More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4193 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4193  inner-membrane translocator  100 
 
 		 375 aa  732    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  29.57 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 352 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0562  inner-membrane translocator  34.44 
 
 		 340 aa  151  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0917  inner-membrane translocator  30.39 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  32.12 
 
 		 371 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  31.85 
 
 		 362 aa  142  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  33.93 
 
 		 451 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  32.46 
 
 		 373 aa  139  8.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  32.5 
 
 		 371 aa  137  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  33.13 
 
 		 344 aa  136  5e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  37.34 
 
 		 437 aa  136  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 354 aa  136  7.000000000000001e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 354 aa  136  7.000000000000001e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  28.65 
 
 		 367 aa  135  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0784  inner-membrane translocator  34.58 
 
 		 410 aa  133  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 344 aa  133  5e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 344 aa  133  5e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 349 aa  133  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  37.24 
 
 		 347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  30.38 
 
 		 359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  32.89 
 
 		 349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  29.91 
 
 		 365 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  34.04 
 
 		 427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  27.64 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  32.77 
 
 		 426 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  34.98 
 
 		 347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  34.16 
 
 		 364 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0826  inner-membrane translocator  33.83 
 
 		 414 aa  127  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.632593 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  30.56 
 
 		 357 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  33.33 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  31.99 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  30.43 
 
 		 391 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  31.97 
 
 		 471 aa  124  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2115  inner-membrane translocator  26.14 
 
 		 353 aa  125  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  32.22 
 
 		 442 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  27.52 
 
 		 343 aa  123  4e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  32.89 
 
 		 462 aa  123  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  33.79 
 
 		 417 aa  122  9e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  33.74 
 
 		 347 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  29.12 
 
 		 373 aa  122  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 369 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.74 
 
 		 347 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  32.06 
 
 		 348 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  35.1 
 
 		 369 aa  120  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  32.23 
 
 		 344 aa  119  7.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  31.01 
 
 		 369 aa  119  9e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  35.83 
 
 		 454 aa  119  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  34.78 
 
 		 369 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  31.45 
 
 		 352 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  32.69 
 
 		 349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  29.8 
 
 		 368 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  35.42 
 
 		 349 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3947  inner-membrane translocator  34.24 
 
 		 408 aa  116  6.9999999999999995e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070874 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  30.35 
 
 		 365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  30.89 
 
 		 356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  35.21 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  31.43 
 
 		 365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3539  inner-membrane translocator  30.58 
 
 		 371 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0637  inner-membrane translocator  31.74 
 
 		 377 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2945  inner-membrane translocator  34 
 
 		 415 aa  114  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000485003 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25740  nucleoside ABC transporter membrane protein  34.17 
 
 		 419 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  27.56 
 
 		 363 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  29.19 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  26.27 
 
 		 372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  29.01 
 
 		 366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  32.7 
 
 		 370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0753  inner-membrane translocator  33.47 
 
 		 441 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4347  inner-membrane translocator  34.31 
 
 		 380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.536253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  29.54 
 
 		 357 aa  110  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3175  inner-membrane translocator  37.3 
 
 		 379 aa  109  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.390246  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  30 
 
 		 366 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  30 
 
 		 357 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  29.33 
 
 		 364 aa  109  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.74 
 
 		 355 aa  107  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3237  inner-membrane translocator  29.65 
 
 		 528 aa  106  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  29.36 
 
 		 358 aa  106  7e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4401  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 400 aa  106  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  26.98 
 
 		 365 aa  106  8e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1003  inner-membrane translocator  28.33 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  31.19 
 
 		 352 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3531  ABC transporter, permease  30.72 
 
 		 352 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3549  ABC transporter permease  30.72 
 
 		 352 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3802  sugar ABC transporter, permease protein  30.72 
 
 		 352 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000174596 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  30.15 
 
 		 365 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 340 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  33.19 
 
 		 360 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  26.98 
 
 		 365 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  30.4 
 
 		 352 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 351 aa  103  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  33.19 
 
 		 360 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2499  inner-membrane translocator  29.27 
 
 		 369 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3824  sugar ABC transporter, permease protein  30.41 
 
 		 352 aa  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3837  sugar ABC transporter, permease protein  30.41 
 
 		 352 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164763  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5335  inner-membrane translocator  34.48 
 
 		 349 aa  102  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6252  inner-membrane translocator  29.48 
 
 		 339 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.7968 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3577  inner-membrane translocator  35.27 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  28.47 
 
 		 403 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0766  inner-membrane translocator  26.54 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.286695  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1354  inner-membrane translocator  31.68 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>