More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_10831 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0645  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  42.82 
 
 		 1261 aa  998    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1410  exodeoxyribonuclease V, beta subunit RecB  40.62 
 
 		 1208 aa  949    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.828955  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1651  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  40.95 
 
 		 1226 aa  927    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09621  UvrD/REP helicase subunit B  46.94 
 
 		 1274 aa  1189    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.484397 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10831  UvrD/REP helicase subunit B  100 
 
 		 1265 aa  2597    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.261186  normal  0.314032 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14771  UvrD/REP helicase subunit B  42.62 
 
 		 1261 aa  1001    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.248766 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11941  UvrD/REP helicase subunit B  31.71 
 
 		 1212 aa  525  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1114  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  30.78 
 
 		 1208 aa  509  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0953517  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12101  UvrD/REP helicase subunit B  30.1 
 
 		 1208 aa  506  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0372  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.09 
 
 		 1168 aa  332  4e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0389874  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0681  exodeoxyribonuclease V beta chain  26.57 
 
 		 1208 aa  317  9.999999999999999e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.112115  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1904  exodeoxyribonuclease V, 135 kDa subunit  26.81 
 
 		 1208 aa  311  4e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1055  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.78 
 
 		 1203 aa  306  1.0000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0769  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.24 
 
 		 1207 aa  300  1e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0691  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.15 
 
 		 1200 aa  289  2e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002685  exodeoxyribonuclease V beta chain  24.92 
 
 		 1224 aa  289  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3232  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.6 
 
 		 1240 aa  289  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0067022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03301  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  25.38 
 
 		 1212 aa  286  2.0000000000000002e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2838  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.53 
 
 		 1230 aa  281  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.506585  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2429  Exodeoxyribonuclease V  25.56 
 
 		 1148 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.765298  hitchhiker  0.0020094 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10641  exonuclease V beta subunit recB  26.58 
 
 		 1094 aa  273  1e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000417929  normal  0.0791919 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3231  exonuclease V subunit beta  25.98 
 
 		 1220 aa  272  2.9999999999999997e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3007  exonuclease V subunit beta  26.13 
 
 		 1189 aa  272  2.9999999999999997e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0991  exonuclease V subunit beta  25.98 
 
 		 1220 aa  272  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1043  exonuclease V subunit beta  25.98 
 
 		 1220 aa  272  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2025  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.74 
 
 		 1224 aa  271  4e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1614  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.6 
 
 		 1232 aa  268  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0364449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2746  Exodeoxyribonuclease V  27.41 
 
 		 1134 aa  268  4e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0993  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.46 
 
 		 1125 aa  267  8.999999999999999e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00861563  normal  0.126412 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0906  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.83 
 
 		 1115 aa  266  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.025647 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1459  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.69 
 
 		 1226 aa  263  1e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0900  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.63 
 
 		 1115 aa  263  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274913  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0917  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.63 
 
 		 1115 aa  263  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.45261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3907  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.59 
 
 		 1139 aa  261  9e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0574999  normal  0.0165259 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1270  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.45 
 
 		 1240 aa  260  2e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02668  exonuclease V (RecBCD complex), beta subunit  24.68 
 
 		 1180 aa  258  4e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.501353  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02629  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1180 aa  258  4e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.447852  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1748  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.25 
 
 		 1241 aa  257  8e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1209  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.2 
 
 		 1097 aa  257  9e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686656 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51710  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.97 
 
 		 1226 aa  257  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0871  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.6 
 
 		 1180 aa  254  6e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0895  exonuclease V subunit beta  24.6 
 
 		 1180 aa  254  6e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.861993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2966  exonuclease V subunit beta  24.6 
 
 		 1180 aa  254  6e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3140  exonuclease V subunit beta  24.22 
 
 		 1180 aa  254  7e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2149  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.9 
 
 		 1203 aa  253  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.277093  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0681  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.75 
 
 		 1230 aa  253  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.639627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1981  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.09 
 
 		 1259 aa  252  3e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.335433  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5130  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.57 
 
 		 1109 aa  252  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.915993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0344  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.85 
 
 		 1130 aa  251  8e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2295  Exodeoxyribonuclease V  28.18 
 
 		 1110 aa  249  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0252  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.37 
 
 		 1111 aa  249  3e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103947  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0689  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.69 
 
 		 1229 aa  248  6e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0221198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0324  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.37 
 
 		 1129 aa  246  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.904758 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1098  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.84 
 
 		 1234 aa  244  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0918971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0761  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.33 
 
 		 1223 aa  243  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.238035  normal  0.093599 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1098  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.89 
 
 		 1234 aa  243  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4671  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.67 
 
 		 1224 aa  243  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000828259 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0579  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.97 
 
 		 1085 aa  241  6.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2111  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.93 
 
 		 1251 aa  238  4e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1534  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.51 
 
 		 1204 aa  238  5.0000000000000005e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3373  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.9 
 
 		 1132 aa  237  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.665127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4537  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.06 
 
 		 1224 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.227788  normal  0.354601 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4323  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.65 
 
 		 1236 aa  235  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.182798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0997  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.36 
 
 		 1203 aa  235  5e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0929  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.22 
 
 		 1216 aa  234  9e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4673  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.03 
 
 		 1224 aa  234  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1188  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.7 
 
 		 1235 aa  231  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.513756  normal  0.625115 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2352  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.63 
 
 		 1355 aa  231  6e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1215  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.8 
 
 		 1235 aa  231  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.513189  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0735  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.8 
 
 		 2007 aa  231  9e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2088  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.18 
 
 		 1236 aa  228  8e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1893  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.21 
 
 		 1200 aa  227  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000174869 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2130  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.06 
 
 		 1223 aa  225  4.9999999999999996e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0521  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.85 
 
 		 1274 aa  219  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558508 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1169  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.52 
 
 		 1269 aa  219  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1359  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.88 
 
 		 1226 aa  214  9e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.182882  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3814  exonuclease V subunit beta  26.98 
 
 		 1183 aa  212  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.0108471 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0777  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.23 
 
 		 1230 aa  209  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1901  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.14 
 
 		 1224 aa  209  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1401  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.61 
 
 		 1221 aa  206  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2291  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.75 
 
 		 1273 aa  202  5e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2279  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.81 
 
 		 1273 aa  201  6e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4565  hypothetical protein  26.81 
 
 		 1273 aa  201  6e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2094  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.62 
 
 		 1273 aa  201  7e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.780628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1433  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.66 
 
 		 1199 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2047  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.28 
 
 		 1273 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.680974  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3389  exonuclease V subunit beta  25.89 
 
 		 1203 aa  201  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1986  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.68 
 
 		 1209 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0259297  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1936  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.98 
 
 		 1251 aa  199  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1624  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.56 
 
 		 1240 aa  197  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.547512  normal  0.545211 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0914  exonuclease V subunit beta  25.95 
 
 		 1194 aa  197  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3263  exonuclease V subunit beta  25.2 
 
 		 1181 aa  197  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1852  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.35 
 
 		 1269 aa  195  6e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3042  exonuclease V subunit beta  25.63 
 
 		 1180 aa  194  7e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2642  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.31 
 
 		 1229 aa  194  9e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12091  UvrD/REP helicase subunit B  37.7 
 
 		 1208 aa  194  1e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2420  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.6 
 
 		 1238 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415139  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2967  exonuclease V subunit beta  25.43 
 
 		 1170 aa  190  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.483472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4085  exonuclease V subunit beta  25.28 
 
 		 1180 aa  190  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1757  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.57 
 
 		 1320 aa  190  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>