More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2878 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2878  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 425 aa  862    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0189  cystathionine gamma-synthase  43.85 
 
 		 425 aa  287  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4095  cystathionine gamma-synthase  44.42 
 
 		 413 aa  288  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0121  cystathionine gamma-synthase  45 
 
 		 386 aa  287  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0177  cystathionine gamma-synthase  43.6 
 
 		 386 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3807  cystathionine gamma-synthase  44.74 
 
 		 386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  39.14 
 
 		 394 aa  283  5.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  44.36 
 
 		 426 aa  282  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3791  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  42.82 
 
 		 386 aa  281  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  43.85 
 
 		 426 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  38.17 
 
 		 390 aa  280  4e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  45.07 
 
 		 386 aa  279  7e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  41.79 
 
 		 378 aa  279  8e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4035  cystathionine gamma-synthase  42.19 
 
 		 386 aa  278  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  43.59 
 
 		 426 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0120  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  43.48 
 
 		 386 aa  276  4e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0592  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  46.51 
 
 		 394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.19345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  42.24 
 
 		 378 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4479  cystathionine gamma-synthase  42.08 
 
 		 386 aa  272  7e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.146972  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  41.9 
 
 		 396 aa  272  7e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0615  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.76 
 
 		 390 aa  272  7e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4381  cystathionine gamma-synthase  41.78 
 
 		 386 aa  272  9e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.89633 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4431  cystathionine gamma-synthase  41.51 
 
 		 386 aa  272  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03825  cystathionine gamma-synthase  42.08 
 
 		 386 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4046  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  42.08 
 
 		 386 aa  272  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0520  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  44.51 
 
 		 388 aa  272  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4501  cystathionine gamma-synthase  41.51 
 
 		 386 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0840458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4076  cystathionine gamma-synthase  42.08 
 
 		 386 aa  272  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4434  cystathionine gamma-synthase  41.51 
 
 		 386 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03774  hypothetical protein  42.08 
 
 		 386 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  38.62 
 
 		 392 aa  272  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4172  cystathionine gamma-synthase  42.08 
 
 		 386 aa  272  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4347  cystathionine gamma-synthase  41.51 
 
 		 386 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  39.8 
 
 		 383 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5399  cystathionine gamma-synthase  42.08 
 
 		 386 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.735878 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4425  cystathionine gamma-synthase  41.82 
 
 		 386 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4317  cystathionine gamma-synthase  41.51 
 
 		 386 aa  270  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  41.18 
 
 		 399 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.1 
 
 		 392 aa  266  7e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  39.69 
 
 		 400 aa  265  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.71 
 
 		 404 aa  264  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  41.18 
 
 		 391 aa  265  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.71 
 
 		 404 aa  264  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3551  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  42.94 
 
 		 389 aa  264  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  39.78 
 
 		 392 aa  263  3e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2537  cystathionine gamma-synthase  42.2 
 
 		 410 aa  263  4e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.83 
 
 		 389 aa  263  4.999999999999999e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  37.88 
 
 		 399 aa  263  4.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3439  cystathionine gamma-synthase  40.45 
 
 		 393 aa  263  6e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3196  cystathionine gamma-synthase  42.46 
 
 		 426 aa  262  8e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0163  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  43.36 
 
 		 387 aa  262  8e-69  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3614  cystathionine gamma-synthase  40.45 
 
 		 393 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5069  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  45.91 
 
 		 385 aa  262  8.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  41.16 
 
 		 397 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  40.91 
 
 		 392 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1985  cystathionine gamma-synthase  44.19 
 
 		 405 aa  261  2e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.674412  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.02 
 
 		 386 aa  261  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0622  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.29 
 
 		 388 aa  260  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2664  cystathionine gamma-synthase  39.59 
 
 		 393 aa  260  3e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4786  cystathionine gamma-synthase  41.93 
 
 		 386 aa  260  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000330787 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3055  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.66 
 
 		 394 aa  260  3e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1914  cystathionine gamma-synthase  44.25 
 
 		 400 aa  260  3e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.145632  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  41.16 
 
 		 397 aa  260  4e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  36.84 
 
 		 391 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4056  cystathionine gamma-synthase  40.1 
 
 		 393 aa  259  6e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  37.2 
 
 		 392 aa  259  6e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  39.85 
 
 		 397 aa  259  6e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  40 
 
 		 393 aa  259  7e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  36.11 
 
 		 397 aa  259  7e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  37.66 
 
 		 399 aa  259  7e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  37.18 
 
 		 385 aa  259  7e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  37.2 
 
 		 392 aa  259  8e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  40.97 
 
 		 397 aa  259  8e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  37.4 
 
 		 392 aa  259  8e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  36.77 
 
 		 392 aa  259  8e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  40.9 
 
 		 397 aa  259  9e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  37.4 
 
 		 392 aa  259  9e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  41.19 
 
 		 397 aa  258  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  38.89 
 
 		 390 aa  258  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  40.82 
 
 		 418 aa  258  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  39.53 
 
 		 381 aa  258  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0512  cystathionine gamma-synthase  39.95 
 
 		 393 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.920975  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  39.57 
 
 		 413 aa  258  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0564  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.55 
 
 		 387 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00049  cystathionine gamma-synthase  41.72 
 
 		 386 aa  257  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3154  cystathionine gamma-synthase  47.23 
 
 		 390 aa  257  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3776  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.55 
 
 		 387 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  39.33 
 
 		 392 aa  258  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.55 
 
 		 387 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0328  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  44.44 
 
 		 385 aa  258  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0116311 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2256  cystathionine gamma-synthase  42.6 
 
 		 388 aa  257  3e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0684  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  43.99 
 
 		 422 aa  257  3e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228137  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  39.85 
 
 		 397 aa  257  3e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0809  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.67 
 
 		 397 aa  256  4e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  35.25 
 
 		 393 aa  256  4e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  40.63 
 
 		 397 aa  256  4e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  41.57 
 
 		 382 aa  256  4e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  39.59 
 
 		 397 aa  256  4e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  40.91 
 
 		 391 aa  256  5e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  40.87 
 
 		 394 aa  256  6e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>