217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1514 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1514  pyridoxal-dependent decarboxylase  100 
 
 
467 aa  957    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0060  Pyridoxal-dependent decarboxylase  58.58 
 
 
465 aa  572  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.474391 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1181  Pyridoxal-dependent decarboxylase  56.59 
 
 
464 aa  532  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.823264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2925  Pyridoxal-dependent decarboxylase  50.56 
 
 
470 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1241  pyridoxal-dependent decarboxylase  44.64 
 
 
466 aa  422  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3049  pyridoxal-dependent decarboxylase  44.51 
 
 
471 aa  398  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2413  Pyridoxal-dependent decarboxylase  42.58 
 
 
459 aa  399  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2531  Pyridoxal-dependent decarboxylase  42.74 
 
 
460 aa  392  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00114613  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7120  pyridoxal-dependent decarboxylase  41.68 
 
 
466 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00363554  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1440  pyridoxal-dependent decarboxylase  37.87 
 
 
474 aa  257  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.108677 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2266  Pyridoxal-dependent decarboxylase  32.78 
 
 
517 aa  253  6e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.981708  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02091  tyrosine decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04980)  34.08 
 
 
508 aa  203  5e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4871  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.68 
 
 
486 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3871  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.81 
 
 
480 aa  195  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5531  putative pyridoxal-dependent decarboxylase  30.57 
 
 
502 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245703 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2916  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  28.31 
 
 
510 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122607 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1102  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.34 
 
 
492 aa  187  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.967255  normal  0.206901 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1334  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.27 
 
 
497 aa  186  7e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2249  Pyridoxal-dependent decarboxylase  32.42 
 
 
471 aa  186  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198283  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5923  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.93 
 
 
483 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal  0.358507 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2115  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  28.88 
 
 
489 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3740  Pyridoxal-dependent decarboxylase  30.13 
 
 
455 aa  182  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0339785 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3271  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.64 
 
 
450 aa  182  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5130  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.64 
 
 
450 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.768223 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4423  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.23 
 
 
473 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.904496 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0114  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.43 
 
 
480 aa  180  4.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15522  normal  0.0242531 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2702  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.07 
 
 
463 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.146813  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2746  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.07 
 
 
463 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2558  Pyridoxal-dependent decarboxylase  30.67 
 
 
467 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2732  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.21 
 
 
463 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.238333 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4823  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.9 
 
 
450 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3343  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.9 
 
 
450 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.748078  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4172  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.9 
 
 
450 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1421  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.65 
 
 
463 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000571165 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0178  Pyridoxal-dependent decarboxylase  31.46 
 
 
462 aa  176  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4283  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.29 
 
 
486 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1124  aromatic amino acid decarboxylase, putative  27.2 
 
 
491 aa  173  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0934  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.16 
 
 
466 aa  172  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000218274  decreased coverage  0.000132275 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4944  Pyridoxal-dependent decarboxylase  29.02 
 
 
486 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.326969  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4339  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.96 
 
 
517 aa  170  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.843861  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1282  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.04 
 
 
477 aa  170  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2555  decarboxylase, pyridoxal-dependent  28.4 
 
 
484 aa  170  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100435 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0354  Pyridoxal-dependent decarboxylase  30.88 
 
 
450 aa  168  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2539  decarboxylase, pyridoxal-dependent  28.94 
 
 
484 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2724  decarboxylase, pyridoxal-dependent  28.94 
 
 
484 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1409  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.43 
 
 
474 aa  167  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2734  decarboxylase, pyridoxal-dependent  28.94 
 
 
484 aa  167  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08514e-18 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1168  Pyridoxal-dependent decarboxylase  30.13 
 
 
482 aa  166  8e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0411  Pyridoxal-dependent decarboxylase  31.12 
 
 
450 aa  166  9e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2389  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2911  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.19 
 
 
450 aa  163  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4177  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.98 
 
 
484 aa  163  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.51833  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2377  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.37 
 
 
518 aa  162  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4065  Pyridoxal-dependent decarboxylase  25.05 
 
 
529 aa  153  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.125159  normal  0.183613 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0076  Pyridoxal-dependent decarboxylase  29.22 
 
 
458 aa  152  1e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04970  decarboxylase, pyridoxal-dependent  27.7 
 
 
479 aa  151  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.421495  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2867  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.81 
 
 
529 aa  150  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121962  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6911  Pyridoxal-dependent decarboxylase  29.56 
 
 
451 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.414893 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2157  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.7 
 
 
479 aa  149  7e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2955  putative pyridoxal-dependent decarboxylase  29.53 
 
 
450 aa  149  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1738  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.06 
 
 
474 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2714  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.83 
 
 
488 aa  143  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216735  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2418  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.41 
 
 
490 aa  143  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000894226  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2310  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  27.54 
 
 
489 aa  141  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.506086  normal  0.726788 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2354  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.13 
 
 
495 aa  139  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0161317  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1305  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.67 
 
 
480 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2059  Pyridoxal-dependent decarboxylase  25.9 
 
 
495 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00190827  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1038  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  27.21 
 
 
483 aa  136  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3330  Pyridoxal-dependent decarboxylase  25.17 
 
 
503 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.405304  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2983  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  24.38 
 
 
496 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2160  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  26.32 
 
 
479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222222  normal  0.771411 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0590  putative L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  25.94 
 
 
484 aa  130  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.126403  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0071  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  23.99 
 
 
474 aa  129  8.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.621553  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3338  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  27.48 
 
 
492 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133892  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2647  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.88 
 
 
478 aa  127  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.88616  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2288  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.81 
 
 
494 aa  126  7e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.715836  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1832  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.21 
 
 
475 aa  126  9e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.536749  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0909  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  24.59 
 
 
486 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0883  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  24.36 
 
 
486 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4221  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.4 
 
 
488 aa  125  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.488782 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2788  aromatic amino acid decarboxylase  25.62 
 
 
471 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3364  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  25.64 
 
 
470 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2867  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  25.62 
 
 
471 aa  124  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0959  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.03 
 
 
538 aa  123  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1334  aromatic amino acid decarboxylase  25.06 
 
 
471 aa  123  8e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3466  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  25.17 
 
 
470 aa  122  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.811665  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6192  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.7 
 
 
492 aa  121  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.478239  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2838  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  25.97 
 
 
522 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0758155  normal  0.28501 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3163  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  25.18 
 
 
478 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.491116  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1126  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  23.57 
 
 
471 aa  120  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0279279 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0214  Pyridoxal-dependent decarboxylase  24.62 
 
 
527 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2552  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  25.18 
 
 
470 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00803752 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3501  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.17 
 
 
464 aa  118  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00371632 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4529  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.29 
 
 
350 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03010  PLP-dependent enzyme, glutamate decarboxylase  26.53 
 
 
442 aa  117  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3209  Pyridoxal-dependent decarboxylase  25.31 
 
 
579 aa  117  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2715  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.91 
 
 
548 aa  117  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.288765  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003101  diaminobutyrate-pyruvate transaminase/L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  26.56 
 
 
958 aa  117  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0285  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.87 
 
 
529 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1644  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.57 
 
 
550 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2223  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  25.98 
 
 
470 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0898505  normal  0.960692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>