129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5433 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1174  putative carboxypeptidase-related protein  89.11 
 
 
573 aa  939    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80381  normal  0.157618 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5433  peptidase S10 serine carboxypeptidase  100 
 
 
590 aa  1194    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.735441  normal  0.336053 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1566  serine-type carboxypeptidase family protein  42.13 
 
 
554 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0605  serine-type carboxypeptidase family protein  42.13 
 
 
554 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0371  peptidase S10, serine carboxypeptidase  42.18 
 
 
558 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3088  peptidase S10, serine carboxypeptidase  42.8 
 
 
558 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816612  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5279  peptidase S10, serine carboxypeptidase  42.8 
 
 
558 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340917  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2037  serine carboxypeptidase family protein  42.13 
 
 
554 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.931228  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2200  serine carboxypeptidase family protein  42.13 
 
 
554 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555603  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2113  serine carboxypeptidase family protein  41.92 
 
 
554 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0716  serine carboxypeptidase family protein  42.13 
 
 
554 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4989  peptidase S10 serine carboxypeptidase  42.8 
 
 
558 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3442  peptidase S10 serine carboxypeptidase  42.59 
 
 
558 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0812  serine-type carboxypeptidase family protein  41.1 
 
 
554 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4639  peptidase S10, serine carboxypeptidase  42.18 
 
 
558 aa  369  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5168  peptidase S10 serine carboxypeptidase  41.77 
 
 
558 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.100052 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5055  peptidase S10 serine carboxypeptidase  41.77 
 
 
554 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.666059 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4779  peptidase S10 serine carboxypeptidase  41.12 
 
 
553 aa  365  1e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138285  hitchhiker  0.00136432 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1993  carboxypeptidase  41.32 
 
 
551 aa  365  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102988 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0601  peptidase S10 serine carboxypeptidase  42.16 
 
 
492 aa  364  2e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.445118 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1195  peptidase S10 serine carboxypeptidase  41.86 
 
 
490 aa  362  7.0000000000000005e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755161  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3077  peptidase S10, serine carboxypeptidase  40.16 
 
 
533 aa  360  4e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0889  peptidase S10, serine carboxypeptidase  41.27 
 
 
516 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3225  peptidase S10, serine carboxypeptidase  41.27 
 
 
516 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.343617  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3133  peptidase S10, serine carboxypeptidase  41.07 
 
 
516 aa  355  1e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.631529  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3773  peptidase S10, serine carboxypeptidase  41.98 
 
 
504 aa  355  1e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1758  putative carboxypeptidase  40.41 
 
 
536 aa  352  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3329  peptidase S10 serine carboxypeptidase  41.22 
 
 
513 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1063  peptidase S10 serine carboxypeptidase  41.43 
 
 
513 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1207  peptidase S10 serine carboxypeptidase  40.21 
 
 
502 aa  350  6e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.34234  normal  0.567138 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1030  peptidase S10 serine carboxypeptidase  41.22 
 
 
513 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.531479  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1082  peptidase S10, serine carboxypeptidase  39.66 
 
 
517 aa  347  4e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0961  peptidase S10 serine carboxypeptidase  40.82 
 
 
513 aa  346  8e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0934  peptidase S10 serine carboxypeptidase  41.25 
 
 
613 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0917831 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3304  peptidase S10 serine carboxypeptidase  40.29 
 
 
544 aa  343  4e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169507  normal  0.0135899 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0869  peptidase S10 serine carboxypeptidase  41.25 
 
 
614 aa  342  1e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510617  normal  0.442404 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3119  peptidase S10, serine carboxypeptidase  40.67 
 
 
581 aa  341  2e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.83327  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0270  peptidase S10, serine carboxypeptidase  40.28 
 
 
500 aa  340  5e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.130085 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4003  peptidase S10, serine carboxypeptidase  37.64 
 
 
561 aa  339  7e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1003  carboxypeptidase  39.83 
 
 
543 aa  335  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.199137  normal  0.422421 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4660  peptidase S10 serine carboxypeptidase  39.39 
 
 
494 aa  331  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.262908  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2026  serine-type carboxypeptidase family protein  41.01 
 
 
615 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3198  serine-type carboxypeptidase family protein  41.01 
 
 
615 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3933  carboxypeptidase C (cathepsin A)-like  40.85 
 
 
611 aa  330  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462563 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0888  serine-type carboxypeptidase family protein  41.01 
 
 
615 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2721  serine-type carboxypeptidase family protein  41.01 
 
 
615 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3144  serine carboxypeptidase family protein  41.01 
 
 
619 aa  331  3e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.875872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3181  carboxypeptidase C  41.01 
 
