118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0677 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0296  Ig family protein  32.78 
 
 		 1699 aa  670    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.112212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0905  Ig family protein  74.88 
 
 		 3230 aa  4705    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0677  Ig family protein  100 
 
 		 3222 aa  6396    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2052  Ig family protein  28.83 
 
 		 2506 aa  479  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.504555  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3767  hemolysin-type calcium-binding region  30.1 
 
 		 1757 aa  97.4  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.902425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  34.54 
 
 		 2001 aa  90.5  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  40.74 
 
 		 2132 aa  79.7  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  38.57 
 
 		 3089 aa  77.8  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  27.57 
 
 		 3477 aa  77.8  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  37.5 
 
 		 16311 aa  77  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  35 
 
 		 3391 aa  70.9  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  34.67 
 
 		 6678 aa  67  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  33.54 
 
 		 8871 aa  66.6  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  29.25 
 
 		 3598 aa  64.3  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  28.53 
 
 		 2853 aa  63.2  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6529  6-phosphogluconolactonase  24.13 
 
 		 359 aa  62.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111343  normal  0.102663 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0432  putative cycloisomerase  25.29 
 
 		 381 aa  62.4  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.54 
 
 		 11716 aa  61.2  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  25.71 
 
 		 2820 aa  59.7  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  53.57 
 
 		 2402 aa  58.5  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4373  6-phosphogluconolactonase  25.43 
 
 		 404 aa  58.2  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.432852 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0020  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.65 
 
 		 521 aa  58.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0127  putative hemagglutinin-related protein  24.88 
 
 		 480 aa  58.2  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  25.84 
 
 		 2807 aa  58.2  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4374  Ig family protein  35.29 
 
 		 731 aa  57.8  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6297  hypothetical protein  25.31 
 
 		 367 aa  57.4  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2636  6-phosphogluconolactonase  28.65 
 
 		 349 aa  57.4  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  36.36 
 
 		 4465 aa  56.6  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_003296  RS01887  putative hemagglutinin-related protein  25.11 
 
 		 446 aa  55.5  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  36.79 
 
 		 1019 aa  55.5  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5727  6-phosphogluconolactonase  27.91 
 
 		 373 aa  54.3  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0610515 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0025  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.03 
 
 		 522 aa  53.9  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.932986 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09550  hypothetical protein  26.48 
 
 		 388 aa  53.5  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  37 
 
 		 4231 aa  53.5  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2139  6-phosphogluconolactonase  25.16 
 
 		 376 aa  53.1  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  39.8 
 
 		 1728 aa  53.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2435  6-phosphogluconolactonase  24.78 
 
 		 353 aa  52.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2878  6-phosphogluconolactonase  22.07 
 
 		 331 aa  52.4  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1280  6-phosphogluconolactonase  26.26 
 
 		 332 aa  52.8  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  46.58 
 
 		 5020 aa  52  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3101  6-phosphogluconolactonase  25.93 
 
 		 355 aa  51.6  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1242  6-phosphogluconolactonase  25.07 
 
 		 431 aa  52.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  30.87 
 
 		 2337 aa  51.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2467  hypothetical protein  27.1 
 
 		 351 aa  51.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  25.54 
 
 		 7284 aa  50.8  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  31.33 
 
 		 2954 aa  50.8  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4498  Ig family protein  36.61 
 
 		 1232 aa  50.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1446  hypothetical protein  27.1 
 
 		 372 aa  50.4  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0577  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.79 
 
 		 652 aa  50.4  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0497  3-carboxymuconate cyclase-like protein  27.95 
 
 		 372 aa  50.4  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0975  hypothetical protein  23.64 
 
 		 411 aa  50.1  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0894  hypothetical protein  25.78 
 
 		 388 aa  50.1  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.503545  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1307  6-phosphogluconolactonase  28.12 
 
