94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0354 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0354  Pyridoxal-dependent decarboxylase  100 
 
 		 448 aa  929    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0272  glutamate decarboxylase  64.38 
 
 		 456 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0827  glutamate decarboxylase  28.85 
 
 		 592 aa  200  5e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_2217  predicted protein  28.71 
 
 		 364 aa  139  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02100  histidine decarboxylase  27.92 
 
 		 386 aa  137  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1637  histidine decarboxylase  28.87 
 
 		 383 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3028  histidine decarboxylase  25.71 
 
 		 398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.726503  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1261  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  26.62 
 
 		 483 aa  71.2  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1124  aromatic amino acid decarboxylase, putative  28.41 
 
 		 491 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09431  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  24.72 
 
 		 461 aa  67  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09421  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  24.72 
 
 		 461 aa  67  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16491  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  28.82 
 
 		 470 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.360036 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10001  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  24.36 
 
 		 460 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.450995  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1848  L-tyrosine decarboxylase  24.67 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1545  L-tyrosine decarboxylase  23.08 
 
 		 365 aa  64.3  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0671702  hitchhiker  0.0000867545 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2310  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  26.24 
 
 		 489 aa  63.9  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.506086  normal  0.726788 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2916  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  26.16 
 
 		 510 aa  63.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122607 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2611  L-tyrosine decarboxylase  22.46 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2080  L-tyrosine decarboxylase  21.81 
 
 		 363 aa  62  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1282  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.88 
 
 		 477 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1008  L-tyrosine decarboxylase  20.25 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.461391  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1436  Pyridoxal-dependent decarboxylase  20.7 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.687898  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2166  L-tyrosine decarboxylase  24.14 
 
 		 365 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36228  predicted protein  21.58 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0883  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  21.53 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.354437  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1807  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.65 
 
 		 789 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000170312  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1305  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.36 
 
 		 480 aa  57  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1769  glutamate decarboxylase, putative  27.78 
 
 		 533 aa  55.8  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02632  glutamate decarboxylase  25.33 
 
 		 548 aa  55.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0460  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.96 
 
 		 552 aa  55.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2780  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.56 
 
 		 550 aa  54.3  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.300778 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0934  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.24 
 
 		 466 aa  54.3  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000218274  decreased coverage  0.000132275 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0977  L-tyrosine decarboxylase  21.37 
 
 		 395 aa  53.9  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10619  glutamate decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11120)  27.78 
 
 		 577 aa  53.5  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0303168  normal  0.118033 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2115  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  27.44 
 
 		 489 aa  53.5  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1039  Pyridoxal-dependent decarboxylase  22.08 
 
 		 412 aa  53.1  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2555  decarboxylase, pyridoxal-dependent  23.19 
 
 		 484 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100435 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2686  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.83 
 
 		 549 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.555524 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3135  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.99 
 
 		 551 aa  52.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0142161 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2588  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.83 
 
 		 549 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2520  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.83 
 
 		 549 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.212789 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2535  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.95 
 
 		 546 aa  52.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0114  Pyridoxal-dependent decarboxylase  24.04 
 
 		 480 aa  52.8  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15522  normal  0.0242531 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1624  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.72 
 
 		 552 aa  53.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1007  putative decarboxylase  25.58 
 
 		 543 aa  52.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2157  pyridoxal-dependent decarboxylase  23.4 
 
 		 479 aa  52.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10231  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  22.43 
 
 		 455 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.1178 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1200  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.55 
 
 		 560 aa  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003759  glutamate decarboxylase eukaryotic type  26.34 
 
 		 548 aa  52.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2715  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.69 
 
 		 548 aa  51.6  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.288765  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0304  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.12 
 
 		 581 aa  51.6  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0782914 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1569  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.35 
 
 		 549 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0606  non-ribosomal peptide synthetase module-containing protein  22.94 
 
 		 462 aa  50.8  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2983  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  26.53 
 
 		 496 aa  51.2  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2774  Pyridoxal-dependent decarboxylase  25.35 
 
 		 549 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267346 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2734  decarboxylase, pyridoxal-dependent  22.91 
 
 		 484 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08514e-18 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1707  group II decarboxylase  28.15 
 
 		 552 aa  50.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0663746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2724  decarboxylase, pyridoxal-dependent  22.91 
 
 		 484 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1636  L-tyrosine decarboxylase  22.37 
 
 		 384 aa  50.8  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1574  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.35 
 
 		 549 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2539  decarboxylase, pyridoxal-dependent  22.91 
 
 		 484 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1738  Pyridoxal-dependent decarboxylase  25 
 
 		 474 aa  50.1  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3871  pyridoxal-dependent decarboxylase  23.08 
 
 		 480 aa  49.7  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4065  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.88 
 
 		 529 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.125159  normal  0.183613 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1644  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.3 
 
 		 550 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4283  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.4 
 
 		 486 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2138  putative diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  23.76 
 
 		 967 aa  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00227594  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1469  pyridoxal-dependent decarboxylase  25 
 
 		 549 aa  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.899491  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1603  pyridoxal-dependent decarboxylase  25 
 
 		 549 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00702468  normal  0.288093 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3584  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.06 
 
 		 611 aa  47.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2007  pyridoxal-dependent decarboxylase  20.85 
 
 		 403 aa  47.8  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0178  Pyridoxal-dependent decarboxylase  24.45 
 
 		 462 aa  47.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2434  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.76 
 
 		 554 aa  47.4  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6192  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.25 
 
 		 492 aa  47  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.478239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0883  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  27.41 
 
 		 486 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1171  pyridoxal-dependent decarboxylase  22.97 
 
 		 475 aa  46.6  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0333328 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3459  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.83 
 
 		 511 aa  46.6  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0831  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.72 
 
 		 573 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00169678  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0909  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  27.41 
 
 		 486 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7120  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.38 
 
 		 466 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00363554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2558  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.67 
 
 		 467 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2599  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.24 
 
 		 365 aa  45.8  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1074  Pyridoxal-dependent decarboxylase  25.68 
 
 		 551 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.433316 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1055  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.28 
 
 		 530 aa  45.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4221  pyridoxal-dependent decarboxylase  22.73 
 
 		 488 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488782 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2249  Pyridoxal-dependent decarboxylase  24.75 
 
 		 471 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4423  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.68 
 
 		 473 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.904496 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03552  Glutamate decarboxylase putative  25.81 
 
 		 544 aa  45.8  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2740  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.58 
 
 		 530 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.14205  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1209  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  25.19 
 
 		 469 aa  44.7  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0411  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.74 
 
 		 450 aa  44.7  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2389  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1168  Pyridoxal-dependent decarboxylase  23.49 
 
 		 482 aa  44.3  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2032  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.91 
 
 		 547 aa  44.7  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0351867  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2531  Pyridoxal-dependent decarboxylase  29.52 
 
 		 460 aa  44.3  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00114613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>