141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4655 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_5196  peptidase S10 serine carboxypeptidase  91.3 
 
 		 573 aa  1039    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.574018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5118  peptidase S10 serine carboxypeptidase  98.43 
 
 		 573 aa  1132    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.302178 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5563  peptidase S10 serine carboxypeptidase  65.85 
 
 		 519 aa  644    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4655  peptidase S10 serine carboxypeptidase  100 
 
 		 573 aa  1151    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3109  peptidase S10 serine carboxypeptidase  69.92 
 
 		 530 aa  676    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5407  peptidase S10 serine carboxypeptidase  68.06 
 
 		 526 aa  646    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5174  putative peptidase S10, serine carboxypeptidase  49.8 
 
 		 534 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1930  peptidase S10 serine carboxypeptidase  50.86 
 
 		 514 aa  440  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3118  peptidase S10, serine carboxypeptidase  49.57 
 
 		 522 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.226388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1968  peptidase S10, serine carboxypeptidase  47.37 
 
 		 511 aa  425  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.960831  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2967  peptidase S10, serine carboxypeptidase  47.88 
 
 		 517 aa  412  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0440  peptidase S10, serine carboxypeptidase  47.76 
 
 		 505 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.480832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0347  peptidase S10 serine carboxypeptidase  45.98 
 
 		 521 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272983  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1122  peptidase S10, serine carboxypeptidase  46.63 
 
 		 522 aa  409  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1336  peptidase S10 serine carboxypeptidase  48.02 
 
 		 533 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0380  peptidase S10, serine carboxypeptidase  47.6 
 
 		 573 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1444  peptidase S10 serine carboxypeptidase  43.99 
 
 		 498 aa  382  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00886012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00179  serine carboxypeptidase  42.89 
 
 		 490 aa  370  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.520034  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0563  peptidase S10 serine carboxypeptidase  43.71 
 
 		 508 aa  361  3e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.854374  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0609  carboxypeptidase related protein  43.27 
 
 		 503 aa  356  5.999999999999999e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0684  peptidase S10 serine carboxypeptidase  39.53 
 
 		 513 aa  295  1e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0948758  normal  0.0161354 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4351  peptidase S10 serine carboxypeptidase  37.45 
 
 		 510 aa  287  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4619  peptidase S10 serine carboxypeptidase  40.26 
 
 		 511 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5433  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.76 
 
 		 590 aa  239  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.735441  normal  0.336053 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1174  putative carboxypeptidase-related protein  34.34 
 
 		 573 aa  232  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80381  normal  0.157618 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2090  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.68 
 
 		 510 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0601  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.66 
 
 		 492 aa  226  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.445118 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5055  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.65 
 
 		 554 aa  224  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.666059 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2114  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.79 
 
 		 514 aa  219  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000253475  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0812  serine-type carboxypeptidase family protein  34.42 
 
 		 554 aa  218  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3442  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.62 
 
 		 558 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1993  carboxypeptidase  34.08 
 
 		 551 aa  217  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.102988 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4779  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.67 
 
 		 553 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138285  hitchhiker  0.00136432 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1566  serine-type carboxypeptidase family protein  33.13 
 
 		 554 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0605  serine-type carboxypeptidase family protein  33.13 
 
 		 554 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3088  peptidase S10, serine carboxypeptidase  33.81 
 
 		 558 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816612  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5279  peptidase S10, serine carboxypeptidase  33.81 
 
 		 558 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2037  serine carboxypeptidase family protein  33.13 
 
 		 554 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.931228  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2200  serine carboxypeptidase family protein  33.13 
 
 		 554 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555603  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0716  serine carboxypeptidase family protein  33.13 
 
 		 554 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4989  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.81 
 
 		 558 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2113  serine carboxypeptidase family protein  33.13 
 
 		 554 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4319  peptidase S10, serine carboxypeptidase  33.61 
 
 		 524 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2128  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.36 
 
 		 514 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000251865 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0371  peptidase S10, serine carboxypeptidase  33.06 
 
 		 558 aa  213  9e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4003  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.45 
 
 		 561 aa  212  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4639  peptidase S10, serine carboxypeptidase  33.81 
 
