132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3088 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1566  serine-type carboxypeptidase family protein  83.75 
 
 
554 aa  958    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4779  peptidase S10 serine carboxypeptidase  82.4 
 
 
553 aa  902    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138285  hitchhiker  0.00136432 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1758  putative carboxypeptidase  62.65 
 
 
536 aa  659    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0605  serine-type carboxypeptidase family protein  83.75 
 
 
554 aa  958    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0371  peptidase S10, serine carboxypeptidase  95.88 
 
 
558 aa  1106    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0812  serine-type carboxypeptidase family protein  83.73 
 
 
554 aa  954    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1993  carboxypeptidase  83.5 
 
 
551 aa  904    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102988 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3088  peptidase S10, serine carboxypeptidase  100 
 
 
558 aa  1144    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816612  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4639  peptidase S10, serine carboxypeptidase  96.06 
 
 
558 aa  1104    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5279  peptidase S10, serine carboxypeptidase  100 
 
 
558 aa  1144    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340917  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2037  serine carboxypeptidase family protein  83.75 
 
 
554 aa  958    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.931228  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2200  serine carboxypeptidase family protein  83.75 
 
 
554 aa  957    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555603  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2113  serine carboxypeptidase family protein  83.57 
 
 
554 aa  957    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0716  serine carboxypeptidase family protein  83.75 
 
 
554 aa  958    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3442  peptidase S10 serine carboxypeptidase  93.55 
 
 
558 aa  1084    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4989  peptidase S10 serine carboxypeptidase  99.82 
 
 
558 aa  1143    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5168  peptidase S10 serine carboxypeptidase  94.62 
 
 
558 aa  1091    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.100052 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5055  peptidase S10 serine carboxypeptidase  85.21 
 
 
554 aa  918    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.666059 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1003  carboxypeptidase  57.01 
 
 
543 aa  594  1e-168  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.199137  normal  0.422421 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0934  peptidase S10 serine carboxypeptidase  55.58 
 
 
613 aa  587  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0917831 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0869  peptidase S10 serine carboxypeptidase  54.84 
 
 
614 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510617  normal  0.442404 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3933  carboxypeptidase C (cathepsin A)-like  54.68 
 
 
611 aa  570  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462563 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1421  serine-type carboxypeptidase family protein  54.92 
 
 
613 aa  568  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0358  peptidase S10, serine carboxypeptidase  54.95 
 
 
611 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917031  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0841  peptidase S10, serine carboxypeptidase  54.95 
 
 
611 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.820185  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0813  peptidase S10 serine carboxypeptidase  55.14 
 
 
611 aa  571  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.473991  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2026  serine-type carboxypeptidase family protein  55.01 
 
 
615 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3198  serine-type carboxypeptidase family protein  55.01 
 
 
615 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0888  serine-type carboxypeptidase family protein  55.01 
 
 
615 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2721  serine-type carboxypeptidase family protein  55.01 
 
 
615 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3181  carboxypeptidase C  55.01 
 
 
615 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.961281  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1888  serine-type carboxypeptidase family protein  55.01 
 
 
615 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3144  serine carboxypeptidase family protein  55.01 
 
 
619 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.875872  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5433  peptidase S10 serine carboxypeptidase  42.8 
 
 
590 aa  369  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.735441  normal  0.336053 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1174  putative carboxypeptidase-related protein  41.98 
 
 
573 aa  352  7e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80381  normal  0.157618 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2770  peptidase S10 serine carboxypeptidase  40.38 
 
 
535 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523717  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0412  serine-type carboxypeptidase family protein  39.77 
 
 
544 aa  319  9e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.614642  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1272  serine-type carboxypeptidase family protein  39.77 
 
 
544 aa  319  9e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3454  serine carboxypeptidase family protein  39.77 
 
 
544 aa  319  9e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.489337  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3492  serine carboxypeptidase family protein  39.77 
 
 
544 aa  319  9e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547458  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3293  serine-type carboxypeptidase family protein  39.77 
 
 
544 aa  319  9e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2492  serine-type carboxypeptidase family protein  39.77 
 
 
571 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3491  serine-type carboxypeptidase family protein  39.77 
 
 
593 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1173  serine-type carboxypeptidase family protein  39.73 
 
 
588 aa  318  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0540  peptidase S10 serine carboxypeptidase  39.38 
 
 
536 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0583  peptidase S10 serine carboxypeptidase  40.16 
 
 
536 aa  317  4e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0131584 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0132  peptidase S10, serine carboxypeptidase  39.96 
 
