144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2090 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2090  peptidase S10 serine carboxypeptidase  100 
 
 		 510 aa  1040    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2128  peptidase S10 serine carboxypeptidase  89.98 
 
 		 514 aa  897    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000251865 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2114  peptidase S10, serine carboxypeptidase  62.26 
 
 		 514 aa  672    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000253475  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4660  peptidase S10 serine carboxypeptidase  45.51 
 
 		 494 aa  426  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.262908  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4003  peptidase S10, serine carboxypeptidase  42.89 
 
 		 561 aa  419  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0601  peptidase S10 serine carboxypeptidase  46.72 
 
 		 492 aa  421  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.445118 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1207  peptidase S10 serine carboxypeptidase  45.11 
 
 		 502 aa  418  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.34234  normal  0.567138 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1649  peptidase S10 serine carboxypeptidase  46.71 
 
 		 494 aa  409  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0681  peptidase S10 serine carboxypeptidase  42.69 
 
 		 493 aa  353  4e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0213491  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0088  peptidase S10 serine carboxypeptidase  42.86 
 
 		 487 aa  340  4e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4319  peptidase S10, serine carboxypeptidase  40 
 
 		 524 aa  330  3e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32200  carboxypeptidase C (cathepsin A)  40.59 
 
 		 502 aa  323  5e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20738  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1174  putative carboxypeptidase-related protein  38.7 
 
 		 573 aa  319  6e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80381  normal  0.157618 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0118  peptidase S10 serine carboxypeptidase  40.97 
 
 		 492 aa  318  1e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5433  peptidase S10 serine carboxypeptidase  37.52 
 
 		 590 aa  317  4e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.735441  normal  0.336053 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1030  peptidase S10 serine carboxypeptidase  38.68 
 
 		 513 aa  316  8e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.531479  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1063  peptidase S10 serine carboxypeptidase  39.34 
 
 		 513 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3329  peptidase S10 serine carboxypeptidase  39.54 
 
 		 513 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3119  peptidase S10, serine carboxypeptidase  39.13 
 
 		 581 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.83327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3304  peptidase S10 serine carboxypeptidase  40.55 
 
 		 544 aa  315  1.9999999999999998e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169507  normal  0.0135899 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0961  peptidase S10 serine carboxypeptidase  39.13 
 
 		 513 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3225  peptidase S10, serine carboxypeptidase  38.84 
 
 		 516 aa  312  1e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.343617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3773  peptidase S10, serine carboxypeptidase  37.95 
 
 		 504 aa  312  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3133  peptidase S10, serine carboxypeptidase  38.3 
 
 		 516 aa  310  4e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.631529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0889  peptidase S10, serine carboxypeptidase  38.64 
 
 		 516 aa  310  5e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2177  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.76 
 
 		 503 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0603  serine carboxypeptidase  38.49 
 
 		 503 aa  305  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3251  peptidase S10 serine carboxypeptidase  36.08 
 
 		 514 aa  300  4e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01964  serine carboxypeptidase  36.6 
 
 		 531 aa  300  6e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.395984  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0270  peptidase S10, serine carboxypeptidase  37.15 
 
 		 500 aa  297  2e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.130085 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3077  peptidase S10, serine carboxypeptidase  36.51 
 
 		 533 aa  295  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04040  carboxypeptidase C (cathepsin A)  36.62 
 
 		 517 aa  294  3e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1082  peptidase S10, serine carboxypeptidase  35.33 
 
 		 517 aa  293  7e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1195  peptidase S10 serine carboxypeptidase  37.05 
 
 		 490 aa  286  9e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0745  peptidase S10, serine carboxypeptidase  38.73 
 
 		 499 aa  283  4.0000000000000003e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.164421 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5055  peptidase S10 serine carboxypeptidase  36.49 
 
 		 554 aa  261  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.666059 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3442  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.12 
 
 		 558 aa  256  6e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4639  peptidase S10, serine carboxypeptidase  35.12 
 
 		 558 aa  256  8e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0347  peptidase S10 serine carboxypeptidase  36.61 
 
 		 521 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272983  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5168  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.12 
 
 		 558 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.100052 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3088  peptidase S10, serine carboxypeptidase  34.56 
 
 		 558 aa  253  7e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816612  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5279  peptidase S10, serine carboxypeptidase  34.56 
 
 		 558 aa  253  7e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1993  carboxypeptidase  35.26 
 
