194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0951 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0951  peptidase S10, serine carboxypeptidase  100 
 
 		 1193 aa  2495    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0404073  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0093  group II decarboxylase family protein  38.64 
 
 		 731 aa  479  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2260  group II decarboxylase family protein  37.6 
 
 		 775 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140387 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1051  hypothetical protein  31.71 
 
 		 636 aa  263  2e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.922424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0304  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.57 
 
 		 581 aa  179  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0782914 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10184  Carboxypeptidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7SI81]  29.93 
 
 		 631 aa  176  3.9999999999999995e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36810  predicted protein  29.12 
 
 		 457 aa  167  8e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.820131 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_1391  predicted protein  29.75 
 
 		 456 aa  164  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0738699  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78088  carboxypeptidase B-like processing protease  28.06 
 
 		 693 aa  161  5e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05442  CarboxypeptidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96VC4]  27.4 
 
 		 552 aa  154  8.999999999999999e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.13822 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28244  predicted protein  26.27 
 
 		 526 aa  154  1e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.719833 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18551  predicted protein  28.44 
 
 		 471 aa  151  6e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.507401  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16850  predicted protein  28.08 
 
 		 383 aa  151  7e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00275029  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11204  predicted protein  26.09 
 
 		 419 aa  142  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38351  carboxypeptidase C  28.94 
 
 		 502 aa  142  4.999999999999999e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.109115 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45960  predicted protein  26.98 
 
 		 555 aa  138  5e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00660  KEX1 protein precursor, putative  26.81 
 
 		 666 aa  138  6.0000000000000005e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02200  hypothetical protein  27.4 
 
 		 520 aa  135  6.999999999999999e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31676  predicted protein  27.25 
 
 		 449 aa  131  7.000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.499026  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03760  carboxypeptidase C, putative  28.1 
 
 		 539 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1469  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.5 
 
 		 549 aa  112  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.899491  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05760  carboxypeptidase D, putative  26.1 
 
 		 553 aa  111  7.000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2774  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.51 
 
 		 549 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267346 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1569  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.65 
 
 		 549 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39506  predicted protein  34.69 
 
 		 264 aa  110  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.404792  normal  0.321061 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22901  predicted protein  34.83 
 
 		 528 aa  109  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1574  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.51 
 
 		 549 aa  109  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2032  pyridoxal-dependent decarboxylase  28 
 
 		 547 aa  107  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0351867  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1769  glutamate decarboxylase, putative  28.82 
 
 		 533 aa  105  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2520  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.33 
 
 		 549 aa  105  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.212789 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2686  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.33 
 
 		 549 aa  105  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.555524 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2643  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.86 
 
 		 546 aa  105  8e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.160588  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2588  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.89 
 
 		 549 aa  104  9e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1603  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.18 
 
 		 549 aa  104  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00702468  normal  0.288093 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003759  glutamate decarboxylase eukaryotic type  28.83 
 
 		 548 aa  103  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0460  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.89 
 
 		 552 aa  102  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362513  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1007  putative decarboxylase  27.92 
 
 		 543 aa  100  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1624  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.57 
 
 		 552 aa  100  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1200  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.47 
 
 		 560 aa  100  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2535  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.31 
 
 		 546 aa  100  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02555  serine carboxypeptidase (Eurofung)  38.41 
 
 		 541 aa  100  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.974236 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02237  carboxypeptidase S1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07330)  24.84 
 
 		 637 aa  99.8  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0269306 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2780  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.92 
 
 		 550 aa  99.4  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.300778 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02632  glutamate decarboxylase  27.63 
 
 		 548 aa  98.2  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0719  putative glutamate decarboxylase  28.4 
 
 		 548 aa  97.8  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00600  carboxypeptidase D, putative  40.88 
 
 		 548 aa  97.4  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0283026  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3584  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.06 
 
 		 611 aa  96.7  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2715  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.66 
 
 		 548 aa  96.7  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.288765  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01720  carboxypeptidase D, putative  38.04 
 
 		 543 aa  96.3  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0959  Pyridoxal-dependent decarboxylase  29.05 
 