 
536 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0295121  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0516  peptidase S10, serine carboxypeptidase  39.19 
 
 
536 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371742  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0615  peptidase S10, serine carboxypeptidase  39.96 
 
 
536 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.218301  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3697  carboxypeptidase C (cathepsin A)-like  39.24 
 
 
536 aa  312  9e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393293  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3304  peptidase S10 serine carboxypeptidase  36.82 
 
 
544 aa  290  3e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169507  normal  0.0135899 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0373  serine carboxypeptidase family protein  37.15 
 
 
563 aa  290  7e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.250878  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0393  serine carboxypeptidase family protein  37.15 
 
 
563 aa  290  7e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0561  serine-type carboxypeptidase family protein  37.15 
 
 
549 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0326  serine-type carboxypeptidase family protein  37.75 
 
 
567 aa  288  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0601  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.96 
 
 
492 aa  281  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.445118 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3119  peptidase S10, serine carboxypeptidase  37.78 
 
 
581 aa  281  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.83327  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1063  peptidase S10 serine carboxypeptidase  37.47 
 
 
513 aa  279  8e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1207  peptidase S10 serine carboxypeptidase  36 
 
 
502 aa  279  9e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.34234  normal  0.567138 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3329  peptidase S10 serine carboxypeptidase  37.47 
 
 
513 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0961  peptidase S10 serine carboxypeptidase  37.27 
 
 
513 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1030  peptidase S10 serine carboxypeptidase  36.85 
 
 
513 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.531479  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4747  peptidase S10, serine carboxypeptidase  36.57 
 
 
615 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3420  peptidase S10, serine carboxypeptidase  36.57 
 
 
615 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4097  peptidase S10 serine carboxypeptidase  36.38 
 
 
589 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0889  peptidase S10, serine carboxypeptidase  35.6 
 
 
516 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3225  peptidase S10, serine carboxypeptidase  35.6 
 
 
516 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.343617  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5192  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.96 
 
 
616 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276478  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3133  peptidase S10, serine carboxypeptidase  36.21 
 
 
516 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.631529  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2114  peptidase S10, serine carboxypeptidase  35.88 
 
 
514 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000253475  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2759  peptidase S10, serine carboxypeptidase  35.82 
 
 
614 aa  266  8e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3077  peptidase S10, serine carboxypeptidase  35.66 
 
 
533 aa  265  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1195  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.67 
 
 
490 aa  265  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755161  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2128  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.79 
 
 
514 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000251865 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4003  peptidase S10, serine carboxypeptidase  33.78 
 
 
561 aa  254  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4660  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.54 
 
 
494 aa  253  6e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.262908  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2090  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.56 
 
 
510 aa  253  8.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3358  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.34 
 
 
616 aa  250  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5195  peptidase S10, serine carboxypeptidase  35.34 
 
 
616 aa  249  8e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3773  peptidase S10, serine carboxypeptidase  34.62 
 
 
504 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0745  peptidase S10, serine carboxypeptidase  33.91 
 
 
499 aa  240  5e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.164421 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1649  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.98 
 
 
494 aa  240  5.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1082  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.47 
 
 
517 aa  236  8e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32200  carboxypeptidase C (cathepsin A)  33.33 
 
 
502 aa  236  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20738  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0270  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.84 
 
 
500 aa  233  7.000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.130085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0681  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.54 
 
 
493 aa  232  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0213491  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2223  serine-type carboxypeptidase family protein  30.98 
 
 
585 aa  223  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00580188  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0975  serine carboxypeptidase family protein  30.98 
 
 
575 aa  223  8e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0883  serine carboxypeptidase family protein  30.98 
 
 
575 aa  223  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1554  serine-type carboxypeptidase family protein  30.98 
 
 
575 aa  223  8e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.505984  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0088  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.06 
 
 
487 aa  215  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4655  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.81 
 
 
573 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4319  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.94 
 
 
524 aa  210  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0118  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.41 
 
 
492 aa  210  5e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5118  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.99 
 
 
573 aa  206  7e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.302178 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5407  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.66 
 
 
526 aa  204  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451508  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5196  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.64 
 
 
573 aa  203  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.574018  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5174  putative peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.82 
 
 
534 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04040  carboxypeptidase C (cathepsin A)  30.31 
 
 
517 aa  201  3.9999999999999996e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3118  peptidase S10, serine carboxypeptidase  30.8 
 
 
522 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.226388  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>