285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_03991 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_03991  lipoate-protein ligase B  100 
 
 
235 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.28494  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21401  lipoate-protein ligase B  58.72 
 
 
253 aa  286  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04531  lipoate-protein ligase B  56.6 
 
 
244 aa  276  2e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.406399  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1736  lipoate-protein ligase B  56.17 
 
 
239 aa  276  2e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2012  lipoate-protein ligase B  53.42 
 
 
232 aa  263  2e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0659  lipoate-protein ligase B  56.81 
 
 
229 aa  257  1e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  49.01 
 
 
239 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  48.51 
 
 
239 aa  204  7e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04631  lipoate-protein ligase B  45.37 
 
 
214 aa  199  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.451371  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  43.91 
 
 
227 aa  197  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  46.94 
 
 
213 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04211  lipoate-protein ligase B  43.33 
 
 
216 aa  195  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00670281  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04521  lipoate-protein ligase B  43.81 
 
 
216 aa  194  9e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  45.69 
 
 
233 aa  191  9e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  43.94 
 
 
221 aa  191  9e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  43.9 
 
 
230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0397  lipoate-protein ligase B  46.41 
 
 
216 aa  181  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.135872  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  44.27 
 
 
202 aa  176  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51519  lipoate-protein ligase  50 
 
 
167 aa  157  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.313416  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7617  predicted protein  42.93 
 
 
186 aa  149  3e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  43.55 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  36.92 
 
 
231 aa  140  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  36.4 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  37.44 
 
 
259 aa  137  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  39.01 
 
 
209 aa  137  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  38.61 
 
 
207 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  34.76 
 
 
241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51454  lipoate-protein ligase  44.87 
 
 
157 aa  132  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.444704  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  40 
 
 
213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  45.39 
 
 
211 aa  132  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  36.41 
 
 
231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  40.68 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  37.16 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  37.63 
 
 
233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  35.75 
 
 
238 aa  129  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  38.62 
 
 
240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  33.18 
 
 
236 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  36.11 
 
 
232 aa  126  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  37.5 
 
 
241 aa  125  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  47.33 
 
 
227 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  33.19 
 
 
262 aa  123  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  37.91 
 
 
225 aa  123  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  36.36 
 
 
245 aa  123  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0719  lipoate-protein ligase B  41.21 
 
 
204 aa  123  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.24811e-18 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1621  lipoate-protein ligase B  39.16 
 
 
239 aa  122  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00888371  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  33.78 
 
 
240 aa  122  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  32.46 
 
 
262 aa  122  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  44.14 
 
 
212 aa  122  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  38.67 
 
 
221 aa  121  9e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  31.36 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0288  lipoate-protein ligase B  37.35 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0707  lipoate-protein ligase B  41.99 
 
 
204 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1731  lipoyltransferase  35.56 
 
 
231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.558674  normal  0.523049 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0665  lipoate-protein ligase B  36.61 
 
 
212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5311  lipoate-protein ligase B  37.22 
 
 
235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  30.49 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  34.12 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  31.36 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  32.35 
 
 
243 aa  119  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1252  lipoyltransferase  35.83 
 
 
216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.33407 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  36.69 
 
 
237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  36.31 
 
 
222 aa  119  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1087  lipoate-protein ligase B  32.95 
 
 
229 aa  118  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.183357  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4359  lipoate-protein ligase B  34.3 
 
 
218 aa  118  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100426  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1014  lipoate-protein ligase B  32.51 
 
 
205 aa  118  7e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.449501  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3026  lipoate-protein ligase B  33.72 
 
 
233 aa  118  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0519842  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  36.84 
 
 
236 aa  118  7e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2954  lipoate-protein ligase B  33.14 
 
 
233 aa  118  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000757866  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  35.29 
 
 
243 aa  118  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  35.55 
 
 
213 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3348  lipoate-protein ligase B  37.36 
 
 
247 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1854  lipoate-protein ligase B  33.72 
 
 
232 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  36.87 
 
 
216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1756  lipoate-protein ligase B  31.09 
 
 
227 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1745  lipoate-protein ligase B  40.45 
 
 
226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548162  normal  0.138545 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1871  lipoate-protein ligase B  32.38 
 
 
237 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal  0.0798648 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  34.2 
 
 
228 aa  116  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  38.71 
 
 
212 aa  116  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0244  lipoate-protein ligase B  39.33 
 
 
222 aa  116  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  35.29 
 
 
220 aa  116  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  39.29 
 
 
223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  37.04 
 
 
383 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12245  lipoate-protein ligase B  39.89 
 
 
230 aa  115  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155606  normal  0.410029 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1936  lipoyltransferase  35.16 
 
 
218 aa  115  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00922586 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4819  lipoate-protein ligase B  33.17 
 
 
218 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2074  lipoate-protein ligase B  34.57 
 
 
237 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2371  lipoate-protein ligase B  34.81 
 
 
255 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417087  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  34.95 
 
 
213 aa  115  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  37.31 
 
 
251 aa  114  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2630  lipoate-protein ligase B  36.17 
 
 
224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  36.41 
 
 
244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  36.41 
 
 
244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  32.08 
 
 
244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3083  lipoate-protein ligase B  34.97 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  39.49 
 
 
217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2075  lipoate-protein ligase B  32.99 
 
 
237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0179  lipoate-protein ligase B  35.11 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.799971  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0528  lipoate-protein ligase B  34.41 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0927  lipoate-protein ligase B  36.36 
 
 
221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.257939  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  34.68 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.896037 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>