131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3077 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0889  peptidase S10, serine carboxypeptidase  75.34 
 
 		 516 aa  804    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3133  peptidase S10, serine carboxypeptidase  75.15 
 
 		 516 aa  802    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.631529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3225  peptidase S10, serine carboxypeptidase  75.54 
 
 		 516 aa  805    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.343617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0961  peptidase S10 serine carboxypeptidase  74.32 
 
 		 513 aa  777    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3077  peptidase S10, serine carboxypeptidase  100 
 
 		 533 aa  1102    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1030  peptidase S10 serine carboxypeptidase  74.71 
 
 		 513 aa  783    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.531479  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1063  peptidase S10 serine carboxypeptidase  74.71 
 
 		 513 aa  778    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3329  peptidase S10 serine carboxypeptidase  74.51 
 
 		 513 aa  776    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3773  peptidase S10, serine carboxypeptidase  51.6 
 
 		 504 aa  489  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0745  peptidase S10, serine carboxypeptidase  50.21 
 
 		 499 aa  485  1e-136  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.164421 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1195  peptidase S10 serine carboxypeptidase  50.74 
 
 		 490 aa  480  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0270  peptidase S10, serine carboxypeptidase  48.23 
 
 		 500 aa  462  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.130085 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1207  peptidase S10 serine carboxypeptidase  44.47 
 
 		 502 aa  410  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.34234  normal  0.567138 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0601  peptidase S10 serine carboxypeptidase  42.86 
 
 		 492 aa  397  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.445118 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4660  peptidase S10 serine carboxypeptidase  42.36 
 
 		 494 aa  383  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.262908  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1649  peptidase S10 serine carboxypeptidase  44.05 
 
 		 494 aa  382  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5433  peptidase S10 serine carboxypeptidase  40.16 
 
 		 590 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.735441  normal  0.336053 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1174  putative carboxypeptidase-related protein  41.13 
 
 		 573 aa  351  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80381  normal  0.157618 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1082  peptidase S10, serine carboxypeptidase  38.96 
 
 		 517 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3119  peptidase S10, serine carboxypeptidase  40.66 
 
 		 581 aa  333  4e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.83327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0681  peptidase S10 serine carboxypeptidase  42.06 
 
 		 493 aa  332  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0213491  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32200  carboxypeptidase C (cathepsin A)  40.77 
 
 		 502 aa  329  8e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20738  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0088  peptidase S10 serine carboxypeptidase  41.12 
 
 		 487 aa  327  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3304  peptidase S10 serine carboxypeptidase  38.86 
 
 		 544 aa  310  2.9999999999999997e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169507  normal  0.0135899 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2090  peptidase S10 serine carboxypeptidase  36.38 
 
 		 510 aa  297  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2114  peptidase S10, serine carboxypeptidase  35.88 
 
 		 514 aa  292  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000253475  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4003  peptidase S10, serine carboxypeptidase  36.45 
 
 		 561 aa  286  5e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04040  carboxypeptidase C (cathepsin A)  35.5 
 
 		 517 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2417  peptidase S10, serine carboxypeptidase  34.96 
 
 		 497 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0660734  normal  0.0714055 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2128  peptidase S10 serine carboxypeptidase  36.67 
 
 		 514 aa  280  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000251865 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3442  peptidase S10 serine carboxypeptidase  36.48 
 
 		 558 aa  270  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0118  peptidase S10 serine carboxypeptidase  36.3 
 
 		 492 aa  270  5e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0812  serine-type carboxypeptidase family protein  35.66 
 
 		 554 aa  268  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1566  serine-type carboxypeptidase family protein  36.68 
 
 		 554 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0605  serine-type carboxypeptidase family protein  36.68 
 
 		 554 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2037  serine carboxypeptidase family protein  36.68 
 
 		 554 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.931228  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2200  serine carboxypeptidase family protein  36.68 
 
 		 554 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555603  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0716  serine carboxypeptidase family protein  36.68 
 
 		 554 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0371  peptidase S10, serine carboxypeptidase  35.66 
 
 		 558 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3088  peptidase S10, serine carboxypeptidase  35.66 
 
 		 558 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816612  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5279  peptidase S10, serine carboxypeptidase  35.66 
 
 		 558 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2113  serine carboxypeptidase family protein  36.48 
 
 		 554 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4989  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.66 
 
 		 558 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5084  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.84 
 
 		 500 aa  264  4e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.110686  normal  0.189262 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5168  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.45 
 
