More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3018 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0188  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  85.11 
 
 
376 aa  642    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3018  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  100 
 
 
376 aa  749    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.559203  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0170  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  85.11 
 
 
376 aa  640    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.135886  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0420  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  56.46 
 
 
373 aa  396  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.019387  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0510  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  53.76 
 
 
373 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0121409 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0465  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  53.2 
 
 
373 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238845  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0404  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  51.08 
 
 
377 aa  352  7e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.133547  normal  0.0561317 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5795  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  53.85 
 
 
372 aa  345  5e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.831254  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4117  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  39.24 
 
 
385 aa  229  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2565  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  39.88 
 
 
390 aa  227  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.461378  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1846  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  38.95 
 
 
385 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000726333 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1341  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  40.23 
 
 
382 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.354944  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3187  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  39.38 
 
 
395 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1681  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  39.09 
 
 
386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4746  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  39.48 
 
 
392 aa  217  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.934073 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4717  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  39.56 
 
 
388 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.413844  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0599  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  37.96 
 
 
392 aa  212  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.38894  normal  0.541606 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2646  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.87 
 
 
378 aa  203  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4292  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.18 
 
 
380 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  0.0362525 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4934  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  35.9 
 
 
379 aa  193  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1777  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.29 
 
 
387 aa  192  8e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253476  normal  0.1933 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1498  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.29 
 
 
387 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.694394  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1775  tRNA synthetase class II (G H P and S)  36.39 
 
 
379 aa  191  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349459  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1499  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.96 
 
 
387 aa  184  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.355503  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0804  tRNA synthetase class II (G H P and S)  37.07 
 
 
371 aa  181  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0821563 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4680  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.06 
 
 
380 aa  133  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.843824 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2954  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.14 
 
 
368 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.826684  normal  0.0199101 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0946  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.86 
 
 
369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0504  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.73 
 
 
363 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.483735  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3952  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.37 
 
 
360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0242262 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3550  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.03 
 
 
365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.370469  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1924  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.41 
 
 
360 aa  114  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0724806 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3835  histidine--tRNA ligase  30.16 
 
 
466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000618349  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2915  histidyl-tRNA synthetase  32.5 
 
 
484 aa  109  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2187  histidyl-tRNA synthetase 2  31.2 
 
 
479 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0577  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.56 
 
 
517 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3187  histidyl-tRNA synthetase  30.96 
 
 
484 aa  103  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  25 
 
 
418 aa  83.2  0.000000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  27.71 
 
 
431 aa  82.8  0.000000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  24.52 
 
 
377 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0923  Histidine--tRNA ligase  27.79 
 
 
370 aa  80.9  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00438339  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0749  histidyl-tRNA synthetase 2  27.49 
 
 
389 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  27.01 
 
 
470 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  26.76 
 
 
421 aa  75.5  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  23.64 
 
 
418 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  22.6 
 
 
426 aa  74.7  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  27.04 
 
 
410 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  25.91 
 
 
421 aa  73.9  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  25.14 
 
 
418 aa  72.8  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  25.14 
 
 
418 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  24.32 
 
 
418 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  25.63 
 
 
419 aa  70.9  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  24.16 
 
 
427 aa  71.2  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  24.93 
 
 
421 aa  70.5  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00046  histidyl-tRNA synthetase, mitochondrial precursor (AFU_orthologue; AFUA_4G12920)  22.5 
 
 
549 aa  70.5  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361819  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  23.18 
 
 
420 aa  69.7  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3154  histidyl-tRNA synthetase  26.81 
 
 
526 aa  69.7  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.447073  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  23.66 
 
 
420 aa  69.7  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  24.29 
 
 
419 aa  68.6  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1340  histidyl-tRNA synthetase  25.92 
 
 
424 aa  67.8  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1770  histidine--tRNA ligase  27.81 
 
 
387 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0828194  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1686  histidyl-tRNA synthetase  26.6 
 
 
503 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.685076  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1834  histidyl-tRNA synthetase  27.11 
 
 
503 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.848692 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1555  histidyl-tRNA synthetase  27.11 
 
 
503 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.84291 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 
439 aa  67  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  22.91 
 
 
421 aa  67  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  25.07 
 
 
417 aa  66.6  0.0000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70094  histidine tRNA synthetase  22.64 
 
 
536 aa  66.2  0.0000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.768048  normal  0.208592 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1185  histidyl-tRNA synthetase  26.74 
 
 
526 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445744  normal  0.165943 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3887  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.16 
 
 
420 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4935  histidyl-tRNA synthetase  26.22 
 
 
508 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158251  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1753  histidyl-tRNA synthetase  26.63 
 
 
465 aa  65.1  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.058114 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1457  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  21.88 
 
 
420 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0894  histidyl-tRNA synthetase  23.97 
 
 
409 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0307852  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0758  histidyl-tRNA synthetase  35.65 
 
 
467 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2880  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.51 
 
 
418 aa  64.3  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.164097  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  23.71 
 
 
444 aa  63.9  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  26.49 
 
 
454 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2715  histidyl-tRNA synthetase  26.69 
 
 
431 aa  63.2  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0979277  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5052  histidyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 
475 aa  63.2  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.504123  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2647  histidyl-tRNA synthetase  25.45 
 
 
532 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.708997  normal  0.141234 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1495  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.13 
 
 
420 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1289  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.13 
 
 
420 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  25.13 
 
 
427 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2533  histidyl-tRNA synthetase  25.13 
 
 
547 aa  62  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1489  Histidine--tRNA ligase  33.07 
 
 
383 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00266166  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  26.65 
 
 
435 aa  62  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1315  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.13 
 
 
420 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1288  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.13 
 
 
420 aa  61.2  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0380  histidyl-tRNA synthetase 2  31.47 
 
 
419 aa  60.8  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  21.43 
 
 
442 aa  61.2  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1424  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.13 
 
 
420 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3951  histidyl-tRNA synthetase  25.65 
 
 
494 aa  61.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0501682 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09630  histidyl-tRNA synthetase  31.58 
 
 
481 aa  60.8  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0725744  normal  0.181312 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1363  histidyl-tRNA synthetase  24.5 
 
 
428 aa  60.8  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000622801  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  22.77 
 
 
430 aa  61.2  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  24.35 
 
 
429 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2602  histidyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 
462 aa  61.2  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09611  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.32 
 
 
383 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2531  histidyl-tRNA synthetase  25.14 
 
 
415 aa  60.5  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>