More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1023 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  100 
 
 		 307 aa  632  1e-180  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  52.58 
 
 		 300 aa  318  7e-86  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  45.67 
 
 		 307 aa  275  5e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  46.28 
 
 		 300 aa  267  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  46.71 
 
 		 301 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  46.71 
 
 		 299 aa  257  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  46.71 
 
 		 299 aa  256  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  46.71 
 
 		 299 aa  256  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.06 
 
 		 299 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.06 
 
 		 299 aa  256  3e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  46.71 
 
 		 299 aa  256  5e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  46.71 
 
 		 299 aa  256  5e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  46.37 
 
 		 299 aa  254  9e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  46.37 
 
 		 299 aa  254  9e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  45.67 
 
 		 299 aa  252  7e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  46.28 
 
 		 300 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  41.08 
 
 		 307 aa  230  3e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  40.74 
 
 		 307 aa  229  6e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  41.05 
 
 		 307 aa  225  9e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  41.67 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  39.59 
 
 		 301 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  36.54 
 
 		 301 aa  217  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.32 
 
 		 299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  39.53 
 
 		 295 aa  213  3.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  40.62 
 
 		 298 aa  212  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  40.62 
 
 		 298 aa  212  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  39.12 
 
 		 298 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.63 
 
 		 298 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  38 
 
 		 328 aa  208  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  37.37 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  36.75 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  38.49 
 
 		 295 aa  205  6e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  39.36 
 
 		 298 aa  205  9e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  37.59 
 
 		 290 aa  205  9e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.39 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  36.39 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  36.77 
 
 		 317 aa  205  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  35.93 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  36.09 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  39.14 
 
 		 306 aa  203  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  35.05 
 
 		 318 aa  203  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  37.5 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  36.86 
 
 		 302 aa  202  5e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.86 
 
 		 317 aa  202  6e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.58 
 
 		 311 aa  202  7e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  32.23 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  36.14 
 
 		 307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  36.86 
 
 		 302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  38.24 
 
 		 302 aa  200  3e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  37.15 
 
 		 296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  36.42 
 
 		 332 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.11 
 
 		 296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  34 
 
 		 304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  35.37 
 
 		 308 aa  199  5e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.15 
 
 		 296 aa  199  6e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  35.55 
 
 		 302 aa  199  6e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  34.56 
 
 		 291 aa  198  7e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0264  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.02 
 
 		 315 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  36.62 
 
 		 312 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.7 
 
 		 321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2528  tyrosine recombinase XerC  35.59 
 
 		 294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.237042 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  35.31 
 
 		 331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.08 
 
 		 318 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  36.72 
 
 		 324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.08 
 
 		 318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.44 
 
 		 294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.08 
 
 		 318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  35.71 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  36.86 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  39.55 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  36.9 
 
 		 295 aa  196  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5501  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.91 
 
 		 299 aa  197  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  34.09 
 
 		 315 aa  197  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2739  integrase/recombinase XerD  40.36 
 
 		 321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  38.67 
 
 		 302 aa  196  5.000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  42.05 
 
 		 296 aa  196  5.000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  35.53 
 
 		 342 aa  195  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0497  tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 324 aa  195  8.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  35.91 
 
 		 295 aa  195  9e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  36.03 
 
 		 343 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.15 
 
 		 296 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.15 
 
 		 296 aa  195  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.15 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  35.81 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.15 
 
 		 296 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  36.36 
 
 		 343 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.15 
 
 		 296 aa  195  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.15 
 
 		 296 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  34.3 
 
 		 311 aa  194  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  34.88 
 
 		 311 aa  194  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5431  tyrosine recombinase XerD  35.97 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.060431  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  35.93 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.15 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  34.53 
 
 		 317 aa  193  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  38.62 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.15 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  33 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69710  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.55 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.737312  normal  0.478185 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  37.59 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  35.17 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>