 		 558 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.100052 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4639  peptidase S10, serine carboxypeptidase  35.45 
 
 		 558 aa  260  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5055  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.96 
 
 		 554 aa  257  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.666059 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01964  serine carboxypeptidase  34.6 
 
 		 531 aa  256  6e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.395984  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2177  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.95 
 
 		 503 aa  256  9e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0603  serine carboxypeptidase  33.33 
 
 		 503 aa  255  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4779  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.3 
 
 		 553 aa  252  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138285  hitchhiker  0.00136432 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1758  putative carboxypeptidase  36.02 
 
 		 536 aa  252  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1421  serine-type carboxypeptidase family protein  36.89 
 
 		 613 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1993  carboxypeptidase  33.88 
 
 		 551 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.102988 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2414  peptidase S10, serine carboxypeptidase  35.16 
 
 		 494 aa  250  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.385514  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3144  serine carboxypeptidase family protein  36.95 
 
 		 619 aa  250  5e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.875872  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2026  serine-type carboxypeptidase family protein  36.95 
 
 		 615 aa  250  6e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3198  serine-type carboxypeptidase family protein  36.95 
 
 		 615 aa  250  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0888  serine-type carboxypeptidase family protein  36.95 
 
 		 615 aa  250  6e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2721  serine-type carboxypeptidase family protein  36.95 
 
 		 615 aa  250  6e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3181  carboxypeptidase C  36.95 
 
 		 615 aa  250  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.961281  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1888  serine-type carboxypeptidase family protein  36.95 
 
 		 615 aa  250  6e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1003  carboxypeptidase  34.64 
 
 		 543 aa  247  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.199137  normal  0.422421 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3933  carboxypeptidase C (cathepsin A)-like  35.15 
 
 		 611 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462563 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0358  peptidase S10, serine carboxypeptidase  35.34 
 
 		 611 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917031  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0841  peptidase S10, serine carboxypeptidase  35.34 
 
 		 611 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.820185  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0813  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.74 
 
 		 611 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.473991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3251  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.77 
 
 		 514 aa  243  6e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0934  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.88 
 
 		 613 aa  237  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0917831 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0869  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.17 
 
 		 614 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510617  normal  0.442404 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4319  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.75 
 
 		 524 aa  224  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0684  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.33 
 
 		 513 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0948758  normal  0.0161354 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5080  peptidase S10 serine carboxypeptidase  38.92 
 
 		 417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  unclonable  0.000000000112364  normal  0.0461552 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1930  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.79 
 
 		 514 aa  214  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0583  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.45 
 
 		 536 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0131584 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0132  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.17 
 
 		 536 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0295121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0615  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.17 
 
 		 536 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.218301  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0563  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.12 
 
 		 508 aa  209  9e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.854374  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2770  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.82 
 
 		 535 aa  209  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1444  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.93 
 
 		 498 aa  208  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00886012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00179  serine carboxypeptidase  31.08 
 
 		 490 aa  208  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.520034  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0540  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.38 
 
 		 536 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3697  carboxypeptidase C (cathepsin A)-like  31.35 
 
 		 536 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393293  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0326  serine-type carboxypeptidase family protein  31.45 
 
 		 567 aa  206  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0440  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.94 
 
 		 505 aa  206  7e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.480832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3118  peptidase S10, serine carboxypeptidase  33.33 
 
 		 522 aa  206  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.226388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0516  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.17 
 
 		 536 aa  206  9e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371742  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0561  serine-type carboxypeptidase family protein  31.45 
 
 		 549 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0373  serine carboxypeptidase family protein  31.45 
 
 		 563 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.250878  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0393  serine carboxypeptidase family protein  31.45 
 
 		 563 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0412  serine-type carboxypeptidase family protein  31.36 
 
 		 544 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.614642  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1272  serine-type carboxypeptidase family protein  31.36 
 
 		 544 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3454  serine carboxypeptidase family protein  31.36 
 
 		 544 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.489337  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3492  serine carboxypeptidase family protein  31.36 
 
 		 544 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547458  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3293  serine-type carboxypeptidase family protein  31.36 
 
 		 544 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2492  serine-type carboxypeptidase family protein  31.65 
 
 		 571 aa  204  5e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3491  serine-type carboxypeptidase family protein  31.36 
 
 		 593 aa  204  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1968  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.06 
 
 		 511 aa  202  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.960831  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0609  carboxypeptidase related protein  31.28 
 
 		 503 aa  202  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1173  serine-type carboxypeptidase family protein  31.08 
 
 		 588 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>