139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1122 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2967  peptidase S10, serine carboxypeptidase  86.16 
 
 		 517 aa  832    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0440  peptidase S10, serine carboxypeptidase  66.59 
 
 		 505 aa  641    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.480832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3118  peptidase S10, serine carboxypeptidase  68.81 
 
 		 522 aa  660    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.226388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0380  peptidase S10, serine carboxypeptidase  61.94 
 
 		 573 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1122  peptidase S10, serine carboxypeptidase  100 
 
 		 522 aa  1052    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5174  putative peptidase S10, serine carboxypeptidase  67.9 
 
 		 534 aa  631  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0347  peptidase S10 serine carboxypeptidase  58.85 
 
 		 521 aa  628  1e-179  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272983  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1930  peptidase S10 serine carboxypeptidase  46.86 
 
 		 514 aa  445  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5563  peptidase S10 serine carboxypeptidase  50.22 
 
 		 519 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5407  peptidase S10 serine carboxypeptidase  50.22 
 
 		 526 aa  421  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5196  peptidase S10 serine carboxypeptidase  47.53 
 
 		 573 aa  413  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.574018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1336  peptidase S10 serine carboxypeptidase  46.9 
 
 		 533 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5118  peptidase S10 serine carboxypeptidase  46.83 
 
 		 573 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.302178 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4655  peptidase S10 serine carboxypeptidase  44.79 
 
 		 573 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3109  peptidase S10 serine carboxypeptidase  45.59 
 
 		 530 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1968  peptidase S10, serine carboxypeptidase  40.78 
 
 		 511 aa  357  3.9999999999999996e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.960831  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1444  peptidase S10 serine carboxypeptidase  40.53 
 
 		 498 aa  351  2e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00886012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00179  serine carboxypeptidase  37.19 
 
 		 490 aa  336  5.999999999999999e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.520034  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0563  peptidase S10 serine carboxypeptidase  40.04 
 
 		 508 aa  333  6e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.854374  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0609  carboxypeptidase related protein  39.04 
 
 		 503 aa  330  3e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4619  peptidase S10 serine carboxypeptidase  38.19 
 
 		 511 aa  256  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4351  peptidase S10 serine carboxypeptidase  36.99 
 
 		 510 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0684  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.62 
 
 		 513 aa  243  6e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0948758  normal  0.0161354 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32200  carboxypeptidase C (cathepsin A)  37.23 
 
 		 502 aa  240  5e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20738  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4660  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.03 
 
 		 494 aa  238  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.262908  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3773  peptidase S10, serine carboxypeptidase  35.46 
 
 		 504 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0601  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.05 
 
 		 492 aa  228  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.445118 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5433  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.07 
 
 		 590 aa  226  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.735441  normal  0.336053 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2114  peptidase S10, serine carboxypeptidase  33.33 
 
 		 514 aa  226  8e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000253475  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0681  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.78 
 
 		 493 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0213491  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04040  carboxypeptidase C (cathepsin A)  34.89 
 
 		 517 aa  219  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1207  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.41 
 
 		 502 aa  219  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.34234  normal  0.567138 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2090  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.12 
 
 		 510 aa  218  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0270  peptidase S10, serine carboxypeptidase  34.86 
 
 		 500 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.130085 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0889  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.85 
 
 		 516 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4319  peptidase S10, serine carboxypeptidase  33.2 
 
 		 524 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0745  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.98 
 
 		 499 aa  216  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.164421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3225  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.85 
 
 		 516 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.343617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0088  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.99 
 
 		 487 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1174  putative carboxypeptidase-related protein  33.05 
 
 		 573 aa  213  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80381  normal  0.157618 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3133  peptidase S10, serine carboxypeptidase  33.68 
 
 		 516 aa  213  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.631529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2128  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.47 
 
 		 514 aa  210  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000251865 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3329  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.49 
 
 		 513 aa  209  9e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1063  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.7 
 
 		 513 aa  209  9e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1649  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.41 
 
 		 494 aa  209  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0961  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.35 
 
 		 513 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1030  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.35 
 
 		 513 aa  206  9e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.531479  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1195  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.15 
 
 		 490 aa  202  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3304  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.27 
 