 
615 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.961281  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1649  peptidase S10 serine carboxypeptidase  41.1 
 
 
494 aa  331  3e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1888  serine-type carboxypeptidase family protein  41.01 
 
 
615 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0358  peptidase S10, serine carboxypeptidase  40.81 
 
 
611 aa  329  8e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917031  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0841  peptidase S10, serine carboxypeptidase  40.81 
 
 
611 aa  329  8e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.820185  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1421  serine-type carboxypeptidase family protein  40.45 
 
 
613 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0813  peptidase S10 serine carboxypeptidase  40.81 
 
 
611 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.473991  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2114  peptidase S10, serine carboxypeptidase  36.43 
 
 
514 aa  327  5e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000253475  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2090  peptidase S10 serine carboxypeptidase  37.68 
 
 
510 aa  325  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1173  serine-type carboxypeptidase family protein  39.42 
 
 
588 aa  324  3e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0412  serine-type carboxypeptidase family protein  39.17 
 
 
544 aa  320  5e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.614642  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1272  serine-type carboxypeptidase family protein  39.17 
 
 
544 aa  320  5e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3454  serine carboxypeptidase family protein  39.17 
 
 
544 aa  320  5e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.489337  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3492  serine carboxypeptidase family protein  39.17 
 
 
544 aa  320  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547458  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3293  serine-type carboxypeptidase family protein  39.17 
 
 
544 aa  320  5e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2128  peptidase S10 serine carboxypeptidase  39.06 
 
 
514 aa  320  5e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000251865 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3491  serine-type carboxypeptidase family protein  39.17 
 
 
593 aa  320  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2492  serine-type carboxypeptidase family protein  39.17 
 
 
571 aa  320  7e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0745  peptidase S10, serine carboxypeptidase  38.62 
 
 
499 aa  318  2e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.164421 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0132  peptidase S10, serine carboxypeptidase  39.21 
 
 
536 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0295121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0615  peptidase S10, serine carboxypeptidase  39.21 
 
 
536 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.218301  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0583  peptidase S10 serine carboxypeptidase  39.21 
 
 
536 aa  316  7e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0131584 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2770  peptidase S10 serine carboxypeptidase  39.21 
 
 
535 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523717  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3697  carboxypeptidase C (cathepsin A)-like  38.38 
 
 
536 aa  311  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393293  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32200  carboxypeptidase C (cathepsin A)  39.75 
 
 
502 aa  308  1.0000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20738  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0540  peptidase S10 serine carboxypeptidase  38.38 
 
 
536 aa  307  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0516  peptidase S10, serine carboxypeptidase  38.17 
 
 
536 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371742  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0681  peptidase S10 serine carboxypeptidase  40.63 
 
 
493 aa  298  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0213491  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0088  peptidase S10 serine carboxypeptidase  39.96 
 
 
487 aa  290  4e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0326  serine-type carboxypeptidase family protein  37.61 
 
 
567 aa  286  5e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0561  serine-type carboxypeptidase family protein  38.03 
 
 
549 aa  286  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0373  serine carboxypeptidase family protein  38.03 
 
 
563 aa  286  9e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.250878  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0393  serine carboxypeptidase family protein  38.03 
 
 
563 aa  286  9e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4319  peptidase S10, serine carboxypeptidase  37.58 
 
 
524 aa  278  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4747  peptidase S10, serine carboxypeptidase  36.42 
 
 
615 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3420  peptidase S10, serine carboxypeptidase  36.42 
 
 
615 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4097  peptidase S10 serine carboxypeptidase  36.42 
 
 
589 aa  278  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0603  serine carboxypeptidase  34.34 
 
 
503 aa  271  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2759  peptidase S10, serine carboxypeptidase  35.81 
 
 
614 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04040  carboxypeptidase C (cathepsin A)  34.92 
 
 
517 aa  269  1e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2177  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.4 
 
 
503 aa  267  4e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01964  serine carboxypeptidase  32.64 
 
 
531 aa  258  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.395984  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5192  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.27 
 
 
616 aa  256  8e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276478  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3358  peptidase S10 serine carboxypeptidase  36.02 
 
 
616 aa  256  8e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5195  peptidase S10, serine carboxypeptidase  36.02 
 
 
616 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0118  peptidase S10 serine carboxypeptidase  36.42 
 
 
492 aa  253  7e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3251  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.85 
 
 
514 aa  245  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5563  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.86 
 
 
519 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4655  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.76 
 
 
573 aa  243  9e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5407  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.72 
 
 
526 aa  242  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451508  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0347  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.39 
 
 
521 aa  242  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272983  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5196  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.58 
 
 
573 aa  241  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.574018  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3109  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.31 
 
 
530 aa  241  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>