143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0609 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1444  peptidase S10 serine carboxypeptidase  70.61 
 
 		 498 aa  734    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00886012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0563  peptidase S10 serine carboxypeptidase  97.05 
 
 		 508 aa  972    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.854374  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00179  serine carboxypeptidase  73.21 
 
 		 490 aa  754    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.520034  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0609  carboxypeptidase related protein  100 
 
 		 503 aa  1038    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3109  peptidase S10 serine carboxypeptidase  42.17 
 
 		 530 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0380  peptidase S10, serine carboxypeptidase  41.61 
 
 		 573 aa  361  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1930  peptidase S10 serine carboxypeptidase  38.7 
 
 		 514 aa  359  6e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4655  peptidase S10 serine carboxypeptidase  42.95 
 
 		 573 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3118  peptidase S10, serine carboxypeptidase  40.3 
 
 		 522 aa  356  5e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.226388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0440  peptidase S10, serine carboxypeptidase  40.29 
 
 		 505 aa  356  6.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.480832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5118  peptidase S10 serine carboxypeptidase  42.74 
 
 		 573 aa  356  6.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.302178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5174  putative peptidase S10, serine carboxypeptidase  39.74 
 
 		 534 aa  355  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5407  peptidase S10 serine carboxypeptidase  42.95 
 
 		 526 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5196  peptidase S10 serine carboxypeptidase  42.74 
 
 		 573 aa  352  8e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.574018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5563  peptidase S10 serine carboxypeptidase  42.73 
 
 		 519 aa  344  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1336  peptidase S10 serine carboxypeptidase  39.96 
 
 		 533 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0347  peptidase S10 serine carboxypeptidase  39.28 
 
 		 521 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272983  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1968  peptidase S10, serine carboxypeptidase  39.96 
 
 		 511 aa  338  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.960831  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1122  peptidase S10, serine carboxypeptidase  39.14 
 
 		 522 aa  333  3e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2967  peptidase S10, serine carboxypeptidase  38.54 
 
 		 517 aa  333  4e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4619  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.71 
 
 		 511 aa  293  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4351  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.27 
 
 		 510 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0684  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.44 
 
 		 513 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0948758  normal  0.0161354 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2114  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.72 
 
 		 514 aa  224  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000253475  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2090  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.36 
 
 		 510 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5433  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.29 
 
 		 590 aa  210  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.735441  normal  0.336053 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3773  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.51 
 
 		 504 aa  207  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3225  peptidase S10, serine carboxypeptidase  30.16 
 
 		 516 aa  206  8e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.343617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0889  peptidase S10, serine carboxypeptidase  30.08 
 
 		 516 aa  205  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3329  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.25 
 
 		 513 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1174  putative carboxypeptidase-related protein  32.01 
 
 		 573 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80381  normal  0.157618 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3077  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.02 
 
 		 533 aa  204  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1030  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.25 
 
 		 513 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.531479  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2128  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.28 
 
 		 514 aa  204  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000251865 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0270  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.72 
 
 		 500 aa  203  5e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.130085 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3133  peptidase S10, serine carboxypeptidase  29.9 
 
 		 516 aa  203  5e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.631529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1063  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.27 
 
 		 513 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1195  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.59 
 
 		 490 aa  202  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0961  peptidase S10 serine carboxypeptidase  29.41 
 
 		 513 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4003  peptidase S10, serine carboxypeptidase  29.23 
 
 		 561 aa  197  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1207  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.28 
 
 		 502 aa  197  4.0000000000000005e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.34234  normal  0.567138 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0088  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.14 
 
 		 487 aa  197  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1649  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.41 
 
 		 494 aa  195  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0601  peptidase S10 serine carboxypeptidase  29.42 
 
 		 492 aa  189  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.445118 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4319  peptidase S10, serine carboxypeptidase  29.36 
 
 		 524 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4660  peptidase S10 serine carboxypeptidase  29.65 
 
 		 494 aa  189  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.262908  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0790  carboxypeptidase S1  30.02 
 
 		 481 aa  185  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3119  peptidase S10, serine carboxypeptidase  30.27 
 
 		 581 aa  184  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.83327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32200  carboxypeptidase C (cathepsin A)  31.39 
 
 		 502 aa  182  8.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20738  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0681  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.3 
 
 		 493 aa  182  9.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0213491  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0745  peptidase S10, serine carboxypeptidase  28.42 
 
 		 499 aa  179  8e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.164421 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3304  peptidase S10 serine carboxypeptidase  28.66 
 
