129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1076 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1076  peptidase S10, serine carboxypeptidase  100 
 
 		 538 aa  1091    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0270  peptidase S10, serine carboxypeptidase  34.02 
 
 		 500 aa  231  3e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.130085 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3119  peptidase S10, serine carboxypeptidase  34.43 
 
 		 581 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.83327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2417  peptidase S10, serine carboxypeptidase  35.34 
 
 		 497 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0660734  normal  0.0714055 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2414  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.03 
 
 		 494 aa  211  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.385514  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1082  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.44 
 
 		 517 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3773  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.12 
 
 		 504 aa  207  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1195  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.14 
 
 		 490 aa  205  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5433  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.78 
 
 		 590 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.735441  normal  0.336053 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1174  putative carboxypeptidase-related protein  32.18 
 
 		 573 aa  196  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80381  normal  0.157618 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5084  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.61 
 
 		 500 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.110686  normal  0.189262 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0745  peptidase S10, serine carboxypeptidase  30.32 
 
 		 499 aa  188  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.164421 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0380  peptidase S10, serine carboxypeptidase  34.11 
 
 		 573 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0440  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.25 
 
 		 505 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.480832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3304  peptidase S10 serine carboxypeptidase  29.27 
 
 		 544 aa  181  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169507  normal  0.0135899 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2967  peptidase S10, serine carboxypeptidase  34.84 
 
 		 517 aa  180  4.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1122  peptidase S10, serine carboxypeptidase  33.62 
 
 		 522 aa  179  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0088  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.49 
 
 		 487 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0889  peptidase S10, serine carboxypeptidase  28.54 
 
 		 516 aa  177  6e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0961  peptidase S10 serine carboxypeptidase  28.51 
 
 		 513 aa  177  6e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3077  peptidase S10, serine carboxypeptidase  29.45 
 
 		 533 aa  177  6e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3225  peptidase S10, serine carboxypeptidase  28.54 
 
 		 516 aa  176  7e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.343617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1030  peptidase S10 serine carboxypeptidase  27.75 
 
 		 513 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.531479  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1063  peptidase S10 serine carboxypeptidase  28.51 
 
 		 513 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3329  peptidase S10 serine carboxypeptidase  28.78 
 
 		 513 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3133  peptidase S10, serine carboxypeptidase  28.33 
 
 		 516 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.631529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5080  peptidase S10 serine carboxypeptidase  37.81 
 
 		 417 aa  174  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  unclonable  0.000000000112364  normal  0.0461552 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1930  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.24 
 
 		 514 aa  174  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1207  peptidase S10 serine carboxypeptidase  28.72 
 
 		 502 aa  174  5e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.34234  normal  0.567138 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0347  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.45 
 
 		 521 aa  174  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272983  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0603  serine carboxypeptidase  29.01 
 
 		 503 aa  170  6e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4003  peptidase S10, serine carboxypeptidase  29.18 
 
 		 561 aa  168  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0681  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.84 
 
 		 493 aa  166  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0213491  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3118  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.63 
 
 		 522 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.226388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0601  peptidase S10 serine carboxypeptidase  28.35 
 
 		 492 aa  165  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.445118 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0132  peptidase S10, serine carboxypeptidase  27.73 
 
 		 536 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0295121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0615  peptidase S10, serine carboxypeptidase  27.73 
 
 		 536 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.218301  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0583  peptidase S10 serine carboxypeptidase  27.73 
 
 		 536 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0131584 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04040  carboxypeptidase C (cathepsin A)  28.19 
 
 		 517 aa  160  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5174  putative peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.24 
 
 		 534 aa  160  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2090  peptidase S10 serine carboxypeptidase  29.11 
 
 		 510 aa  160  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1993  carboxypeptidase  30.5 
 
 		 551 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.102988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5407  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.93 
 
 		 526 aa  158  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0540  peptidase S10 serine carboxypeptidase  27.82 
 
 		 536 aa  156  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3697  carboxypeptidase C (cathepsin A)-like  27.04 
 
 		 536 aa  156  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393293  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2128  peptidase S10 serine carboxypeptidase  29.58 
 
 		 514 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000251865 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32200  carboxypeptidase C (cathepsin A)  30.79 
 
 		 502 aa  155  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20738  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2770  peptidase S10 serine carboxypeptidase  28.27 
 
 		 535 aa  155  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4779  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.5 
 
 		 553 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138285  hitchhiker  0.00136432 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0516  peptidase S10, serine carboxypeptidase  27.04 
 