 		 538 aa  95.5  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3135  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.93 
 
 		 551 aa  95.5  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0142161 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0931  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.27 
 
 		 567 aa  94  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1707  group II decarboxylase  31.13 
 
 		 552 aa  92  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0663746  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1644  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.81 
 
 		 550 aa  91.7  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2434  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.07 
 
 		 554 aa  90.9  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01426  hypothetical serine carboxypeptidase (Eurofung)  25.05 
 
 		 556 aa  90.5  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.438767  normal  0.278092 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0831  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.05 
 
 		 573 aa  90.1  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00169678  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0981  Pyridoxal-dependent decarboxylase  25.75 
 
 		 541 aa  89.4  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4546  pyridoxal-dependent decarboxylase conserved domain protein  38.79 
 
 		 472 aa  84.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0851794  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1136  L-tyrosine decarboxylase  25.62 
 
 		 384 aa  83.2  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6749  Pyridoxal-dependent decarboxylase  24.89 
 
 		 574 aa  83.2  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2714  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.77 
 
 		 488 aa  79.3  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1130  L-tyrosine decarboxylase  25.75 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1581  Pyridoxal-dependent decarboxylase  25.21 
 
 		 475 aa  77.8  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1008  L-tyrosine decarboxylase  25.86 
 
 		 390 aa  77  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.461391  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2448  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  27.27 
 
 		 515 aa  77  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3190  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  27.27 
 
 		 515 aa  76.3  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.399603  normal  0.0148161 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1547  L-tyrosine decarboxylase  26.17 
 
 		 384 aa  76.3  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.875736  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2418  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.13 
 
 		 490 aa  75.1  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000894226  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2059  Pyridoxal-dependent decarboxylase  25.23 
 
 		 495 aa  74.7  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00190827  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2354  Pyridoxal-dependent decarboxylase  25.23 
 
 		 495 aa  74.3  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0161317  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0285  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.63 
 
 		 529 aa  74.3  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2547  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.74 
 
 		 515 aa  74.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3931  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.14 
 
 		 536 aa  73.2  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0927  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  26.13 
 
 		 511 aa  73.6  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0821  L-tyrosine decarboxylase  25.32 
 
 		 384 aa  73.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.750414  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2080  L-tyrosine decarboxylase  26.67 
 
 		 363 aa  73.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03552  Glutamate decarboxylase putative  26.77 
 
 		 544 aa  73.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0134  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  26.36 
 
 		 515 aa  71.2  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0590  putative L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  28.64 
 
 		 484 aa  71.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.126403  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1074  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.7 
 
 		 551 aa  70.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.433316 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0977  L-tyrosine decarboxylase  24.71 
 
 		 395 aa  70.5  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2033  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.36 
 
 		 490 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1545  L-tyrosine decarboxylase  26.16 
 
 		 365 aa  70.1  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0671702  hitchhiker  0.0000867545 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3171  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.18 
 
 		 505 aa  69.7  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.902274  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09421  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  25.79 
 
 		 461 aa  68.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2740  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.18 
 
 		 530 aa  68.6  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.14205  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0883  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  26.13 
 
 		 461 aa  67.8  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.354437  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1055  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.42 
 
 		 530 aa  68.2  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4339  Pyridoxal-dependent decarboxylase  22.87 
 
 		 517 aa  68.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.843861  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4221  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.08 
 
 		 488 aa  68.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488782 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2599  Pyridoxal-dependent decarboxylase  29.03 
 
 		 365 aa  66.6  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3330  Pyridoxal-dependent decarboxylase  24.2 
 
 		 503 aa  67  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.405304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1848  L-tyrosine decarboxylase  28.77 
 
 		 365 aa  67  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2551  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.65 
 
 		 534 aa  67  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.547739 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09431  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  25.23 
 
 		 461 aa  66.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03320  hypothetical protein  22.5 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0624249  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2138  putative diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  22.48 
 
 		 967 aa  63.5  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00227594  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0934  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.67 
 
 		 466 aa  63.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000218274  decreased coverage  0.000132275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4295  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.6 
 
 		 508 aa  63.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243421 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>