48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_38351 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_38351  carboxypeptidase C  100 
 
 
502 aa  1046    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.109115 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31676  predicted protein  58.92 
 
 
449 aa  549  1e-155  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.499026  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36810  predicted protein  57.73 
 
 
457 aa  517  1.0000000000000001e-145  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.820131 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05442  CarboxypeptidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96VC4]  52.81 
 
 
552 aa  493  9.999999999999999e-139  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.13822 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03760  carboxypeptidase C, putative  37.12 
 
 
539 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02200  hypothetical protein  38.75 
 
 
520 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11204  predicted protein  37.91 
 
 
419 aa  266  5.999999999999999e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28244  predicted protein  30.8 
 
 
526 aa  227  3e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.719833 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01426  hypothetical serine carboxypeptidase (Eurofung)  34.64 
 
 
556 aa  209  1e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.438767  normal  0.278092 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18551  predicted protein  28.83 
 
 
471 aa  184  3e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.507401  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10184  Carboxypeptidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7SI81]  30.02 
 
 
631 aa  171  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02237  carboxypeptidase S1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07330)  30.69 
 
 
637 aa  171  4e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0269306 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78088  carboxypeptidase B-like processing protease  29.48 
 
 
693 aa  168  2e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_1391  predicted protein  29 
 
 
456 aa  150  7e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0738699  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45960  predicted protein  27.95 
 
 
555 aa  148  2.0000000000000003e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00660  KEX1 protein precursor, putative  26.78 
 
 
666 aa  147  3e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0951  peptidase S10, serine carboxypeptidase  28.94 
 
 
1193 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0404073  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16850  predicted protein  27.21 
 
 
383 aa  135  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00275029  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22901  predicted protein  25.74 
 
 
528 aa  126  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39506  predicted protein  34.93 
 
 
264 aa  111  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.404792  normal  0.321061 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03320  hypothetical protein  23.08 
 
 
491 aa  103  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0624249  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02555  serine carboxypeptidase (Eurofung)  35.45 
 
 
541 aa  96.7  9e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.974236 
 
 
-
 
NC_006686  CND00600  carboxypeptidase D, putative  32.11 
 
 
548 aa  90.5  6e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0283026  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05760  carboxypeptidase D, putative  25.16 
 
 
553 aa  90.1  8e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01720  carboxypeptidase D, putative  30.29 
 
 
543 aa  87  7e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2090  peptidase S10 serine carboxypeptidase  26.94 
 
 
510 aa  53.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5563  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.14 
 
 
519 aa  52  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0684  peptidase S10 serine carboxypeptidase  25.62 
 
 
513 aa  52  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0948758  normal  0.0161354 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5407  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.14 
 
 
526 aa  50.4  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451508  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0347  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.37 
 
 
521 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272983  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3118  peptidase S10, serine carboxypeptidase  28.68 
 
 
522 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.226388  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2967  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.11 
 
 
517 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5174  putative peptidase S10, serine carboxypeptidase  30.53 
 
 
534 aa  48.5  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3773  peptidase S10, serine carboxypeptidase  28.21 
 
 
504 aa  47.8  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0440  peptidase S10, serine carboxypeptidase  28.46 
 
 
505 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.480832  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1122  peptidase S10, serine carboxypeptidase  28.99 
 
 
522 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0380  peptidase S10, serine carboxypeptidase  28.35 
 
 
573 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4619  peptidase S10 serine carboxypeptidase  27.69 
 
 
511 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2128  peptidase S10 serine carboxypeptidase  26.99 
 
 
514 aa  45.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000251865 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1930  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.28 
 
 
514 aa  45.1  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5118  peptidase S10 serine carboxypeptidase  28.38 
 
 
573 aa  45.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.302178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4319  peptidase S10, serine carboxypeptidase  27.38 
 
 
524 aa  45.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3304  peptidase S10 serine carboxypeptidase  29.03 
 
 
544 aa  44.3  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169507  normal  0.0135899 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5196  peptidase S10 serine carboxypeptidase  27.7 
 
 
573 aa  44.3  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.574018  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4655  peptidase S10 serine carboxypeptidase  27.7 
 
 
573 aa  44.3  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1207  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.83 
 
 
502 aa  43.9  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.34234  normal  0.567138 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2114  peptidase S10, serine carboxypeptidase  25.86 
 
 
514 aa  43.9  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000253475  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0813  peptidase S10 serine carboxypeptidase  28.57 
 
 
611 aa  43.5  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.473991  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>