141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3304 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3304  peptidase S10 serine carboxypeptidase  100 
 
 
544 aa  1119    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169507  normal  0.0135899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3119  peptidase S10, serine carboxypeptidase  58.72 
 
 
581 aa  588  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.83327  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1207  peptidase S10 serine carboxypeptidase  38.9 
 
 
502 aa  353  5.9999999999999994e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.34234  normal  0.567138 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4660  peptidase S10 serine carboxypeptidase  39.03 
 
 
494 aa  350  5e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.262908  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0601  peptidase S10 serine carboxypeptidase  38.93 
 
 
492 aa  340  5e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.445118 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5433  peptidase S10 serine carboxypeptidase  39.49 
 
 
590 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.735441  normal  0.336053 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1174  putative carboxypeptidase-related protein  40.32 
 
 
573 aa  335  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80381  normal  0.157618 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3773  peptidase S10, serine carboxypeptidase  38.4 
 
 
504 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2090  peptidase S10 serine carboxypeptidase  37.22 
 
 
510 aa  323  6e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1649  peptidase S10 serine carboxypeptidase  39.47 
 
 
494 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1082  peptidase S10, serine carboxypeptidase  36.38 
 
 
517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2114  peptidase S10, serine carboxypeptidase  40.59 
 
 
514 aa  320  5e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000253475  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1063  peptidase S10 serine carboxypeptidase  36.59 
 
 
513 aa  312  9e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3077  peptidase S10, serine carboxypeptidase  38.86 
 
 
533 aa  311  2e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1030  peptidase S10 serine carboxypeptidase  36.38 
 
 
513 aa  310  5e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.531479  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2128  peptidase S10 serine carboxypeptidase  37.45 
 
 
514 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000251865 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4003  peptidase S10, serine carboxypeptidase  39.15 
 
 
561 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0961  peptidase S10 serine carboxypeptidase  36.38 
 
 
513 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3329  peptidase S10 serine carboxypeptidase  36.4 
 
 
513 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3225  peptidase S10, serine carboxypeptidase  36.97 
 
 
516 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.343617  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0889  peptidase S10, serine carboxypeptidase  36.97 
 
 
516 aa  307  3e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3133  peptidase S10, serine carboxypeptidase  36.77 
 
 
516 aa  306  7e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.631529  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0745  peptidase S10, serine carboxypeptidase  34.62 
 
 
499 aa  303  4.0000000000000003e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.164421 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4319  peptidase S10, serine carboxypeptidase  38.23 
 
 
524 aa  301  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0270  peptidase S10, serine carboxypeptidase  35.74 
 
 
500 aa  300  4e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.130085 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32200  carboxypeptidase C (cathepsin A)  37.47 
 
 
502 aa  299  1e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20738  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2200  serine carboxypeptidase family protein  37.33 
 
 
554 aa  296  7e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555603  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1566  serine-type carboxypeptidase family protein  37.33 
 
 
554 aa  296  8e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0605  serine-type carboxypeptidase family protein  37.33 
 
 
554 aa  296  8e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2037  serine carboxypeptidase family protein  37.33 
 
 
554 aa  296  8e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.931228  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0716  serine carboxypeptidase family protein  37.33 
 
 
554 aa  296  8e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0812  serine-type carboxypeptidase family protein  36.94 
 
 
554 aa  296  9e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1993  carboxypeptidase  37.09 
 
 
551 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102988 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1195  peptidase S10 serine carboxypeptidase  37.73 
 
 
490 aa  295  2e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755161  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2113  serine carboxypeptidase family protein  37.13 
 
 
554 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4779  peptidase S10 serine carboxypeptidase  36.98 
 
 
553 aa  293  7e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138285  hitchhiker  0.00136432 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3442  peptidase S10 serine carboxypeptidase  36.78 
 
 
558 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3088  peptidase S10, serine carboxypeptidase  36.82 
 
 
558 aa  291  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816612  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5279  peptidase S10, serine carboxypeptidase  36.82 
 
 
558 aa  291  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340917  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4989  peptidase S10 serine carboxypeptidase  36.82 
 
 
558 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0681  peptidase S10 serine carboxypeptidase  37.07 
 
 
493 aa  290  5.0000000000000004e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0213491  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0371  peptidase S10, serine carboxypeptidase  36.63 
 
 
558 aa  289  9e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5168  peptidase S10 serine carboxypeptidase  37.18 
 
 
558 aa  289  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.100052 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4639  peptidase S10, serine carboxypeptidase  36.43 
 
