181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5487 on replicon NC_010180
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010180  BcerKBAB4_5487  pyridoxal-dependent decarboxylase  100 
 
 
550 aa  1142    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108585 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2806  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  30.6 
 
 
560 aa  203  5e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0961  decarboxylase, group II  30 
 
 
557 aa  167  6.9999999999999995e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000836659  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1181  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.63 
 
 
464 aa  120  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.823264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2925  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.97 
 
 
470 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2418  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.89 
 
 
490 aa  97.1  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000894226  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0134  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  27.27 
 
 
515 aa  96.3  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55334  glutamate decarboxylase 2  28.31 
 
 
507 aa  95.5  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1514  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.32 
 
 
467 aa  94  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2714  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.27 
 
 
488 aa  93.6  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216735  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1282  pyridoxal-dependent decarboxylase  23.63 
 
 
477 aa  92  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0060  Pyridoxal-dependent decarboxylase  24.68 
 
 
465 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.474391 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0931  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.74 
 
 
567 aa  92.8  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10001  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  26.64 
 
 
460 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.450995  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0883  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  24.23 
 
 
461 aa  91.3  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.354437  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4339  Pyridoxal-dependent decarboxylase  23.82 
 
 
517 aa  91.3  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.843861  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2531  Pyridoxal-dependent decarboxylase  23.63 
 
 
460 aa  90.9  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00114613  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09421  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  23.87 
 
 
461 aa  90.9  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1807  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.21 
 
 
789 aa  90.5  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000170312  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2032  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.06 
 
 
547 aa  90.5  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0351867  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2354  Pyridoxal-dependent decarboxylase  25.58 
 
 
495 aa  89.7  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0161317  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2059  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.82 
 
 
495 aa  89  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00190827  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1007  putative decarboxylase  25.51 
 
 
543 aa  88.2  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4221  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.07 
 
 
488 aa  87  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.488782 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1644  pyridoxal-dependent decarboxylase  25 
 
 
550 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0719  putative glutamate decarboxylase  25 
 
 
548 aa  84.7  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7120  pyridoxal-dependent decarboxylase  25 
 
 
466 aa  84.3  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00363554  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1707  group II decarboxylase  24.81 
 
 
552 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0663746  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2835  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.78 
 
 
507 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.579316  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2838  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  27.01 
 
 
522 aa  82.4  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0758155  normal  0.28501 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4944  Pyridoxal-dependent decarboxylase  23.43 
 
 
486 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.326969  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1171  pyridoxal-dependent decarboxylase  22.93 
 
 
475 aa  82.4  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0333328 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09431  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  23.91 
 
 
461 aa  82  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1177  hypothetical protein  23.87 
 
 
474 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2949  pyridoxal-dependent decarboxylase  23.81 
 
 
502 aa  81.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442662  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003759  glutamate decarboxylase eukaryotic type  22.71 
 
 
548 aa  80.9  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0927  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  24.27 
 
 
511 aa  80.9  0.00000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0959  Pyridoxal-dependent decarboxylase  24.69 
 
 
538 aa  80.5  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3049  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.57 
 
 
471 aa  79  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0144  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  24.36 
 
 
456 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2310  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  23.13 
 
 
489 aa  79.3  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.506086  normal  0.726788 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2160  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  23.37 
 
 
479 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222222  normal  0.771411 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07761  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  24.36 
 
 
456 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0845725  normal  0.0349206 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16491  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  22.95 
 
 
470 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.360036 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2413  Pyridoxal-dependent decarboxylase  23.59 
 
 
459 aa  79  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1261  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  21.63 
 
 
483 aa  78.6  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0606  non-ribosomal peptide synthetase module-containing protein  21.61 
 
 
462 aa  78.6  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02632  glutamate decarboxylase  23.93 
 
 
548 aa  77  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2080  L-tyrosine decarboxylase  26.19 
 
 
363 aa  76.6  0.0000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0934  pyridoxal-dependent decarboxylase  23.71 
 
