More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1008 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1008  regulatory proteins, IclR  100 
 
 		 133 aa  253  5e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0609886  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0531  regulatory protein, IclR  56.92 
 
 		 215 aa  121  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1725  regulatory proteins, IclR  56.92 
 
 		 234 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.581067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1741  regulatory proteins, IclR  56.92 
 
 		 234 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1675  regulatory proteins, IclR  56.92 
 
 		 234 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0559  regulatory proteins, IclR  56.15 
 
 		 249 aa  118  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  54.17 
 
 		 253 aa  105  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  52.31 
 
 		 248 aa  96.7  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2185  transcriptional regulator, IclR family  48.89 
 
 		 259 aa  95.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  40 
 
 		 258 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3545  transcriptional regulator, IclR family  48.28 
 
 		 254 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0480157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  48.33 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  40.32 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 258 aa  80.5  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  41.41 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2456  transcriptional regulator, IclR family  51.43 
 
 		 266 aa  77.8  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248538  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2824  transcriptional regulator, IclR family  45.83 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00611258  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 269 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 264 aa  74.7  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1697  regulatory proteins, IclR  52.22 
 
 		 90 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  34.88 
 
 		 265 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1725  IclR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 279 aa  71.2  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200124  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5069  transcriptional regulator, IclR family  44.95 
 
 		 251 aa  70.9  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.469933  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  39.17 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  34.19 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 263 aa  68.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2383  transcriptional regulator, IclR family  43.69 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151168  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  39.58 
 
 		 256 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 		 257 aa  67.8  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 284 aa  67.4  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5435  IclR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 249 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.517409 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5832  IclR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 249 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1825  transcriptional regulator, IclR family  42.06 
 
 		 266 aa  67.4  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  0.0157827 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  44.79 
 
 		 262 aa  67.4  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4694  transcriptional regulator, IclR family  36.54 
 
 		 255 aa  67  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.116545  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  43.75 
 
 		 277 aa  67  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1941  IclR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 280 aa  67  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000383079  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2110  transcriptional regulator IclR-like protein  45.68 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.966848 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  33.6 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  42.11 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4896  transcriptional regulator, IclR family  42.28 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  38.27 
 
 		 252 aa  65.1  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 257 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 277 aa  64.3  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 261 aa  63.9  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  41.84 
 
 		 261 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2822  IclR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 264 aa  63.9  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  38.89 
 
 		 254 aa  63.9  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0920  IclR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 282 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687031  normal  0.0182204 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 238 aa  63.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  39.83 
 
 		 267 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3479  regulatory proteins, IclR  41.86 
 
 		 251 aa  63.5  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0476526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  40.91 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  40.91 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4100  IclR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  43.16 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  35.85 
 
 		 264 aa  62  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4730  transcriptional regulator, IclR family  40.37 
 
 		 268 aa  61.6  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5946  IclR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 266 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 267 aa  62  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  46.15 
 
 		 267 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 260 aa  61.6  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1070  regulatory proteins, IclR  39.13 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  41.24 
 
 		 269 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6800  transcriptional regulator, IclR family  41.76 
 
 		 252 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 258 aa  60.8  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 259 aa  60.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  40 
 
 		 259 aa  60.8  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  38.89 
 
 		 254 aa  60.5  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 262 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0687  regulatory proteins, IclR  41.94 
 
 		 263 aa  60.5  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  38.78 
 
 		 262 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2838  IclR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 601 aa  60.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.469664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0947  transcriptional regulator, IclR family  36.78 
 
 		 258 aa  60.5  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.264338 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  45.45 
 
 		 268 aa  60.1  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  32.74 
 
 		 267 aa  60.1  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0364  IclR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 265 aa  60.1  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  43.9 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1370  transcriptional regulator IclR-like protein  33.68 
 
 		 512 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874129  normal  0.612031 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  34.38 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5886  transcriptional regulator, IclR family  41.11 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3648  transcriptional regulator, IclR family  43.3 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4271  IclR family transcriptional regulator family  42.31 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  44.79 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  38.78 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  40.96 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3590  IclR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0501  transcriptional regulator, IclR family  39.18 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2407  IclR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  35.56 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  35.37 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  41.38 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  43.9 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>