131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2177 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0603  serine carboxypeptidase  62.32 
 
 
503 aa  663    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01964  serine carboxypeptidase  64.09 
 
 
531 aa  667    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.395984  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3251  peptidase S10 serine carboxypeptidase  70.59 
 
 
514 aa  766    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2177  peptidase S10 serine carboxypeptidase  100 
 
 
503 aa  1035    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0118  peptidase S10 serine carboxypeptidase  61.36 
 
 
492 aa  618  1e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0601  peptidase S10 serine carboxypeptidase  42.62 
 
 
492 aa  371  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.445118 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1207  peptidase S10 serine carboxypeptidase  40.86 
 
 
502 aa  358  1.9999999999999998e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.34234  normal  0.567138 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4660  peptidase S10 serine carboxypeptidase  40.51 
 
 
494 aa  333  3e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.262908  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1649  peptidase S10 serine carboxypeptidase  39.7 
 
 
494 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2090  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.76 
 
 
510 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2128  peptidase S10 serine carboxypeptidase  37.5 
 
 
514 aa  298  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000251865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3773  peptidase S10, serine carboxypeptidase  37.74 
 
 
504 aa  291  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2114  peptidase S10, serine carboxypeptidase  33.79 
 
 
514 aa  288  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000253475  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4003  peptidase S10, serine carboxypeptidase  36.61 
 
 
561 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0681  peptidase S10 serine carboxypeptidase  36.53 
 
 
493 aa  275  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0213491  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0745  peptidase S10, serine carboxypeptidase  35.78 
 
 
499 aa  272  1e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.164421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3225  peptidase S10, serine carboxypeptidase  34.46 
 
 
516 aa  267  4e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.343617  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0889  peptidase S10, serine carboxypeptidase  34.26 
 
 
516 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3133  peptidase S10, serine carboxypeptidase  34.26 
 
 
516 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.631529  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1195  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.9 
 
 
490 aa  265  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755161  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0270  peptidase S10, serine carboxypeptidase  36.83 
 
 
500 aa  264  3e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.130085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0088  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.7 
 
 
487 aa  262  8e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5433  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.4 
 
 
590 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.735441  normal  0.336053 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3304  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.4 
 
 
544 aa  259  8e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169507  normal  0.0135899 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32200  carboxypeptidase C (cathepsin A)  34.86 
 
 
502 aa  257  4e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20738  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3077  peptidase S10, serine carboxypeptidase  33.95 
 
 
533 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1030  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.8 
 
 
513 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.531479  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1174  putative carboxypeptidase-related protein  32.58 
 
 
573 aa  250  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80381  normal  0.157618 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1063  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.83 
 
 
513 aa  250  4e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3329  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.83 
 
 
513 aa  250  5e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1082  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.31 
 
 
517 aa  248  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3119  peptidase S10, serine carboxypeptidase  33.06 
 
 
581 aa  249  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.83327  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0961  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.4 
 
 
513 aa  247  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04040  carboxypeptidase C (cathepsin A)  31.65 
 
 
517 aa  227  4e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5055  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.63 
 
 
554 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.666059 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4779  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.44 
 
 
553 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138285  hitchhiker  0.00136432 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1993  carboxypeptidase  31.45 
 
 
551 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102988 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4351  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.66 
 
 
510 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4619  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.34 
 
 
511 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4319  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.29 
 
 
524 aa  212  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0347  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.4 
 
 
521 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272983  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0371  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.72 
 
 
558 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3118  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32 
 
 
522 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.226388  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4989  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.11 
 
 
558 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3088  peptidase S10, serine carboxypeptidase  30.98 
 
 
558 aa  199  9e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816612  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5279  peptidase S10, serine carboxypeptidase  30.98 
 
 
558 aa  199  9e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340917  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5168  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.39 
 
 
558 aa  199  9e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.100052 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1566  serine-type carboxypeptidase family protein  31.88 
 
 
554 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0605  serine-type carboxypeptidase family protein  31.88 
 
 
554 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1444  peptidase S10 serine carboxypeptidase  29.78 
 
 
498 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00886012  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2037  serine carboxypeptidase family protein  31.88 
 
 
554 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.931228  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2200  serine carboxypeptidase family protein  31.88 
 