 
558 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5055  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.98 
 
 
554 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.666059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0088  peptidase S10 serine carboxypeptidase  37.28 
 
 
487 aa  268  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3251  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.79 
 
 
514 aa  263  6e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1003  carboxypeptidase  35.76 
 
 
543 aa  262  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.199137  normal  0.422421 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0118  peptidase S10 serine carboxypeptidase  36.97 
 
 
492 aa  262  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2177  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.59 
 
 
503 aa  261  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1758  putative carboxypeptidase  33.93 
 
 
536 aa  259  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3933  carboxypeptidase C (cathepsin A)-like  34.08 
 
 
611 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462563 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0603  serine carboxypeptidase  32.59 
 
 
503 aa  255  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0358  peptidase S10, serine carboxypeptidase  34.39 
 
 
611 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917031  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0841  peptidase S10, serine carboxypeptidase  34.39 
 
 
611 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.820185  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0813  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.89 
 
 
611 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.473991  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01964  serine carboxypeptidase  31.43 
 
 
531 aa  253  6e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.395984  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2492  serine-type carboxypeptidase family protein  34.34 
 
 
571 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0934  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.68 
 
 
613 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0917831 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1173  serine-type carboxypeptidase family protein  34.68 
 
 
588 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0412  serine-type carboxypeptidase family protein  34.34 
 
 
544 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.614642  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1272  serine-type carboxypeptidase family protein  34.34 
 
 
544 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3454  serine carboxypeptidase family protein  34.34 
 
 
544 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.489337  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3492  serine carboxypeptidase family protein  34.34 
 
 
544 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547458  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3293  serine-type carboxypeptidase family protein  34.34 
 
 
544 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3491  serine-type carboxypeptidase family protein  34.34 
 
 
593 aa  251  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0583  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.65 
 
 
536 aa  250  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0131584 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0869  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.68 
 
 
614 aa  249  7e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510617  normal  0.442404 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0540  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.65 
 
 
536 aa  249  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1421  serine-type carboxypeptidase family protein  33.93 
 
 
613 aa  249  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0132  peptidase S10, serine carboxypeptidase  34.45 
 
 
536 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0295121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0615  peptidase S10, serine carboxypeptidase  34.45 
 
 
536 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.218301  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2417  peptidase S10, serine carboxypeptidase  35.57 
 
 
497 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0660734  normal  0.0714055 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0516  peptidase S10, serine carboxypeptidase  34.45 
 
 
536 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371742  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3181  carboxypeptidase C  33.93 
 
 
615 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.961281  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2026  serine-type carboxypeptidase family protein  34.32 
 
 
615 aa  246  8e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3198  serine-type carboxypeptidase family protein  34.32 
 
 
615 aa  246  8e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0888  serine-type carboxypeptidase family protein  34.32 
 
 
615 aa  246  8e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2721  serine-type carboxypeptidase family protein  34.32 
 
 
615 aa  246  8e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3144  serine carboxypeptidase family protein  34.32 
 
 
619 aa  246  8e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.875872  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1888  serine-type carboxypeptidase family protein  34.32 
 
 
615 aa  246  8e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3697  carboxypeptidase C (cathepsin A)-like  34.45 
 
 
536 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393293  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2770  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.14 
 
 
535 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523717  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04040  carboxypeptidase C (cathepsin A)  29.94 
 
 
517 aa  237  4e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5084  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.58 
 
 
500 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.110686  normal  0.189262 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0561  serine-type carboxypeptidase family protein  32.99 
 
 
549 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0440  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.51 
 
 
505 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.480832  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0373  serine carboxypeptidase family protein  32.99 
 
 
563 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.250878  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0393  serine carboxypeptidase family protein  32.99 
 
 
563 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0347  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.26 
 
 
521 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272983  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0326  serine-type carboxypeptidase family protein  32.78 
 
 
567 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5080  peptidase S10 serine carboxypeptidase  37.66 
 
 
417 aa  213  7e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  unclonable  0.000000000112364  normal  0.0461552 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3118  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.22 
 
 
522 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.226388  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2967  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.44 
 
 
517 aa  209  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5174  putative peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.98 
 
 
534 aa  209  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2759  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.53 
 
 
614 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5192  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.55 
 
 
616 aa  207  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276478  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0380  peptidase S10, serine carboxypeptidase  30.24 
 
 
573 aa  206  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4747  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.28 
 
 
615 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3420  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.28 
 
 
615 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>