132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4639 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1566  serine-type carboxypeptidase family protein  83.21 
 
 		 554 aa  957    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4779  peptidase S10 serine carboxypeptidase  82.4 
 
 		 553 aa  900    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138285  hitchhiker  0.00136432 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1758  putative carboxypeptidase  62.65 
 
 		 536 aa  655    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0605  serine-type carboxypeptidase family protein  83.21 
 
 		 554 aa  957    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0371  peptidase S10, serine carboxypeptidase  94.62 
 
 		 558 aa  1097    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0812  serine-type carboxypeptidase family protein  82.82 
 
 		 554 aa  949    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1993  carboxypeptidase  83.69 
 
 		 551 aa  905    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.102988 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3088  peptidase S10, serine carboxypeptidase  96.06 
 
 		 558 aa  1104    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816612  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4639  peptidase S10, serine carboxypeptidase  100 
 
 		 558 aa  1145    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5279  peptidase S10, serine carboxypeptidase  96.06 
 
 		 558 aa  1104    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2037  serine carboxypeptidase family protein  83.21 
 
 		 554 aa  957    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.931228  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2200  serine carboxypeptidase family protein  83.21 
 
 		 554 aa  957    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555603  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2113  serine carboxypeptidase family protein  83.03 
 
 		 554 aa  956    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0716  serine carboxypeptidase family protein  83.21 
 
 		 554 aa  957    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3442  peptidase S10 serine carboxypeptidase  94.44 
 
 		 558 aa  1098    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4989  peptidase S10 serine carboxypeptidase  95.88 
 
 		 558 aa  1103    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5168  peptidase S10 serine carboxypeptidase  98.57 
 
 		 558 aa  1132    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.100052 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5055  peptidase S10 serine carboxypeptidase  85.02 
 
 		 554 aa  917    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.666059 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1003  carboxypeptidase  56.26 
 
 		 543 aa  585  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.199137  normal  0.422421 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0934  peptidase S10 serine carboxypeptidase  55.03 
 
 		 613 aa  581  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0917831 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0869  peptidase S10 serine carboxypeptidase  54.3 
 
 		 614 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510617  normal  0.442404 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3933  carboxypeptidase C (cathepsin A)-like  54.32 
 
 		 611 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462563 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1421  serine-type carboxypeptidase family protein  54.63 
 
 		 613 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0358  peptidase S10, serine carboxypeptidase  54.49 
 
 		 611 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917031  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0841  peptidase S10, serine carboxypeptidase  54.49 
 
 		 611 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.820185  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0813  peptidase S10 serine carboxypeptidase  54.49 
 
 		 611 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.473991  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2026  serine-type carboxypeptidase family protein  54.37 
 
 		 615 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3198  serine-type carboxypeptidase family protein  54.37 
 
 		 615 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0888  serine-type carboxypeptidase family protein  54.37 
 
 		 615 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2721  serine-type carboxypeptidase family protein  54.37 
 
 		 615 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3144  serine carboxypeptidase family protein  54.37 
 
 		 619 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.875872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3181  carboxypeptidase C  54.37 
 
 		 615 aa  558  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.961281  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1888  serine-type carboxypeptidase family protein  54.37 
 
 		 615 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5433  peptidase S10 serine carboxypeptidase  42.18 
 
 		 590 aa  362  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.735441  normal  0.336053 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1174  putative carboxypeptidase-related protein  41.56 
 
 		 573 aa  348  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80381  normal  0.157618 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2770  peptidase S10 serine carboxypeptidase  40 
 
 		 535 aa  318  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1173  serine-type carboxypeptidase family protein  39.73 
 
 		 588 aa  317  3e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0412  serine-type carboxypeptidase family protein  39.39 
 
 		 544 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.614642  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1272  serine-type carboxypeptidase family protein  39.39 
 
 		 544 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3454  serine carboxypeptidase family protein  39.39 
 
 		 544 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.489337  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3492  serine carboxypeptidase family protein  39.39 
 
 		 544 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547458  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3293  serine-type carboxypeptidase family protein  39.39 
 
 		 544 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2492  serine-type carboxypeptidase family protein  39.39 
 
 		 571 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3491  serine-type carboxypeptidase family protein  39.39 
 
 		 593 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0583  peptidase S10 serine carboxypeptidase  39.76 
 
 		 536 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0131584 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0540  peptidase S10 serine carboxypeptidase  38.77 
 
 		 536 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0132  peptidase S10, serine carboxypeptidase  39.56 
 