 		 544 aa  202  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169507  normal  0.0135899 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3077  peptidase S10, serine carboxypeptidase  34.2 
 
 		 533 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1993  carboxypeptidase  31.96 
 
 		 551 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.102988 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0603  serine carboxypeptidase  29.5 
 
 		 503 aa  197  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4003  peptidase S10, serine carboxypeptidase  29.76 
 
 		 561 aa  196  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2177  peptidase S10 serine carboxypeptidase  29.58 
 
 		 503 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1566  serine-type carboxypeptidase family protein  31.55 
 
 		 554 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0605  serine-type carboxypeptidase family protein  31.55 
 
 		 554 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4639  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.48 
 
 		 558 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2037  serine carboxypeptidase family protein  31.55 
 
 		 554 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.931228  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2200  serine carboxypeptidase family protein  31.55 
 
 		 554 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555603  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0716  serine carboxypeptidase family protein  31.55 
 
 		 554 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5055  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.58 
 
 		 554 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.666059 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4989  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.2 
 
 		 558 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0371  peptidase S10, serine carboxypeptidase  30.56 
 
 		 558 aa  190  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0812  serine-type carboxypeptidase family protein  30.84 
 
 		 554 aa  190  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2113  serine carboxypeptidase family protein  31.48 
 
 		 554 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3088  peptidase S10, serine carboxypeptidase  30.99 
 
 		 558 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816612  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5279  peptidase S10, serine carboxypeptidase  30.99 
 
 		 558 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5168  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.29 
 
 		 558 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.100052 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0118  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.26 
 
 		 492 aa  189  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4779  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.93 
 
 		 553 aa  189  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138285  hitchhiker  0.00136432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2414  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.14 
 
 		 494 aa  188  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.385514  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3442  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.63 
 
 		 558 aa  187  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01964  serine carboxypeptidase  30.16 
 
 		 531 aa  186  9e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.395984  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2223  serine-type carboxypeptidase family protein  30 
 
 		 585 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00580188  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3251  peptidase S10 serine carboxypeptidase  29.36 
 
 		 514 aa  185  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0975  serine carboxypeptidase family protein  30 
 
 		 575 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0883  serine carboxypeptidase family protein  30 
 
 		 575 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1554  serine-type carboxypeptidase family protein  30 
 
 		 575 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.505984  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0790  carboxypeptidase S1  29.17 
 
 		 481 aa  184  3e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1076  peptidase S10, serine carboxypeptidase  33.62 
 
 		 538 aa  179  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2026  serine-type carboxypeptidase family protein  30.8 
 
 		 615 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3198  serine-type carboxypeptidase family protein  30.8 
 
 		 615 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0888  serine-type carboxypeptidase family protein  30.8 
 
 		 615 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2721  serine-type carboxypeptidase family protein  30.8 
 
 		 615 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3144  serine carboxypeptidase family protein  30.8 
 
 		 619 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.875872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3181  carboxypeptidase C  30.8 
 
 		 615 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.961281  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1888  serine-type carboxypeptidase family protein  30.8 
 
 		 615 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1082  peptidase S10, serine carboxypeptidase  30.13 
 
 		 517 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1758  putative carboxypeptidase  30.75 
 
 		 536 aa  177  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1421  serine-type carboxypeptidase family protein  30.21 
 
 		 613 aa  177  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1003  carboxypeptidase  31.04 
 
 		 543 aa  176  9e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.199137  normal  0.422421 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3119  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.39 
 
 		 581 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.83327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2770  peptidase S10 serine carboxypeptidase  29.5 
 
 		 535 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0583  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.28 
 
 		 536 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0131584 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0132  peptidase S10, serine carboxypeptidase  30.06 
 
 		 536 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0295121  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4747  peptidase S10, serine carboxypeptidase  29.69 
 
 		 615 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0615  peptidase S10, serine carboxypeptidase  30.06 
 
 		 536 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.218301  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3420  peptidase S10, serine carboxypeptidase  29.69 
 
 		 615 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5084  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.72 
 
 		 500 aa  171  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.110686  normal  0.189262 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4097  peptidase S10 serine carboxypeptidase  29.69 
 
 		 589 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.902056 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>