130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2417 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2417  peptidase S10, serine carboxypeptidase  100 
 
 		 497 aa  985    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0660734  normal  0.0714055 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3077  peptidase S10, serine carboxypeptidase  35.09 
 
 		 533 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0270  peptidase S10, serine carboxypeptidase  35.81 
 
 		 500 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.130085 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3225  peptidase S10, serine carboxypeptidase  34.58 
 
 		 516 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.343617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0889  peptidase S10, serine carboxypeptidase  34.8 
 
 		 516 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3133  peptidase S10, serine carboxypeptidase  34.39 
 
 		 516 aa  282  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.631529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1063  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.96 
 
 		 513 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1030  peptidase S10 serine carboxypeptidase  36.16 
 
 		 513 aa  281  3e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.531479  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3329  peptidase S10 serine carboxypeptidase  36.16 
 
 		 513 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0961  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.6 
 
 		 513 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0745  peptidase S10, serine carboxypeptidase  36.61 
 
 		 499 aa  268  2e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.164421 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3773  peptidase S10, serine carboxypeptidase  36.58 
 
 		 504 aa  266  8.999999999999999e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1207  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.27 
 
 		 502 aa  252  9.000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.34234  normal  0.567138 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1082  peptidase S10, serine carboxypeptidase  33.66 
 
 		 517 aa  249  6e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3304  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.57 
 
 		 544 aa  248  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169507  normal  0.0135899 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1195  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.8 
 
 		 490 aa  245  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32200  carboxypeptidase C (cathepsin A)  37.1 
 
 		 502 aa  243  3.9999999999999997e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20738  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0601  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.41 
 
 		 492 aa  244  3.9999999999999997e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.445118 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3119  peptidase S10, serine carboxypeptidase  38.14 
 
 		 581 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.83327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0681  peptidase S10 serine carboxypeptidase  37.78 
 
 		 493 aa  237  4e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0213491  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4660  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.03 
 
 		 494 aa  236  6e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.262908  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2414  peptidase S10, serine carboxypeptidase  35.35 
 
 		 494 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.385514  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1649  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.69 
 
 		 494 aa  228  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0118  peptidase S10 serine carboxypeptidase  36.26 
 
 		 492 aa  225  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0088  peptidase S10 serine carboxypeptidase  36.09 
 
 		 487 aa  223  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5084  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.12 
 
 		 500 aa  221  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.110686  normal  0.189262 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1076  peptidase S10, serine carboxypeptidase  35.57 
 
 		 538 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5433  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.81 
 
 		 590 aa  216  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.735441  normal  0.336053 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0603  serine carboxypeptidase  31.42 
 
 		 503 aa  216  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1174  putative carboxypeptidase-related protein  34.59 
 
 		 573 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80381  normal  0.157618 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01964  serine carboxypeptidase  32.64 
 
 		 531 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.395984  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04040  carboxypeptidase C (cathepsin A)  34.53 
 
 		 517 aa  213  7e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2114  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.88 
 
 		 514 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000253475  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2090  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.53 
 
 		 510 aa  210  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4003  peptidase S10, serine carboxypeptidase  30.38 
 
 		 561 aa  207  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2128  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.83 
 
 		 514 aa  206  9e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000251865 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0358  peptidase S10, serine carboxypeptidase  30.92 
 
 		 611 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917031  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0841  peptidase S10, serine carboxypeptidase  30.92 
 
 		 611 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.820185  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3442  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.12 
 
 		 558 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4989  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.98 
 
 		 558 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1993  carboxypeptidase  32.1 
 
 		 551 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.102988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3251  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.93 
 
 		 514 aa  198  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0813  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.92 
 
 		 611 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.473991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3088  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.77 
 
 		 558 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816612  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5279  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.77 
 
 		 558 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340917  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1003  carboxypeptidase  31.36 
 
 		 543 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.199137  normal  0.422421 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5055  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.7 
 
 		 554 aa  196  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.666059 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5168  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.44 
 
 		 558 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.100052 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4639  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.85 
 
