130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0540 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA2492  serine-type carboxypeptidase family protein  78.96 
 
 		 571 aa  841    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3491  serine-type carboxypeptidase family protein  78.96 
 
 		 593 aa  838    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3697  carboxypeptidase C (cathepsin A)-like  93.47 
 
 		 536 aa  998    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393293  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1173  serine-type carboxypeptidase family protein  79.22 
 
 		 588 aa  832    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0132  peptidase S10, serine carboxypeptidase  92.54 
 
 		 536 aa  987    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0295121  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0516  peptidase S10, serine carboxypeptidase  99.44 
 
 		 536 aa  1080    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371742  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0615  peptidase S10, serine carboxypeptidase  92.54 
 
 		 536 aa  987    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.218301  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0412  serine-type carboxypeptidase family protein  78.96 
 
 		 544 aa  839    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.614642  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1272  serine-type carboxypeptidase family protein  78.96 
 
 		 544 aa  839    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3454  serine carboxypeptidase family protein  78.96 
 
 		 544 aa  839    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.489337  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3492  serine carboxypeptidase family protein  78.96 
 
 		 544 aa  839    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547458  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3293  serine-type carboxypeptidase family protein  78.96 
 
 		 544 aa  839    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2770  peptidase S10 serine carboxypeptidase  89.37 
 
 		 535 aa  963    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0583  peptidase S10 serine carboxypeptidase  92.54 
 
 		 536 aa  987    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0131584 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0540  peptidase S10 serine carboxypeptidase  100 
 
 		 536 aa  1086    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0561  serine-type carboxypeptidase family protein  49.43 
 
 		 549 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4747  peptidase S10, serine carboxypeptidase  49.9 
 
 		 615 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3420  peptidase S10, serine carboxypeptidase  49.9 
 
 		 615 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0373  serine carboxypeptidase family protein  49.33 
 
 		 563 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.250878  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0393  serine carboxypeptidase family protein  49.33 
 
 		 563 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4097  peptidase S10 serine carboxypeptidase  49.9 
 
 		 589 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2759  peptidase S10, serine carboxypeptidase  49.31 
 
 		 614 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0326  serine-type carboxypeptidase family protein  47.53 
 
 		 567 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5192  peptidase S10 serine carboxypeptidase  47.61 
 
 		 616 aa  434  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3358  peptidase S10 serine carboxypeptidase  49.51 
 
 		 616 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5195  peptidase S10, serine carboxypeptidase  47.2 
 
 		 616 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2223  serine-type carboxypeptidase family protein  37.5 
 
 		 585 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00580188  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0975  serine carboxypeptidase family protein  37.5 
 
 		 575 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0883  serine carboxypeptidase family protein  37.5 
 
 		 575 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1554  serine-type carboxypeptidase family protein  37.5 
 
 		 575 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.505984  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0934  peptidase S10 serine carboxypeptidase  40.79 
 
 		 613 aa  335  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0917831 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0869  peptidase S10 serine carboxypeptidase  40.79 
 
 		 614 aa  334  3e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510617  normal  0.442404 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0813  peptidase S10 serine carboxypeptidase  41.1 
 
 		 611 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.473991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0358  peptidase S10, serine carboxypeptidase  40.91 
 
 		 611 aa  333  5e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917031  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0841  peptidase S10, serine carboxypeptidase  40.91 
 
 		 611 aa  333  5e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.820185  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3933  carboxypeptidase C (cathepsin A)-like  40.64 
 
 		 611 aa  332  9e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462563 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2026  serine-type carboxypeptidase family protein  41.95 
 
 		 615 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3198  serine-type carboxypeptidase family protein  41.95 
 
 		 615 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0888  serine-type carboxypeptidase family protein  41.95 
 
 		 615 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2721  serine-type carboxypeptidase family protein  41.95 
 
 		 615 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3144  serine carboxypeptidase family protein  41.95 
 
 		 619 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.875872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3181  carboxypeptidase C  41.95 
 
 		 615 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.961281  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1888  serine-type carboxypeptidase family protein  41.95 
 
 		 615 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1421  serine-type carboxypeptidase family protein  41.39 
 
 		 613 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1003  carboxypeptidase  40.18 
 
 		 543 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.199137  normal  0.422421 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1993  carboxypeptidase  39.62 
 
 		 551 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.102988 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3442  peptidase S10 serine carboxypeptidase  39.55 
 