 		 331 aa  50.1  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  25.33 
 
 		 1667 aa  49.7  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2875  6-phosphogluconolactonase  22.74 
 
 		 331 aa  49.7  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000192963  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.74 
 
 		 815 aa  49.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3077  hypothetical protein  26.2 
 
 		 354 aa  49.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1341  YkgB  27.27 
 
 		 411 aa  48.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3304  hypothetical protein  26.98 
 
 		 385 aa  49.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1710  3-carboxymuconate cyclase-like  27.98 
 
 		 415 aa  49.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6571  Ig family protein  36.9 
 
 		 1342 aa  49.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00409169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  40.74 
 
 		 9867 aa  48.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4420  hypothetical protein  37 
 
 		 912 aa  49.3  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0816667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  35.79 
 
 		 1030 aa  49.7  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2322  3-carboxymuconate cyclase-like protein  27.98 
 
 		 415 aa  49.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400983  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_50000  polarity establishment/cellular polarization  29.55 
 
 		 893 aa  48.9  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.457642 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1183  hypothetical protein  27.27 
 
 		 411 aa  48.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2451  6-phosphogluconolactonase  30.26 
 
 		 370 aa  49.3  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0821  6-phosphogluconolactonase  22.74 
 
 		 331 aa  49.7  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0794  6-phosphogluconolactonase  22.74 
 
 		 331 aa  49.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1703  hypothetical protein  25.67 
 
 		 357 aa  49.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0955  6-phosphogluconolactonase  23.78 
 
 		 414 aa  49.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1100  hemolysin-type calcium-binding region  30.05 
 
 		 2345 aa  48.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.400206 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2895  6-phosphogluconolactonase  22.74 
 
 		 331 aa  49.7  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0212096  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2345  6-phosphogluconolactonase  27.98 
 
 		 415 aa  49.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  0.056194 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0870  6-phosphogluconolactonase  22.74 
 
 		 331 aa  49.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.923761 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5526  6-phosphogluconolactonase  25.52 
 
 		 375 aa  49.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1181  6-phosphogluconolactonase  26.37 
 
 		 329 aa  48.9  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3325  6-phosphogluconolactonase  22.26 
 
 		 386 aa  49.3  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3160  hypothetical protein  25.67 
 
 		 355 aa  48.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1926  hypothetical protein  27.27 
 
 		 411 aa  48.9  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.012606  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1637  VCBS  38.55 
 
 		 2127 aa  48.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3481  6-phosphogluconolactonase  24.57 
 
 		 386 aa  48.9  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  45.07 
 
 		 8321 aa  48.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1030  hypothetical protein  27.27 
 
 		 391 aa  48.5  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0837  hypothetical protein  27.27 
 
 		 411 aa  48.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1191  hypothetical protein  27.27 
 
 		 391 aa  48.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333558  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0313  hypothetical protein  27.27 
 
 		 391 aa  48.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2784  hypothetical protein  25.5 
 
 		 436 aa  48.5  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.562572 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2090  6-phosphogluconolactonase  25 
 
 		 385 aa  48.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3051  6-phosphogluconolactonase  29.87 
 
 		 332 aa  48.9  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3378  putative hemaggltinin-related protein  24.92 
 
 		 412 aa  48.5  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3406  hypothetical protein  25.93 
 
 		 355 aa  48.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682955  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2678  cell wall anchor domain-containing protein  43.55 
 
 		 2271 aa  48.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2734  cell wall anchor domain-containing protein  43.55 
 
 		 2271 aa  48.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6877  6-phosphogluconolactonase  21.31 
 
 		 414 aa  47.8  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0754245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4878  PKD domain containing protein  42.67 
 
 		 1081 aa  48.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3396  hypothetical protein  24.69 
 
 		 354 aa  48.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2765  hypothetical protein  20.48 
 
 		 359 aa  47.8  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122713  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2591  6-phosphogluconolactonase  22.87 
 
 		 331 aa  47.8  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>