132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1207 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0601  peptidase S10 serine carboxypeptidase  73.32 
 
 
492 aa  750    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.445118 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1207  peptidase S10 serine carboxypeptidase  100 
 
 
502 aa  1039    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.34234  normal  0.567138 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1649  peptidase S10 serine carboxypeptidase  60.89 
 
 
494 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4660  peptidase S10 serine carboxypeptidase  58.53 
 
 
494 aa  587  1e-166  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.262908  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0681  peptidase S10 serine carboxypeptidase  54.1 
 
 
493 aa  518  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0213491  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0088  peptidase S10 serine carboxypeptidase  53.77 
 
 
487 aa  493  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32200  carboxypeptidase C (cathepsin A)  52.2 
 
 
502 aa  488  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20738  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2114  peptidase S10, serine carboxypeptidase  48.16 
 
 
514 aa  455  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000253475  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0889  peptidase S10, serine carboxypeptidase  45.45 
 
 
516 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3133  peptidase S10, serine carboxypeptidase  45.45 
 
 
516 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.631529  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3225  peptidase S10, serine carboxypeptidase  45.67 
 
 
516 aa  421  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.343617  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2128  peptidase S10 serine carboxypeptidase  45.63 
 
 
514 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000251865 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2090  peptidase S10 serine carboxypeptidase  45.11 
 
 
510 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0961  peptidase S10 serine carboxypeptidase  46.17 
 
 
513 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3329  peptidase S10 serine carboxypeptidase  46.17 
 
 
513 aa  415  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3077  peptidase S10, serine carboxypeptidase  44.56 
 
 
533 aa  410  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1030  peptidase S10 serine carboxypeptidase  45.74 
 
 
513 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.531479  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1063  peptidase S10 serine carboxypeptidase  45.94 
 
 
513 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4003  peptidase S10, serine carboxypeptidase  42.46 
 
 
561 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3773  peptidase S10, serine carboxypeptidase  43.21 
 
 
504 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3119  peptidase S10, serine carboxypeptidase  43.09 
 
 
581 aa  382  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.83327  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04040  carboxypeptidase C (cathepsin A)  42.46 
 
 
517 aa  372  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0745  peptidase S10, serine carboxypeptidase  39.25 
 
 
499 aa  368  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.164421 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0118  peptidase S10 serine carboxypeptidase  44.95 
 
 
492 aa  367  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2177  peptidase S10 serine carboxypeptidase  40.86 
 
 
503 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1195  peptidase S10 serine carboxypeptidase  40.89 
 
 
490 aa  357  1.9999999999999998e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755161  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0603  serine carboxypeptidase  39.18 
 
 
503 aa  356  3.9999999999999996e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3251  peptidase S10 serine carboxypeptidase  40.67 
 
 
514 aa  355  6.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1082  peptidase S10, serine carboxypeptidase  38.35 
 
 
517 aa  354  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3304  peptidase S10 serine carboxypeptidase  38.9 
 
 
544 aa  352  7e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169507  normal  0.0135899 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0270  peptidase S10, serine carboxypeptidase  39.71 
 
 
500 aa  352  8e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.130085 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5433  peptidase S10 serine carboxypeptidase  40.21 
 
 
590 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.735441  normal  0.336053 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1174  putative carboxypeptidase-related protein  40.2 
 
 
573 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80381  normal  0.157618 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01964  serine carboxypeptidase  37.35 
 
 
531 aa  337  3.9999999999999995e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.395984  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4319  peptidase S10, serine carboxypeptidase  38.48 
 
 
524 aa  289  7e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3088  peptidase S10, serine carboxypeptidase  36 
 
 
558 aa  279  8e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816612  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5279  peptidase S10, serine carboxypeptidase  36 
 
 
558 aa  279  8e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340917  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4989  peptidase S10 serine carboxypeptidase  36 
 
 
558 aa  279  8e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0371  peptidase S10, serine carboxypeptidase  35.79 
 
 
558 aa  278  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5168  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.58 
 
 
558 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.100052 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4639  peptidase S10, serine carboxypeptidase  35.58 
 
 
558 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4779  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.67 
 
 
553 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138285  hitchhiker  0.00136432 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0812  serine-type carboxypeptidase family protein  35.16 
 
 
554 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2113  serine carboxypeptidase family protein  35.37 
 
