153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0093 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0093  group II decarboxylase family protein  100 
 
 		 731 aa  1519    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2260  group II decarboxylase family protein  44.31 
 
 		 775 aa  612  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140387 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0951  peptidase S10, serine carboxypeptidase  38.64 
 
 		 1193 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0404073  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1051  hypothetical protein  31.91 
 
 		 636 aa  288  2e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.922424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0304  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.66 
 
 		 581 aa  209  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0782914 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0460  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.53 
 
 		 552 aa  108  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362513  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1707  group II decarboxylase  31.72 
 
 		 552 aa  103  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0663746  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1624  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.45 
 
 		 552 aa  103  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1644  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.14 
 
 		 550 aa  103  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2686  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.26 
 
 		 549 aa  103  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.555524 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2520  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.57 
 
 		 549 aa  103  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.212789 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0981  Pyridoxal-dependent decarboxylase  25.32 
 
 		 541 aa  103  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2588  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.18 
 
 		 549 aa  102  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0931  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.53 
 
 		 567 aa  101  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0959  Pyridoxal-dependent decarboxylase  30.67 
 
 		 538 aa  100  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1007  putative decarboxylase  28.94 
 
 		 543 aa  99.4  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1469  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.15 
 
 		 549 aa  98.6  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.899491  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3135  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.43 
 
 		 551 aa  98.2  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0142161 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2643  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.95 
 
 		 546 aa  96.7  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.160588  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2535  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.42 
 
 		 546 aa  97.1  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0831  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.07 
 
 		 573 aa  97.1  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00169678  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1769  glutamate decarboxylase, putative  28.97 
 
 		 533 aa  95.5  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2715  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.34 
 
 		 548 aa  95.9  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.288765  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1200  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.43 
 
 		 560 aa  94.4  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2434  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.84 
 
 		 554 aa  93.2  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2774  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.57 
 
 		 549 aa  93.6  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267346 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1574  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.57 
 
 		 549 aa  93.6  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1569  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.6 
 
 		 549 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2780  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.91 
 
 		 550 aa  93.2  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.300778 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1603  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.6 
 
 		 549 aa  91.7  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00702468  normal  0.288093 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3584  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.92 
 
 		 611 aa  90.5  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02632  glutamate decarboxylase  29.52 
 
 		 548 aa  88.2  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003759  glutamate decarboxylase eukaryotic type  29.02 
 
 		 548 aa  87.8  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0719  putative glutamate decarboxylase  29.23 
 
 		 548 aa  87.4  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2032  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.77 
 
 		 547 aa  87  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0351867  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3931  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.87 
 
 		 536 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1581  Pyridoxal-dependent decarboxylase  30.25 
 
 		 475 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03552  Glutamate decarboxylase putative  30.87 
 
 		 544 aa  77.4  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1436  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.51 
 
 		 374 aa  77.4  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.687898  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4546  pyridoxal-dependent decarboxylase conserved domain protein  30.09 
 
 		 472 aa  77  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0851794  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6749  Pyridoxal-dependent decarboxylase  24.83 
 
 		 574 aa  77  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1807  Pyridoxal-dependent decarboxylase  25.53 
 
 		 789 aa  74.7  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000170312  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2916  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  27.27 
 
 		 510 aa  71.6  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122607 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2418  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.37 
 
 		 490 aa  70.9  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000894226  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0934  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.29 
 
 		 466 aa  70.5  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000218274  decreased coverage  0.000132275 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09431  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  26 
 
 		 461 aa  70.1  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09421  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  26.24 
 
 		 461 aa  70.1  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2033  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.81 
 
 		 490 aa  69.3  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5487  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.38 
 
 		 550 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108585 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2806  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  28.02 
 
 		 560 aa  68.2  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0883  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  25.87 
 
 		 461 aa  68.2  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.354437  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4339  Pyridoxal-dependent decarboxylase  24.72 
 
 		 517 aa  67.8  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.843861  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2059  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.24 
 
 		 495 aa  67.8  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00190827  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2354  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.24 
 
 		 495 aa  67.8  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0161317  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2080  L-tyrosine decarboxylase  25.7 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2714  pyridoxal-dependent decarboxylase  25 
 
 		 488 aa  67  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1124  aromatic amino acid decarboxylase, putative  29.8 
 
 		 491 aa  66.6  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1055  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.68 
 
 		 530 aa  66.6  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1636  L-tyrosine decarboxylase  27.7 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0805  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.62 
 
 		 361 aa  65.5  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55334  glutamate decarboxylase 2  23.37 
 
 		 507 aa  65.9  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0961  decarboxylase, group II  26.2 
 
 		 557 aa  65.9  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000836659  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1848  L-tyrosine decarboxylase  25.68 
 
 		 365 aa  64.7  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2949  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.18 
 
 		 502 aa  64.7  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442662  normal  0.020472 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10619  glutamate decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11120)  27.74 
 
 		 577 aa  64.3  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0303168  normal  0.118033 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1039  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.3 
 
 		 412 aa  63.9  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2310  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  22.97 
 
 		 489 aa  63.5  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.506086  normal  0.726788 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2599  Pyridoxal-dependent decarboxylase  25.97 
 
 		 365 aa  63.9  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0144  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  27 
 
 		 456 aa  62.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1261  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  26.52 
 
 		 483 aa  62.8  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07761  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  27 
 
 		 456 aa  62.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0845725  normal  0.0349206 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1732  L-tyrosine decarboxylase  23.33 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2925  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.24 
 
 		 470 aa  61.6  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0285  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.27 
 
 		 529 aa  61.6  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3338  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  25.62 
 
 		 492 aa  61.6  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1008  L-tyrosine decarboxylase  21.83 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.461391  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2551  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.88 
 
 		 534 aa  61.6  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.547739 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2007  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.64 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2555  decarboxylase, pyridoxal-dependent  24.14 
 
 		 484 aa  60.8  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100435 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3171  pyridoxal-dependent decarboxylase  22.16 
 
 		 505 aa  60.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.902274  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1130  L-tyrosine decarboxylase  21.4 
 
 		 384 aa  60.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2115  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  27.89 
 
 		 489 aa  59.7  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10001  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  26 
 
 		 460 aa  59.3  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.450995  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5531  putative pyridoxal-dependent decarboxylase  27.12 
 
 		 502 aa  60.1  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245703 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1136  L-tyrosine decarboxylase  22.27 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1867  pyridoxal-dependent decarboxylase  23.31 
 
 		 498 aa  60.1  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2539  decarboxylase, pyridoxal-dependent  22.99 
 
 		 484 aa  58.9  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2724  decarboxylase, pyridoxal-dependent  22.99 
 
 		 484 aa  58.9  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2734  decarboxylase, pyridoxal-dependent  22.99 
 
 		 484 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08514e-18 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0661  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.01 
 
 		 484 aa  58.9  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000151703  normal  0.871149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1282  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.87 
 
 		 477 aa  58.2  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2166  L-tyrosine decarboxylase  24.7 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2983  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  26.97 
 
 		 496 aa  58.2  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0134  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  24.1 
 
 		 515 aa  58.2  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2288  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.87 
 
 		 494 aa  57  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.715836  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0196  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.59 
 
 		 484 aa  57  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.6927  normal  0.0347054 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2835  Pyridoxal-dependent decarboxylase  24.74 
 
 		 507 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.579316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1545  L-tyrosine decarboxylase  23.89 
 
 		 365 aa  56.6  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0671702  hitchhiker  0.0000867545 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4065  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.08 
 
 		 529 aa  56.6  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.125159  normal  0.183613 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16491  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  36.89 
 
 		 470 aa  56.6  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.360036 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>