 
466 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000218274  decreased coverage  0.000132275 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0285  pyridoxal-dependent decarboxylase  22.66 
 
 
529 aa  76.6  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3171  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.63 
 
 
505 aa  76.3  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.902274  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2033  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.19 
 
 
490 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376208  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1241  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.76 
 
 
466 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3584  pyridoxal-dependent decarboxylase  23.7 
 
 
611 aa  75.5  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1469  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.9 
 
 
549 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.899491  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1957  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  24.04 
 
 
476 aa  74.7  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36228  predicted protein  26.57 
 
 
453 aa  74.3  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1074  Pyridoxal-dependent decarboxylase  22.56 
 
 
551 aa  73.6  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.433316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1238  Pyridoxal-dependent decarboxylase  23.43 
 
 
486 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3338  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  23.91 
 
 
492 aa  72.8  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133892  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4295  Pyridoxal-dependent decarboxylase  23.08 
 
 
508 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243421 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5531  putative pyridoxal-dependent decarboxylase  22.04 
 
 
502 aa  73.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245703 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1769  glutamate decarboxylase, putative  22.73 
 
 
533 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0743  pyridoxal-dependent decarboxylase  23.95 
 
 
489 aa  72  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0590  putative L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  24.84 
 
 
484 aa  72  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.126403  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04970  decarboxylase, pyridoxal-dependent  25.43 
 
 
479 aa  71.6  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.421495  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0909  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  23.1 
 
 
486 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1200  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.64 
 
 
560 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0883  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  23.71 
 
 
486 aa  70.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2266  Pyridoxal-dependent decarboxylase  24.3 
 
 
517 aa  70.9  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.981708  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10619  glutamate decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11120)  22.19 
 
 
577 aa  70.5  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0303168  normal  0.118033 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2157  pyridoxal-dependent decarboxylase  22.59 
 
 
479 aa  70.5  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1581  Pyridoxal-dependent decarboxylase  24.6 
 
 
475 aa  70.5  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2520  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.88 
 
 
549 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.212789 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1232  aminotransferase, class III/decarboxylase, group II  22.5 
 
 
961 aa  70.1  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000122861  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2715  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.62 
 
 
548 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.288765  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0661  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.13 
 
 
484 aa  69.7  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000151703  normal  0.871149 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2588  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.49 
 
 
549 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2686  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.88 
 
 
549 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.555524 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2288  pyridoxal-dependent decarboxylase  23.4 
 
 
494 aa  70.1  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.715836  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2434  pyridoxal-dependent decarboxylase  23.71 
 
 
554 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1055  pyridoxal-dependent decarboxylase  22.68 
 
 
530 aa  68.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0981  Pyridoxal-dependent decarboxylase  25 
 
 
541 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2774  Pyridoxal-dependent decarboxylase  23.69 
 
 
549 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267346 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4871  pyridoxal-dependent decarboxylase  21.39 
 
 
486 aa  68.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1051  hypothetical protein  21.93 
 
 
636 aa  67.8  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.922424  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1574  pyridoxal-dependent decarboxylase  23.69 
 
 
549 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1102  pyridoxal-dependent decarboxylase  21.55 
 
 
492 aa  67.8  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.967255  normal  0.206901 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1569  pyridoxal-dependent decarboxylase  23.69 
 
 
549 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4283  pyridoxal-dependent decarboxylase  22.26 
 
 
486 aa  67.4  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2780  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.9 
 
 
550 aa  67  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.300778 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1603  pyridoxal-dependent decarboxylase  23.69 
 
 
549 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00702468  normal  0.288093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0093  group II decarboxylase family protein  28.9 
 
 
731 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1624  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.43 
 
 
552 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3190  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  24.46 
 
 
515 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.399603  normal  0.0148161 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2740  pyridoxal-dependent decarboxylase  22.26 
 
 
530 aa  65.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.14205  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2448  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  24.86 
 
 
515 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2711  pyridoxal-dependent decarboxylase  22.79 
 
 
443 aa  65.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.434968  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2547  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.46 
 
 
515 aa  65.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>