 		 536 aa  309  8e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0295121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0615  peptidase S10, serine carboxypeptidase  39.56 
 
 		 536 aa  309  8e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.218301  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0516  peptidase S10, serine carboxypeptidase  38.58 
 
 		 536 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371742  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3697  carboxypeptidase C (cathepsin A)-like  39.56 
 
 		 536 aa  307  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393293  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3304  peptidase S10 serine carboxypeptidase  36.43 
 
 		 544 aa  286  5e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169507  normal  0.0135899 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0601  peptidase S10 serine carboxypeptidase  36.77 
 
 		 492 aa  282  1e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.445118 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0561  serine-type carboxypeptidase family protein  36.56 
 
 		 549 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0373  serine carboxypeptidase family protein  36.56 
 
 		 563 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.250878  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0393  serine carboxypeptidase family protein  36.56 
 
 		 563 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0326  serine-type carboxypeptidase family protein  36.13 
 
 		 567 aa  279  8e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3119  peptidase S10, serine carboxypeptidase  37.58 
 
 		 581 aa  278  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.83327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4747  peptidase S10, serine carboxypeptidase  36.16 
 
 		 615 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3420  peptidase S10, serine carboxypeptidase  36.16 
 
 		 615 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4097  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.83 
 
 		 589 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1207  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.58 
 
 		 502 aa  273  5.000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.34234  normal  0.567138 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1063  peptidase S10 serine carboxypeptidase  36.65 
 
 		 513 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3329  peptidase S10 serine carboxypeptidase  36.65 
 
 		 513 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0961  peptidase S10 serine carboxypeptidase  36.44 
 
 		 513 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1030  peptidase S10 serine carboxypeptidase  36.65 
 
 		 513 aa  270  7e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.531479  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5192  peptidase S10 serine carboxypeptidase  36.13 
 
 		 616 aa  269  8e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0889  peptidase S10, serine carboxypeptidase  36.33 
 
 		 516 aa  267  4e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3225  peptidase S10, serine carboxypeptidase  36.33 
 
 		 516 aa  267  4e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.343617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2759  peptidase S10, serine carboxypeptidase  35.42 
 
 		 614 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3133  peptidase S10, serine carboxypeptidase  36.12 
 
 		 516 aa  266  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.631529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2114  peptidase S10, serine carboxypeptidase  34.09 
 
 		 514 aa  261  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000253475  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2128  peptidase S10 serine carboxypeptidase  36.14 
 
 		 514 aa  261  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000251865 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3077  peptidase S10, serine carboxypeptidase  35.45 
 
 		 533 aa  260  4e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1195  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.47 
 
 		 490 aa  259  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2090  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.12 
 
 		 510 aa  256  9e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3358  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.1 
 
 		 616 aa  253  6e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5195  peptidase S10, serine carboxypeptidase  35.1 
 
 		 616 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3773  peptidase S10, serine carboxypeptidase  34.62 
 
 		 504 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4003  peptidase S10, serine carboxypeptidase  33.91 
 
 		 561 aa  248  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4660  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.14 
 
 		 494 aa  247  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.262908  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0745  peptidase S10, serine carboxypeptidase  34.27 
 
 		 499 aa  241  2.9999999999999997e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.164421 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1649  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.37 
 
 		 494 aa  236  7e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32200  carboxypeptidase C (cathepsin A)  33.33 
 
 		 502 aa  232  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20738  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0270  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.91 
 
 		 500 aa  233  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.130085 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1082  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.47 
 
 		 517 aa  232  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0681  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.52 
 
 		 493 aa  222  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0213491  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0883  serine carboxypeptidase family protein  30.48 
 
 		 575 aa  217  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1554  serine-type carboxypeptidase family protein  30.48 
 
 		 575 aa  217  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.505984  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2223  serine-type carboxypeptidase family protein  30.48 
 
 		 585 aa  217  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00580188  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0975  serine carboxypeptidase family protein  30.48 
 
 		 575 aa  217  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0088  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.33 
 
 		 487 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4655  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.81 
 
 		 573 aa  210  6e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4319  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.14 
 
 		 524 aa  209  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0118  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.13 
 
 		 492 aa  207  4e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5118  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.2 
 
 		 573 aa  204  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.302178 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3118  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.06 
 
 		 522 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.226388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5196  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.47 
 
 		 573 aa  200  6e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.574018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5174  putative peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.55 
 
 		 534 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2177  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.19 
 
 		 503 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3109  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.35 
 
 		 530 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>