134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_31666 on replicon NC_009359
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009359  OSTLU_31666  MscS family transporter: small-conductance mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 511 aa  1021    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0383993  normal  0.0629708 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1791  small-conductance mechanosensitive channel  26.86 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0722785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1936  MscS mechanosensitive ion channel  24.73 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44327  predicted protein  24.51 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.242296  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1462  small-conductance mechanosensitive channel protein  28.87 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  24.85 
 
 		 426 aa  63.9  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0857  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  27.65 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017497  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1177  mechanosensitive ion channel  27.65 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2066  MscS mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 424 aa  63.2  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.838165  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29320  MscS family transporter: small-conductance mechanosensitive ion channel  28 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0161796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1059  MscS mechanosensitive ion channel  28.99 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.196377 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0460  putative mechanosensitive ion channel  27.46 
 
 		 357 aa  59.3  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1295  MscS mechanosensitive ion channel  28.67 
 
 		 391 aa  60.1  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4989  MscS mechanosensitive ion channel  26.35 
 
 		 321 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0847315  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3171  MscS mechanosensitive ion channel  26.35 
 
 		 321 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001221  small-conductance mechanosensitive channel  32.14 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4309  MscS mechanosensitive ion channel  25.75 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000550538  decreased coverage  0.0000000451244 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3256  MscS mechanosensitive ion channel  25.75 
 
 		 292 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00789281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0700  hypothetical protein  25.46 
 
 		 365 aa  56.2  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.744044 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2942  MscS mechanosensitive ion channel  25.75 
 
 		 288 aa  56.2  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5106  MscS mechanosensitive ion channel  28.79 
 
 		 292 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0140126  decreased coverage  0.0019989 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4726  MscS mechanosensitive ion channel  33.07 
 
 		 325 aa  55.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440183  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05088  hypothetical protein  32.14 
 
 		 399 aa  55.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2507  MscS mechanosensitive ion channel  26.05 
 
 		 475 aa  54.7  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27641  small mechanosensitive ion channel, MscS family protein  22.92 
 
 		 373 aa  53.5  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3337  mechanosensitive channel MscS  28.66 
 
 		 284 aa  53.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.306942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  25.56 
 
 		 380 aa  52.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  28.66 
 
 		 286 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  28.66 
 
 		 286 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  28.66 
 
 		 286 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  24.24 
 
 		 286 aa  51.6  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  28.66 
 
 		 286 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  28.66 
 
 		 286 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  28.66 
 
 		 286 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  28.66 
 
 		 286 aa  52  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  28.66 
 
 		 291 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  28.66 
 
 		 286 aa  51.6  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4433  MscS Mechanosensitive ion channel  20.75 
 
 		 285 aa  52  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0691  MscS Mechanosensitive ion channel  24.89 
 
 		 362 aa  51.6  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04171  small mechanosensitive ion channel, MscS family protein  25.11 
 
 		 370 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.610357 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4349  MscS Mechanosensitive ion channel  20.28 
 
 		 285 aa  51.2  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20120  Mechanosensitive ion channel family protein  25.45 
 
 		 418 aa  50.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4436  MscS Mechanosensitive ion channel  20.28 
 
 		 285 aa  50.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.312478 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0641  hypothetical protein  28.57 
 
 		 543 aa  50.4  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2171  MscS mechanosensitive ion channel  25.45 
 
 		 374 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3896  MscS Mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 283 aa  50.1  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  24.74 
 
 		 274 aa  50.1  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2398  MscS mechanosensitive ion channel  24.13 
 
 		 374 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4503  MscS Mechanosensitive ion channel  20.28 
 
 		 285 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  28.66 
 
 		 286 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0569  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 280 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912877  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1500  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 614 aa  49.3  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638706  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19990  small-conductance mechanosensitive channel  31.01 
 
 		 264 aa  48.9  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  28.03 
 
 		 286 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1352  MscS mechanosensitive ion channel  24.43 
 
 		 376 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.308859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1186  MscS mechanosensitive ion channel  25.83 
 
 		 256 aa  48.9  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.757811 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0922  MscS mechanosensitive ion channel  28.26 
 
 		 456 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837868 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  28.03 
 
 		 286 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  28.03 
 
 		 286 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  28.03 
 
 		 286 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3360  hypothetical protein  23.89 
 
 		 374 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  25.79 
 
 		 274 aa  48.5  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0515  MscS Mechanosensitive ion channel  29.17 
 
 		 292 aa  48.5  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  23.74 
 
 		 270 aa  48.1  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1488  MscS family inner membrane protein YnaI  20.67 
 
 		 343 aa  47.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.445516  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1460  MscS mechanosensitive ion channel  29.31 
 
 		 493 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6368  MscS mechanosensitive ion channel  29.31 
 
 		 493 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  29.17 
 
 		 293 aa  47.4  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1848  MscS family hypothetical protein  20.67 
 
 		 343 aa  47.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.512359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  23.97 
 
 		 381 aa  47.4  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1670  MscS family inner membrane protein YnaI  20.67 
 
 		 343 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.107683 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7035  MscS mechanosensitive ion channel  29.31 
 
 		 493 aa  47.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.666416  normal  0.218312 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1788  MscS family inner membrane protein YnaI  20.67 
 
 		 343 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150216 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  24.8 
 
 		 362 aa  47  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  26.11 
 
 		 274 aa  47  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  25.4 
 
 		 287 aa  47  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1786  MscS family inner membrane protein YnaI  20.67 
 
 		 343 aa  47  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0416525  normal  0.388102 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2212  small mechanosensitive ion channel  21.23 
 
 		 357 aa  47  0.0009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.414294  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1822  MscS mechanosensitive ion channel  27.34 
 
 		 374 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00396347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0623  MscS Mechanosensitive ion channel  28.66 
 
 		 337 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  26.21 
 
 		 292 aa  46.6  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3699  MscS Mechanosensitive ion channel  28.76 
 
 		 283 aa  46.6  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  25.13 
 
 		 275 aa  45.8  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2555  MscS mechanosensitive ion channel  25.53 
 
 		 321 aa  45.8  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  29.37 
 
 		 274 aa  45.8  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0172  MscS mechanosensitive ion channel  25.22 
 
 		 375 aa  45.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30945  MscS family transporter: small-conductance mechanosensitive ion channel  26.06 
 
 		 473 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.111123  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  27.46 
 
 		 864 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  26.32 
 
 		 561 aa  46.2  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  26.28 
 
 		 532 aa  45.8  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  25.69 
 
 		 322 aa  45.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4500  MscS Mechanosensitive ion channel  21.01 
 
 		 662 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  27.42 
 
 		 279 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1968  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  32.67 
 
 		 475 aa  45.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.805203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  24 
 
 		 547 aa  45.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4255  mechanosensitive (MS) ion channel protein  32.69 
 
 		 311 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4144  MscS mechanosensitive ion channel  32.69 
 
 		 311 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.789982 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  26.14 
 
 		 288 aa  45.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  28.15 
 
 		 270 aa  45.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3375  MscS mechanosensitive ion channel  22.97 
 
 		 302 aa  45.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.190462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>