 		 558 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4779  peptidase S10 serine carboxypeptidase  39.04 
 
 		 553 aa  323  4e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138285  hitchhiker  0.00136432 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5055  peptidase S10 serine carboxypeptidase  38.31 
 
 		 554 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.666059 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3088  peptidase S10, serine carboxypeptidase  39.16 
 
 		 558 aa  319  6e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816612  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5279  peptidase S10, serine carboxypeptidase  39.16 
 
 		 558 aa  319  6e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0371  peptidase S10, serine carboxypeptidase  39.2 
 
 		 558 aa  319  7e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4989  peptidase S10 serine carboxypeptidase  38.96 
 
 		 558 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4639  peptidase S10, serine carboxypeptidase  38.81 
 
 		 558 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5168  peptidase S10 serine carboxypeptidase  38.62 
 
 		 558 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.100052 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1758  putative carboxypeptidase  39.02 
 
 		 536 aa  310  5.9999999999999995e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1566  serine-type carboxypeptidase family protein  37.45 
 
 		 554 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0605  serine-type carboxypeptidase family protein  37.45 
 
 		 554 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2037  serine carboxypeptidase family protein  37.45 
 
 		 554 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.931228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2113  serine carboxypeptidase family protein  37.45 
 
 		 554 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0716  serine carboxypeptidase family protein  37.45 
 
 		 554 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2200  serine carboxypeptidase family protein  37.45 
 
 		 554 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555603  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0812  serine-type carboxypeptidase family protein  37.64 
 
 		 554 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1174  putative carboxypeptidase-related protein  39.34 
 
 		 573 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80381  normal  0.157618 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5433  peptidase S10 serine carboxypeptidase  38.38 
 
 		 590 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.735441  normal  0.336053 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3304  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.82 
 
 		 544 aa  250  5e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169507  normal  0.0135899 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4003  peptidase S10, serine carboxypeptidase  33.81 
 
 		 561 aa  244  3e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2128  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.93 
 
 		 514 aa  243  6e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000251865 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2090  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.84 
 
 		 510 aa  238  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0066  hypothetical protein  41.72 
 
 		 323 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.502649  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2114  peptidase S10, serine carboxypeptidase  34.91 
 
 		 514 aa  234  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000253475  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3773  peptidase S10, serine carboxypeptidase  33.69 
 
 		 504 aa  234  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3119  peptidase S10, serine carboxypeptidase  33.05 
 
 		 581 aa  231  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.83327  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0601  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.72 
 
 		 492 aa  229  6e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.445118 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0270  peptidase S10, serine carboxypeptidase  33.61 
 
 		 500 aa  228  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.130085 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1207  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.79 
 
 		 502 aa  223  9e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.34234  normal  0.567138 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1195  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.35 
 
 		 490 aa  222  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0889  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.78 
 
 		 516 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3225  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.78 
 
 		 516 aa  220  6e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.343617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4660  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.15 
 
 		 494 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.262908  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3133  peptidase S10, serine carboxypeptidase  33.06 
 
 		 516 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.631529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0745  peptidase S10, serine carboxypeptidase  33.33 
 
 		 499 aa  215  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.164421 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3329  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.06 
 
 		 513 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3077  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.65 
 
 		 533 aa  210  5e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0961  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.85 
 
 		 513 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0088  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.83 
 
 		 487 aa  209  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1030  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.06 
 
 		 513 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.531479  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1063  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.85 
 
 		 513 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1082  peptidase S10, serine carboxypeptidase  30.72 
 
 		 517 aa  207  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0681  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.54 
 
 		 493 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0213491  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1649  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.36 
 
 		 494 aa  196  9e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4319  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.16 
 
 		 524 aa  190  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32200  carboxypeptidase C (cathepsin A)  31.22 
 
 		 502 aa  189  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20738  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1930  peptidase S10 serine carboxypeptidase  29.68 
 
 		 514 aa  187  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0347  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.84 
 
 		 521 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272983  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3118  peptidase S10, serine carboxypeptidase  30.22 
 
 		 522 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.226388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04040  carboxypeptidase C (cathepsin A)  30.58 
 
 		 517 aa  182  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5407  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.74 
 
 		 526 aa  182  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0440  peptidase S10, serine carboxypeptidase  30.66 
 
 		 505 aa  181  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.480832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0380  peptidase S10, serine carboxypeptidase  30.83 
 
 		 573 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>