 		 558 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5080  peptidase S10 serine carboxypeptidase  37.17 
 
 		 417 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  unclonable  0.000000000112364  normal  0.0461552 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4779  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.89 
 
 		 553 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138285  hitchhiker  0.00136432 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0371  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.98 
 
 		 558 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2113  serine carboxypeptidase family protein  32.69 
 
 		 554 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0869  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30 
 
 		 614 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510617  normal  0.442404 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1566  serine-type carboxypeptidase family protein  32.9 
 
 		 554 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0605  serine-type carboxypeptidase family protein  32.9 
 
 		 554 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2037  serine carboxypeptidase family protein  32.9 
 
 		 554 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.931228  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2200  serine carboxypeptidase family protein  32.9 
 
 		 554 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555603  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0716  serine carboxypeptidase family protein  32.9 
 
 		 554 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3933  carboxypeptidase C (cathepsin A)-like  29.43 
 
 		 611 aa  193  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462563 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0812  serine-type carboxypeptidase family protein  32.48 
 
 		 554 aa  193  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0934  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30 
 
 		 613 aa  193  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0917831 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2026  serine-type carboxypeptidase family protein  31.47 
 
 		 615 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3198  serine-type carboxypeptidase family protein  31.47 
 
 		 615 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0888  serine-type carboxypeptidase family protein  31.47 
 
 		 615 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2721  serine-type carboxypeptidase family protein  31.47 
 
 		 615 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3181  carboxypeptidase C  31.47 
 
 		 615 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.961281  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1888  serine-type carboxypeptidase family protein  31.47 
 
 		 615 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3144  serine carboxypeptidase family protein  31.47 
 
 		 619 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.875872  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1421  serine-type carboxypeptidase family protein  30.98 
 
 		 613 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1758  putative carboxypeptidase  32.97 
 
 		 536 aa  189  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4319  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.03 
 
 		 524 aa  188  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2177  peptidase S10 serine carboxypeptidase  29.43 
 
 		 503 aa  186  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4351  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.02 
 
 		 510 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4619  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.4 
 
 		 511 aa  177  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0132  peptidase S10, serine carboxypeptidase  30.47 
 
 		 536 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0295121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0615  peptidase S10, serine carboxypeptidase  30.47 
 
 		 536 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.218301  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0583  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.47 
 
 		 536 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0131584 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2770  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.49 
 
 		 535 aa  166  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1930  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.58 
 
 		 514 aa  164  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3697  carboxypeptidase C (cathepsin A)-like  29.64 
 
 		 536 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393293  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0540  peptidase S10 serine carboxypeptidase  29.4 
 
 		 536 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0516  peptidase S10, serine carboxypeptidase  29.07 
 
 		 536 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371742  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1336  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.1 
 
 		 533 aa  161  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2967  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.03 
 
 		 517 aa  160  4e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0347  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.33 
 
 		 521 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272983  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5174  putative peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.08 
 
 		 534 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3118  peptidase S10, serine carboxypeptidase  29.7 
 
 		 522 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.226388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5407  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.13 
 
 		 526 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1122  peptidase S10, serine carboxypeptidase  28.87 
 
 		 522 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3491  serine-type carboxypeptidase family protein  29.36 
 
 		 593 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0412  serine-type carboxypeptidase family protein  29.36 
 
 		 544 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.614642  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1272  serine-type carboxypeptidase family protein  29.36 
 
 		 544 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3454  serine carboxypeptidase family protein  29.36 
 
 		 544 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.489337  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3492  serine carboxypeptidase family protein  29.36 
 
 		 544 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547458  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3293  serine-type carboxypeptidase family protein  29.36 
 
 		 544 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0684  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.63 
 
 		 513 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0948758  normal  0.0161354 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2492  serine-type carboxypeptidase family protein  29.36 
 
 		 571 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0440  peptidase S10, serine carboxypeptidase  29.18 
 
 		 505 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.480832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0380  peptidase S10, serine carboxypeptidase  29.6 
 
 		 573 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>