 		 551 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.102988 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4989  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.56 
 
 		 558 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1566  serine-type carboxypeptidase family protein  34.96 
 
 		 554 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0605  serine-type carboxypeptidase family protein  34.96 
 
 		 554 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2037  serine carboxypeptidase family protein  34.96 
 
 		 554 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.931228  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0716  serine carboxypeptidase family protein  34.96 
 
 		 554 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0371  peptidase S10, serine carboxypeptidase  34.35 
 
 		 558 aa  251  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2200  serine carboxypeptidase family protein  34.96 
 
 		 554 aa  251  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555603  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0812  serine-type carboxypeptidase family protein  34.62 
 
 		 554 aa  249  6e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2113  serine carboxypeptidase family protein  34.76 
 
 		 554 aa  249  7e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0583  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.97 
 
 		 536 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0131584 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4779  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.43 
 
 		 553 aa  249  9e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138285  hitchhiker  0.00136432 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0132  peptidase S10, serine carboxypeptidase  35.76 
 
 		 536 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0295121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0615  peptidase S10, serine carboxypeptidase  35.76 
 
 		 536 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.218301  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3109  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.29 
 
 		 530 aa  248  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1930  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.38 
 
 		 514 aa  248  3e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3697  carboxypeptidase C (cathepsin A)-like  35.14 
 
 		 536 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393293  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0440  peptidase S10, serine carboxypeptidase  33.27 
 
 		 505 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.480832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1336  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.43 
 
 		 533 aa  244  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00179  serine carboxypeptidase  32.41 
 
 		 490 aa  242  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.520034  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1003  carboxypeptidase  34.82 
 
 		 543 aa  241  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.199137  normal  0.422421 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0380  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.87 
 
 		 573 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3118  peptidase S10, serine carboxypeptidase  35.19 
 
 		 522 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.226388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0790  carboxypeptidase S1  31.33 
 
 		 481 aa  237  3e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5174  putative peptidase S10, serine carboxypeptidase  34.34 
 
 		 534 aa  237  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1968  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.86 
 
 		 511 aa  236  6e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.960831  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0540  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.59 
 
 		 536 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3491  serine-type carboxypeptidase family protein  34.81 
 
 		 593 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0516  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.4 
 
 		 536 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371742  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0412  serine-type carboxypeptidase family protein  34.81 
 
 		 544 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.614642  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1272  serine-type carboxypeptidase family protein  34.81 
 
 		 544 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3454  serine carboxypeptidase family protein  34.81 
 
 		 544 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.489337  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3492  serine carboxypeptidase family protein  34.81 
 
 		 544 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547458  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3293  serine-type carboxypeptidase family protein  34.81 
 
 		 544 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2492  serine-type carboxypeptidase family protein  34.83 
 
 		 571 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2770  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.44 
 
 		 535 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1173  serine-type carboxypeptidase family protein  34.03 
 
 		 588 aa  231  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1444  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.42 
 
 		 498 aa  230  4e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00886012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1758  putative carboxypeptidase  33.54 
 
 		 536 aa  229  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5407  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.29 
 
 		 526 aa  229  8e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0869  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.63 
 
 		 614 aa  229  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510617  normal  0.442404 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0934  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.63 
 
 		 613 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0917831 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4655  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.68 
 
 		 573 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4619  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.59 
 
 		 511 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4351  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.76 
 
 		 510 aa  226  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5118  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.61 
 
 		 573 aa  225  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.302178 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0358  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.95 
 
 		 611 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917031  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0841  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.95 
 
 		 611 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.820185  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0813  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.95 
 
 		 611 aa  224  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.473991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3933  carboxypeptidase C (cathepsin A)-like  33.33 
 
 		 611 aa  223  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462563 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0684  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.98 
 
 		 513 aa  223  7e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0948758  normal  0.0161354 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2967  peptidase S10, serine carboxypeptidase  34.78 
 
 		 517 aa  219  7e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1122  peptidase S10, serine carboxypeptidase  33.33 
 
 		 522 aa  218  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0563  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.22 
 
 		 508 aa  218  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.854374  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5196  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.56 
 
 		 573 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.574018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5563  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.14 
 
 		 519 aa  216  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0609  carboxypeptidase related protein  32.16 
 
 		 503 aa  216  5e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0326  serine-type carboxypeptidase family protein  31.76 
 
 		 567 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>