 
554 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555603  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2113  serine carboxypeptidase family protein  31.88 
 
 
554 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0716  serine carboxypeptidase family protein  31.88 
 
 
554 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4639  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.19 
 
 
558 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3442  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.43 
 
 
558 aa  196  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1758  putative carboxypeptidase  30.85 
 
 
536 aa  193  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0812  serine-type carboxypeptidase family protein  30.34 
 
 
554 aa  193  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00179  serine carboxypeptidase  29.71 
 
 
490 aa  190  4e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.520034  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1003  carboxypeptidase  30.79 
 
 
543 aa  190  5.999999999999999e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.199137  normal  0.422421 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0440  peptidase S10, serine carboxypeptidase  30.88 
 
 
505 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.480832  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1122  peptidase S10, serine carboxypeptidase  30.72 
 
 
522 aa  189  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1930  peptidase S10 serine carboxypeptidase  29.96 
 
 
514 aa  185  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2417  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31 
 
 
497 aa  184  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0660734  normal  0.0714055 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1968  peptidase S10, serine carboxypeptidase  29.65 
 
 
511 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.960831  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2967  peptidase S10, serine carboxypeptidase  30.13 
 
 
517 aa  183  6e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0380  peptidase S10, serine carboxypeptidase  29.94 
 
 
573 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5563  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.84 
 
 
519 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5118  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.67 
 
 
573 aa  179  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.302178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5174  putative peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.16 
 
 
534 aa  179  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5407  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.66 
 
 
526 aa  179  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451508  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4655  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.47 
 
 
573 aa  177  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0869  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.39 
 
 
614 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510617  normal  0.442404 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0934  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30 
 
 
613 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0917831 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5196  peptidase S10 serine carboxypeptidase  29.76 
 
 
573 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.574018  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1336  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.39 
 
 
533 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0563  peptidase S10 serine carboxypeptidase  27.59 
 
 
508 aa  173  5.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.854374  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5080  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.56 
 
 
417 aa  173  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  unclonable  0.000000000112364  normal  0.0461552 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2414  peptidase S10, serine carboxypeptidase  30.27 
 
 
494 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.385514  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3109  peptidase S10 serine carboxypeptidase  29.98 
 
 
530 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0609  carboxypeptidase related protein  27.13 
 
 
503 aa  168  2e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0684  peptidase S10 serine carboxypeptidase  28.02 
 
 
513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0948758  normal  0.0161354 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0813  peptidase S10 serine carboxypeptidase  28.34 
 
 
611 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.473991  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0358  peptidase S10, serine carboxypeptidase  28.34 
 
 
611 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917031  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0841  peptidase S10, serine carboxypeptidase  28.34 
 
 
611 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.820185  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3933  carboxypeptidase C (cathepsin A)-like  28.34 
 
 
611 aa  159  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462563 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5084  peptidase S10 serine carboxypeptidase  28.85 
 
 
500 aa  159  9e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.110686  normal  0.189262 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0583  peptidase S10 serine carboxypeptidase  28.94 
 
 
536 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0131584 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1421  serine-type carboxypeptidase family protein  28.71 
 
 
613 aa  158  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0132  peptidase S10, serine carboxypeptidase  28.73 
 
 
536 aa  157  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0295121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0615  peptidase S10, serine carboxypeptidase  28.73 
 
 
536 aa  157  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.218301  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3144  serine carboxypeptidase family protein  29.24 
 
 
619 aa  156  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.875872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3181  carboxypeptidase C  29.24 
 
 
615 aa  156  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.961281  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2026  serine-type carboxypeptidase family protein  29.24 
 
 
615 aa  156  9e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3198  serine-type carboxypeptidase family protein  29.24 
 
 
615 aa  156  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0888  serine-type carboxypeptidase family protein  29.24 
 
 
615 aa  156  9e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2721  serine-type carboxypeptidase family protein  29.24 
 
 
615 aa  156  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1888  serine-type carboxypeptidase family protein  29.24 
 
 
615 aa  156  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3697  carboxypeptidase C (cathepsin A)-like  29.18 
 
 
536 aa  156  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393293  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2770  peptidase S10 serine carboxypeptidase  29.56 
 
 
535 aa  155  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523717  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>