 		 536 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371742  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3251  peptidase S10 serine carboxypeptidase  28.21 
 
 		 514 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4351  peptidase S10 serine carboxypeptidase  28.17 
 
 		 510 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5563  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.62 
 
 		 519 aa  151  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5118  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.13 
 
 		 573 aa  151  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.302178 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4660  peptidase S10 serine carboxypeptidase  28.92 
 
 		 494 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.262908  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5055  peptidase S10 serine carboxypeptidase  28.95 
 
 		 554 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.666059 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1336  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.15 
 
 		 533 aa  146  9e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4655  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.17 
 
 		 573 aa  146  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1649  peptidase S10 serine carboxypeptidase  29.69 
 
 		 494 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5196  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.72 
 
 		 573 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.574018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0812  serine-type carboxypeptidase family protein  29.62 
 
 		 554 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4319  peptidase S10, serine carboxypeptidase  26.72 
 
 		 524 aa  140  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3491  serine-type carboxypeptidase family protein  26 
 
 		 593 aa  140  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2492  serine-type carboxypeptidase family protein  26 
 
 		 571 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1758  putative carboxypeptidase  29.29 
 
 		 536 aa  140  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0412  serine-type carboxypeptidase family protein  25.89 
 
 		 544 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.614642  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1272  serine-type carboxypeptidase family protein  25.89 
 
 		 544 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3454  serine carboxypeptidase family protein  25.89 
 
 		 544 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.489337  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3492  serine carboxypeptidase family protein  25.89 
 
 		 544 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547458  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3293  serine-type carboxypeptidase family protein  25.89 
 
 		 544 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1173  serine-type carboxypeptidase family protein  25.79 
 
 		 588 aa  139  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1968  peptidase S10, serine carboxypeptidase  27.47 
 
 		 511 aa  138  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.960831  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4639  peptidase S10, serine carboxypeptidase  27.05 
 
 		 558 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3442  peptidase S10 serine carboxypeptidase  27.46 
 
 		 558 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4619  peptidase S10 serine carboxypeptidase  27.96 
 
 		 511 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2114  peptidase S10, serine carboxypeptidase  28.63 
 
 		 514 aa  137  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000253475  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5168  peptidase S10 serine carboxypeptidase  27.5 
 
 		 558 aa  137  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.100052 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00179  serine carboxypeptidase  27.52 
 
 		 490 aa  136  8e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.520034  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2177  peptidase S10 serine carboxypeptidase  27.07 
 
 		 503 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0561  serine-type carboxypeptidase family protein  27.18 
 
 		 549 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0326  serine-type carboxypeptidase family protein  27.12 
 
 		 567 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0373  serine carboxypeptidase family protein  27.18 
 
 		 563 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.250878  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0393  serine carboxypeptidase family protein  27.18 
 
 		 563 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0118  peptidase S10 serine carboxypeptidase  27.79 
 
 		 492 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0684  peptidase S10 serine carboxypeptidase  29.12 
 
 		 513 aa  136  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0948758  normal  0.0161354 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01964  serine carboxypeptidase  27.02 
 
 		 531 aa  135  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.395984  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0371  peptidase S10, serine carboxypeptidase  27.97 
 
 		 558 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3088  peptidase S10, serine carboxypeptidase  26.95 
 
 		 558 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816612  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5279  peptidase S10, serine carboxypeptidase  26.95 
 
 		 558 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1444  peptidase S10 serine carboxypeptidase  28.79 
 
 		 498 aa  133  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00886012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2113  serine carboxypeptidase family protein  28.57 
 
 		 554 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0869  peptidase S10 serine carboxypeptidase  27.45 
 
 		 614 aa  133  9e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510617  normal  0.442404 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3109  peptidase S10 serine carboxypeptidase  28.68 
 
 		 530 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4989  peptidase S10 serine carboxypeptidase  26.99 
 
 		 558 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1566  serine-type carboxypeptidase family protein  28.36 
 
 		 554 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0605  serine-type carboxypeptidase family protein  28.36 
 
 		 554 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2037  serine carboxypeptidase family protein  28.36 
 
 		 554 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.931228  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2200  serine carboxypeptidase family protein  28.36 
 
 		 554 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555603  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0716  serine carboxypeptidase family protein  28.36 
 
 		 554 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0934  peptidase S10 serine carboxypeptidase  27.45 
 
 		 613 aa  131  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0917831 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>