 		 558 aa  211  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5168  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.99 
 
 		 558 aa  208  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.100052 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1758  putative carboxypeptidase  33.47 
 
 		 536 aa  207  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3773  peptidase S10, serine carboxypeptidase  33.62 
 
 		 504 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1207  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.14 
 
 		 502 aa  205  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.34234  normal  0.567138 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1195  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.55 
 
 		 490 aa  204  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4660  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.24 
 
 		 494 aa  204  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.262908  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1649  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.04 
 
 		 494 aa  196  7e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3119  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.26 
 
 		 581 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.83327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0889  peptidase S10, serine carboxypeptidase  30.49 
 
 		 516 aa  192  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0745  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.1 
 
 		 499 aa  192  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.164421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3225  peptidase S10, serine carboxypeptidase  30.49 
 
 		 516 aa  192  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.343617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3077  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.87 
 
 		 533 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1082  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.17 
 
 		 517 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0869  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.62 
 
 		 614 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510617  normal  0.442404 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1003  carboxypeptidase  31.25 
 
 		 543 aa  190  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.199137  normal  0.422421 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0270  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.3 
 
 		 500 aa  189  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.130085 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3133  peptidase S10, serine carboxypeptidase  29.94 
 
 		 516 aa  189  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.631529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0681  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.12 
 
 		 493 aa  189  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0213491  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0934  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.42 
 
 		 613 aa  188  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0917831 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1063  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.82 
 
 		 513 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3304  peptidase S10 serine carboxypeptidase  28.34 
 
 		 544 aa  186  8e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169507  normal  0.0135899 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1421  serine-type carboxypeptidase family protein  31.31 
 
 		 613 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0790  carboxypeptidase S1  29.1 
 
 		 481 aa  185  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04040  carboxypeptidase C (cathepsin A)  31.94 
 
 		 517 aa  184  3e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1030  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.46 
 
 		 513 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.531479  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2026  serine-type carboxypeptidase family protein  31.45 
 
 		 615 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3198  serine-type carboxypeptidase family protein  31.45 
 
 		 615 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0888  serine-type carboxypeptidase family protein  31.45 
 
 		 615 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2721  serine-type carboxypeptidase family protein  31.45 
 
 		 615 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3144  serine carboxypeptidase family protein  31.45 
 
 		 619 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.875872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3181  carboxypeptidase C  31.45 
 
 		 615 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.961281  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1888  serine-type carboxypeptidase family protein  31.45 
 
 		 615 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0603  serine carboxypeptidase  29.17 
 
 		 503 aa  182  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3329  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.61 
 
 		 513 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0961  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.69 
 
 		 513 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0358  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.17 
 
 		 611 aa  181  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917031  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0841  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.17 
 
 		 611 aa  181  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.820185  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3933  carboxypeptidase C (cathepsin A)-like  30.97 
 
 		 611 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462563 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0813  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.17 
 
 		 611 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.473991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32200  carboxypeptidase C (cathepsin A)  31.03 
 
 		 502 aa  179  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20738  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0118  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.39 
 
 		 492 aa  179  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2177  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.47 
 
 		 503 aa  177  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0088  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.59 
 
 		 487 aa  172  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0326  serine-type carboxypeptidase family protein  29.74 
 
 		 567 aa  170  7e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3251  peptidase S10 serine carboxypeptidase  29.95 
 
 		 514 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0975  serine carboxypeptidase family protein  28.63 
 
 		 575 aa  166  9e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0883  serine carboxypeptidase family protein  28.63 
 
 		 575 aa  166  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1554  serine-type carboxypeptidase family protein  28.63 
 
 		 575 aa  166  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.505984  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0561  serine-type carboxypeptidase family protein  29.62 
 
 		 549 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2223  serine-type carboxypeptidase family protein  28.63 
 
 		 585 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00580188  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0373  serine carboxypeptidase family protein  28.97 
 
 		 563 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.250878  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0393  serine carboxypeptidase family protein  28.97 
 
 		 563 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2759  peptidase S10, serine carboxypeptidase  30.54 
 
 		 614 aa  160  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.711571 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>