		 573 aa  60.8  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00169678  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2715  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.01 
 
 		 548 aa  60.8  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.288765  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2535  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.66 
 
 		 546 aa  60.1  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0114  Pyridoxal-dependent decarboxylase  23.66 
 
 		 480 aa  60.1  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15522  normal  0.0242531 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1200  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.3 
 
 		 560 aa  60.1  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1624  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.85 
 
 		 552 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2780  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.78 
 
 		 550 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.300778 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1603  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.74 
 
 		 549 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00702468  normal  0.288093 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2434  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.3 
 
 		 554 aa  58.9  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2166  L-tyrosine decarboxylase  24.58 
 
 		 365 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3135  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.49 
 
 		 551 aa  58.9  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0142161 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1636  L-tyrosine decarboxylase  24.28 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2531  Pyridoxal-dependent decarboxylase  25.63 
 
 		 460 aa  58.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00114613  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2916  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  24.59 
 
 		 510 aa  57.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4546  pyridoxal-dependent decarboxylase conserved domain protein  27.08 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0851794  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0719  putative glutamate decarboxylase  24.5 
 
 		 548 aa  56.6  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1124  aromatic amino acid decarboxylase, putative  25.97 
 
 		 491 aa  56.6  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1282  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.24 
 
 		 477 aa  56.6  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1732  L-tyrosine decarboxylase  18.83 
 
 		 379 aa  56.6  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2643  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.24 
 
 		 546 aa  56.2  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.160588  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10001  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  22.86 
 
 		 460 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.450995  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02632  glutamate decarboxylase  26.28 
 
 		 548 aa  55.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2138  putative diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  26 
 
 		 967 aa  55.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00227594  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1039  Pyridoxal-dependent decarboxylase  21.58 
 
 		 412 aa  55.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6192  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.35 
 
 		 492 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.478239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0460  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.03 
 
 		 552 aa  55.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0931  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.05 
 
 		 567 aa  55.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0934  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.53 
 
 		 466 aa  54.3  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000218274  decreased coverage  0.000132275 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2413  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.33 
 
 		 459 aa  54.3  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2032  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.62 
 
 		 547 aa  54.3  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0351867  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1707  group II decarboxylase  27.61 
 
 		 552 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0663746  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2611  L-tyrosine decarboxylase  20.41 
 
 		 369 aa  52.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2310  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  25.65 
 
 		 489 aa  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.506086  normal  0.726788 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003759  glutamate decarboxylase eukaryotic type  25.98 
 
 		 548 aa  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2558  Pyridoxal-dependent decarboxylase  24.59 
 
 		 467 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2983  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  26.11 
 
 		 496 aa  51.6  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0959  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.09 
 
 		 538 aa  51.2  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1644  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.24 
 
 		 550 aa  51.2  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1738  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.06 
 
 		 474 aa  51.2  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1038  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  27.5 
 
 		 483 aa  50.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4065  Pyridoxal-dependent decarboxylase  24.62 
 
 		 529 aa  50.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.125159  normal  0.183613 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1305  Pyridoxal-dependent decarboxylase  24.81 
 
 		 480 aa  50.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1581  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.6 
 
 		 475 aa  50.4  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10231  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  22.6 
 
 		 455 aa  50.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.1178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1440  pyridoxal-dependent decarboxylase  28 
 
 		 474 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.108677 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03552  Glutamate decarboxylase putative  25.74 
 
 		 544 aa  50.4  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3871  pyridoxal-dependent decarboxylase  22.22 
 
 		 480 aa  50.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5685  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  30.99 
 
 		 462 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.025144  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4221  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.85 
 
 		 488 aa  49.3  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488782 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1136  L-tyrosine decarboxylase  21.36 
 
 		 384 aa  49.7  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0981  Pyridoxal-dependent decarboxylase  24.91 
 
 		 541 aa  49.3  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0304  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.26 
 
 		 581 aa  49.3  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0782914 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3584  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.2 
 
 		 611 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1547  L-tyrosine decarboxylase  20.99 
 
 		 384 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.875736  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1867  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.16 
 
 		 498 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7120  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.91 
 
 		 466 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00363554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2555  decarboxylase, pyridoxal-dependent  22.02 
 
 		 484 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2702  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.62 
 
 		 463 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.146813  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2746  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.62 
 
 		 463 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2115  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  24.68 
 
 		 489 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0411  Pyridoxal-dependent decarboxylase  25.51 
 
 		 450 aa  48.5  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2389  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0821  L-tyrosine decarboxylase  20.99 
 
 		 384 aa  48.5  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.750414  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2249  Pyridoxal-dependent decarboxylase  23.96 
 
 		 471 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1126  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  26.07 
 
 		 471 aa  47.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0279279 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5531  putative pyridoxal-dependent decarboxylase  27.21 
 
 		 502 aa  47.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245703 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0606  non-ribosomal peptide synthetase module-containing protein  23.11 
 
 		 462 aa  46.6  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4055  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.88 
 
 		 554 aa  46.6  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.505018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2732  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.24 
 
 		 463 aa  46.6  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.238333 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>