 
554 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1566  serine-type carboxypeptidase family protein  35.37 
 
 
554 aa  273  6e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0605  serine-type carboxypeptidase family protein  35.37 
 
 
554 aa  273  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2037  serine carboxypeptidase family protein  35.37 
 
 
554 aa  273  6e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.931228  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2200  serine carboxypeptidase family protein  35.37 
 
 
554 aa  273  6e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555603  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0716  serine carboxypeptidase family protein  35.37 
 
 
554 aa  273  6e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3442  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.1 
 
 
558 aa  273  7e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5055  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.83 
 
 
554 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.666059 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1993  carboxypeptidase  34.29 
 
 
551 aa  270  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102988 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1758  putative carboxypeptidase  35.73 
 
 
536 aa  270  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1003  carboxypeptidase  35.03 
 
 
543 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.199137  normal  0.422421 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0358  peptidase S10, serine carboxypeptidase  33.8 
 
 
611 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917031  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0841  peptidase S10, serine carboxypeptidase  33.8 
 
 
611 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.820185  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0934  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.32 
 
 
613 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0917831 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0869  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.32 
 
 
614 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510617  normal  0.442404 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3933  carboxypeptidase C (cathepsin A)-like  33.4 
 
 
611 aa  253  6e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462563 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0813  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.6 
 
 
611 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.473991  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2417  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.27 
 
 
497 aa  252  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0660734  normal  0.0714055 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1421  serine-type carboxypeptidase family protein  33.8 
 
 
613 aa  250  5e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2026  serine-type carboxypeptidase family protein  33.2 
 
 
615 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3198  serine-type carboxypeptidase family protein  33.2 
 
 
615 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0888  serine-type carboxypeptidase family protein  33.2 
 
 
615 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2721  serine-type carboxypeptidase family protein  33.2 
 
 
615 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3144  serine carboxypeptidase family protein  33.2 
 
 
619 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.875872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3181  carboxypeptidase C  33.2 
 
 
615 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.961281  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1888  serine-type carboxypeptidase family protein  33.2 
 
 
615 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0440  peptidase S10, serine carboxypeptidase  34.25 
 
 
505 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.480832  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2414  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.42 
 
 
494 aa  241  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.385514  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0380  peptidase S10, serine carboxypeptidase  33.69 
 
 
573 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0583  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.24 
 
 
536 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0131584 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0132  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.03 
 
 
536 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0295121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0615  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.03 
 
 
536 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.218301  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0347  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.87 
 
 
521 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272983  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2770  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.37 
 
 
535 aa  236  7e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523717  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3118  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.88 
 
 
522 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.226388  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1930  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.57 
 
 
514 aa  233  7.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00179  serine carboxypeptidase  32.3 
 
 
490 aa  229  8e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.520034  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1173  serine-type carboxypeptidase family protein  32.11 
 
 
588 aa  229  9e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5084  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.55 
 
 
500 aa  227  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.110686  normal  0.189262 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0412  serine-type carboxypeptidase family protein  31.76 
 
 
544 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.614642  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1272  serine-type carboxypeptidase family protein  31.76 
 
 
544 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3454  serine carboxypeptidase family protein  31.76 
 
 
544 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.489337  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3492  serine carboxypeptidase family protein  31.76 
 
 
544 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547458  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3293  serine-type carboxypeptidase family protein  31.76 
 
 
544 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2492  serine-type carboxypeptidase family protein  31.76 
 
 
571 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3491  serine-type carboxypeptidase family protein  31.76 
 
 
593 aa  226  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1336  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.33 
 
 
533 aa  224  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3697  carboxypeptidase C (cathepsin A)-like  31.48 
 
 
536 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393293  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1444  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.85 
 
 
498 aa  224  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00886012  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3109  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.53 
 
 
530 aa  224  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1968  peptidase S10, serine carboxypeptidase  33.77 
 
 
511 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.960831  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0540  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.79 
 
 
536 aa  219  7e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1122  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.41 
 
 
522 aa  219  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5174  putative peptidase S10, serine carboxypeptidase  30.84 
 
 
534 aa  219  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5407  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.21 
 
 
526 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451508  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0684  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.74 
 
 
513 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0948758  normal  0.0161354 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0516  peptidase S10, serine carboxypeptidase  30.58 
 
 
536 aa  217  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>