 		 544 aa  179  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169507  normal  0.0135899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1082  peptidase S10, serine carboxypeptidase  28.97 
 
 		 517 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2177  peptidase S10 serine carboxypeptidase  26.85 
 
 		 503 aa  176  8e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04040  carboxypeptidase C (cathepsin A)  29.72 
 
 		 517 aa  174  5e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3251  peptidase S10 serine carboxypeptidase  29.04 
 
 		 514 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0118  peptidase S10 serine carboxypeptidase  29.4 
 
 		 492 aa  169  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3442  peptidase S10 serine carboxypeptidase  28.99 
 
 		 558 aa  168  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0603  serine carboxypeptidase  29.24 
 
 		 503 aa  167  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1993  carboxypeptidase  28.66 
 
 		 551 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.102988 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4989  peptidase S10 serine carboxypeptidase  28.93 
 
 		 558 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4779  peptidase S10 serine carboxypeptidase  28.45 
 
 		 553 aa  163  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138285  hitchhiker  0.00136432 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4639  peptidase S10, serine carboxypeptidase  29.34 
 
 		 558 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5084  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.09 
 
 		 500 aa  163  8.000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.110686  normal  0.189262 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3088  peptidase S10, serine carboxypeptidase  28.72 
 
 		 558 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816612  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5279  peptidase S10, serine carboxypeptidase  28.72 
 
 		 558 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5168  peptidase S10 serine carboxypeptidase  29.04 
 
 		 558 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.100052 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5055  peptidase S10 serine carboxypeptidase  27.92 
 
 		 554 aa  160  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.666059 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0371  peptidase S10, serine carboxypeptidase  28.51 
 
 		 558 aa  159  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01964  serine carboxypeptidase  26.64 
 
 		 531 aa  157  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.395984  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1566  serine-type carboxypeptidase family protein  28.29 
 
 		 554 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0605  serine-type carboxypeptidase family protein  28.29 
 
 		 554 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2037  serine carboxypeptidase family protein  28.29 
 
 		 554 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.931228  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2200  serine carboxypeptidase family protein  28.31 
 
 		 554 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555603  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0716  serine carboxypeptidase family protein  28.29 
 
 		 554 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0812  serine-type carboxypeptidase family protein  27.71 
 
 		 554 aa  154  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2113  serine carboxypeptidase family protein  28.1 
 
 		 554 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1758  putative carboxypeptidase  27.82 
 
 		 536 aa  147  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0869  peptidase S10 serine carboxypeptidase  27.36 
 
 		 614 aa  143  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510617  normal  0.442404 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3933  carboxypeptidase C (cathepsin A)-like  27.88 
 
 		 611 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462563 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0813  peptidase S10 serine carboxypeptidase  28.08 
 
 		 611 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.473991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0358  peptidase S10, serine carboxypeptidase  28.08 
 
 		 611 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917031  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0841  peptidase S10, serine carboxypeptidase  28.08 
 
 		 611 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.820185  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1003  carboxypeptidase  26.75 
 
 		 543 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.199137  normal  0.422421 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0934  peptidase S10 serine carboxypeptidase  26.97 
 
 		 613 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0917831 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2026  serine-type carboxypeptidase family protein  27.13 
 
 		 615 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3198  serine-type carboxypeptidase family protein  27.13 
 
 		 615 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1421  serine-type carboxypeptidase family protein  26.92 
 
 		 613 aa  139  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0888  serine-type carboxypeptidase family protein  27.13 
 
 		 615 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2721  serine-type carboxypeptidase family protein  27.13 
 
 		 615 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3144  serine carboxypeptidase family protein  27.13 
 
 		 619 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.875872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3181  carboxypeptidase C  27.13 
 
 		 615 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.961281  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1888  serine-type carboxypeptidase family protein  27.13 
 
 		 615 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2417  peptidase S10, serine carboxypeptidase  26.53 
 
 		 497 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0660734  normal  0.0714055 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0583  peptidase S10 serine carboxypeptidase  26.47 
 
 		 536 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0131584 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2414  peptidase S10, serine carboxypeptidase  26.03 
 
 		 494 aa  136  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.385514  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0132  peptidase S10, serine carboxypeptidase  26.47 
 
 		 536 aa  136  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0295121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0615  peptidase S10, serine carboxypeptidase  26.47 
 
 		 536 aa  136  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.218301  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1076  peptidase S10, serine carboxypeptidase  26.98 
 
 		 538 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0540  peptidase S10 serine carboxypeptidase  27.1 
 
 		 536 aa  134  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.721238 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>