255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1166 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1166  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
230 aa  471  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1747  TPR domain-containing protein  80 
 
 
229 aa  377  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1687  TPR domain-containing protein  81.82 
 
 
209 aa  348  4e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2675  TPR repeat-containing protein  48.11 
 
 
203 aa  181  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.679716  normal  0.152424 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3576  TPR repeat-containing protein  53.66 
 
 
211 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.316735  normal  0.110411 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3277  TPR repeat-containing protein  53.37 
 
 
204 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3257  TPR repeat-containing protein  41.88 
 
 
194 aa  168  8e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841733  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3687  hypothetical protein  33.85 
 
 
261 aa  132  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.145402  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2028  TPR repeat-containing protein  43.62 
 
 
205 aa  132  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.287446  normal  0.576518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0984  TPR repeat-containing protein  35.65 
 
 
221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.815768 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1419  TPR repeat-containing protein  38.73 
 
 
221 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0204  TPR repeat-containing protein  41.72 
 
 
212 aa  125  6e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4676  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.93 
 
 
220 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1657  hypothetical protein  39.25 
 
 
192 aa  122  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459184  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3988  tetratricopeptide TPR_2  40.88 
 
 
219 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1787  TPR repeat-containing protein  41.21 
 
 
290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1399  tetratricopeptide TPR_2  37.01 
 
 
226 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.972416  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1215  tetratricopeptide TPR_2  34.29 
 
 
224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0086  TPR repeat-containing protein  42.5 
 
 
307 aa  112  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1561  TPR repeat-containing protein  39.87 
 
 
190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.707304  normal  0.548421 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2421  hypothetical protein  39.62 
 
 
190 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.416486  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5209  TPR repeat-containing protein  38.89 
 
 
200 aa  108  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.221692  normal  0.106965 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1084  TPR repeat-containing protein  38.99 
 
 
175 aa  106  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0130  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 
203 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5960  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.69 
 
 
202 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0718627  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2063  TPR repeat-containing protein  36.76 
 
 
243 aa  99.8  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2864  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38 
 
 
201 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2969  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.91 
 
 
202 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233578  normal  0.742122 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2742  TPR repeat-containing protein  34.32 
 
 
202 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1829  TPR repeat-containing protein  33.82 
 
 
245 aa  94  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3312  TPR protein  37.82 
 
 
188 aa  85.1  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000995394  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0782  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.86 
 
 
188 aa  81.3  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0782775  normal  0.104271 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2056  tetratricopeptide TPR_2  28.37 
 
 
233 aa  71.6  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134429  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0138  TPR repeat-containing protein  32.09 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000611488 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0141  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.09 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1025  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2533  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0175  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.11 
 
 
156 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.723088 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1693  tetratricopeptide TPR_2  29.86 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.521297  normal  0.655187 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4966  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1201  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.37 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.564024  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0572  tetratricopeptide TPR_2  30.95 
 
 
194 aa  64.7  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00850831  hitchhiker  0.0000040032 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 
927 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4894  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 
156 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00964612 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_8734  predicted protein  30.65 
 
 
124 aa  60.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.662786  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4022  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 
628 aa  58.9  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  36.05 
 
 
582 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  32.46 
 
 
706 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  31.58 
 
 
820 aa  56.6  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3022  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 
161 aa  56.6  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246943 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3177  TPR repeat-containing protein  25.22 
 
 
232 aa  56.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.095278 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 
649 aa  56.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3025  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 
239 aa  55.5  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  36.47 
 
 
301 aa  55.5  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.95 
 
 
1056 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.95 
 
 
988 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  34.31 
 
 
361 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.87 
 
 
1056 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1733  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.88 
 
 
538 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.020269 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 
1276 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  29.35 
 
 
635 aa  52.8  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 
244 aa  52.8  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  28.44 
 
 
706 aa  52.4  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.61 
 
 
1022 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 
1827 aa  52  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 
662 aa  52  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2908  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 
203 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.58 
 
 
818 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  34.15 
 
 
295 aa  51.6  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  27 
 
 
391 aa  50.8  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  29.59 
 
 
560 aa  50.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  33.75 
 
 
279 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
1276 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  25.19 
 
 
462 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  32.1 
 
 
301 aa  49.7  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.53 
 
 
784 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 
732 aa  50.1  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.45 
 
 
810 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 
404 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  29.35 
 
 
1056 aa  49.7  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 
562 aa  49.7  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1883  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 
175 aa  49.7  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119318  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 
295 aa  49.3  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 
366 aa  49.3  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 
361 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06840  phosphoprotein phosphatase, putative  25.75 
 
 
586 aa  48.9  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.66618  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
280 aa  48.9  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0055  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 
166 aa  48.9  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 
1192 aa  48.5  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 
329 aa  48.5  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 
452 aa  48.5  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 
593 aa  48.5  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  33.65 
 
 
213 aa  48.5  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.71 
 
 
632 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2252  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 
188 aa  47.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 
804 aa  47.8  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 
1096 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  25.84 
 
 
833 aa  48.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1991  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.91 
 
 
367 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.0147414 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27 
 
 
3560 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>