More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0930 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0930  Alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 402 aa  830    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1599  alpha amylase catalytic region  45.17 
 
 		 1126 aa  326  6e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.863275  hitchhiker  0.00182412 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2605  alpha amylase family protein  47.19 
 
 		 420 aa  325  1e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242593  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2834  alpha amylase catalytic region  44.47 
 
 		 1124 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7547  alpha amylase catalytic region  43.98 
 
 		 1122 aa  317  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250555  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3800  alpha amylase catalytic region  36.61 
 
 		 435 aa  316  6e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.345712  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2712  alpha amylase catalytic region  43.99 
 
 		 1124 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576573  normal  0.0633095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6808  alpha amylase catalytic region  44.74 
 
 		 1122 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0740602  normal  0.515818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2939  alpha amylase catalytic region  42.72 
 
 		 1124 aa  311  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998182 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1954  alpha amylase, catalytic region  35.96 
 
 		 433 aa  283  6.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0985292  normal  0.0257857 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0916  alpha amylase catalytic region  39.04 
 
 		 476 aa  244  9.999999999999999e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2861  putative alpha-amylase-related protein  27.64 
 
 		 1146 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6821  alpha amylase catalytic region  28.16 
 
 		 1151 aa  166  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137668  normal  0.518409 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4052  alpha amylase catalytic region  30.68 
 
 		 1196 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3939  alpha amylase catalytic region  30.68 
 
 		 1196 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5491  alpha amylase catalytic region  29.07 
 
 		 1131 aa  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105634 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5590  alpha amylase, catalytic region  27.02 
 
 		 1136 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6320  alpha amylase catalytic region  27.02 
 
 		 1133 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330794  normal  0.20234 
 
 
-
 
NC_003296  RS05182  putative alpha-amylase-related protein  30.74 
 
 		 1201 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00237217  normal  0.176867 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6088  alpha amylase catalytic region  26.18 
 
 		 1130 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1330  alpha amylase, catalytic region  26.46 
 
 		 1130 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460745  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6499  alpha amylase, catalytic region  26.46 
 
 		 1130 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.145776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4393  alpha amylase catalytic region  25.64 
 
 		 1144 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.573517  normal  0.10506 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7034  Alpha amylase like protein  26.18 
 
 		 1130 aa  123  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.673665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1568  glycosy hydrolase family protein  27.86 
 
 		 1115 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1545  alpha amylase family protein  27.86 
 
 		 1115 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1341  alpha amylase family protein  28.66 
 
 		 1136 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0533  alpha amylase family protein  28.66 
 
 		 1115 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0622  alpha amylase family protein  28.34 
 
 		 1115 aa  113  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1738  alpha amylase domain-containing protein  28.17 
 
 		 1148 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.257385  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  29.01 
 
 		 422 aa  103  6e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  27.48 
 
 		 426 aa  102  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  26.06 
 
 		 426 aa  102  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  29.01 
 
 		 422 aa  100  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  26.91 
 
 		 459 aa  94.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  23.02 
 
 		 459 aa  94  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  25.71 
 
 		 460 aa  93.2  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5565  alpha-amylase-related protein  25.82 
 
 		 1082 aa  92.8  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  26.58 
 
 		 434 aa  91.7  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5097  alpha amylase catalytic region  26.29 
 
 		 1074 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.511822  normal  0.0191149 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.78 
 
 		 1433 aa  90.1  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5382  alpha amylase catalytic region  27.97 
 
 		 1075 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2448  hypothetical protein  23.44 
 
 		 516 aa  83.6  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2593  hypothetical protein  23.3 
 
 		 516 aa  83.2  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  35.17 
 
 		 463 aa  82.8  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03667  alpha-amylase  28.02 
 
 		 1038 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.533907  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  31.08 
 
 		 467 aa  76.6  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05105  alpha-amylase, putative  27.13 
 
 		 478 aa  76.3  0.0000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.289074  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1097  alpha amylase catalytic region  24.3 
 
 		 716 aa  73.6  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.992454  hitchhiker  0.0010737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4227  Alpha amylase, catalytic region  22.25 
 
 		 1140 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.316311  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0331  alpha amylase catalytic region  22.83 
 
 		 652 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3059  alpha amylase, catalytic region  25.11 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50616 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1297  alpha amylase catalytic region  28.5 
 
 		 667 aa  70.1  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.774826  normal  0.698008 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19040  glycosidase  26.27 
 
 		 675 aa  67.8  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.000683856  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0540  alpha amylase catalytic region  24.19 
 
 		 1037 aa  67.4  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0480393 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2417  alpha amylase catalytic region  26.91 
 
 		 816 aa  67  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00733114  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0249  alpha amylase catalytic region  23.62 
 
 		 656 aa  67  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.852341 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3333  alpha amylase, catalytic region  24.34 
 
 		 434 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.320284  normal  0.0371883 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0034  alpha amylase catalytic region  24.84 
 
 		 663 aa  65.1  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2934  alpha amylase, catalytic region  27.57 
 
 		 1022 aa  65.1  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124614  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1643  hypothetical protein  28.72 
 
 		 705 aa  63.9  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0585  alpha amylase domain-containing protein  21.97 
 
 		 655 aa  63.5  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0153  alpha amylase catalytic region  27.07 
 
 		 652 aa  63.2  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0679  alpha amylase, catalytic region  27.74 
 
 		 653 aa  63.2  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.675202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3659  alpha amylase catalytic region  25 
 
 		 672 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0914458  hitchhiker  0.00000417514 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2810  alpha amylase, catalytic region  29.68 
 
 		 450 aa  63.2  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1636  hypothetical protein  28.72 
 
 		 705 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09540  glycosidase  25.79 
 
 		 715 aa  62.4  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0200177  normal  0.351025 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1956  alpha amylase catalytic region  27.85 
 
 		 666 aa  62.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0110526  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2679  alpha amylase, catalytic region  26.96 
 
 		 671 aa  62.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2344  alpha amylase, catalytic region  27.31 
 
 		 696 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969175  normal  0.43625 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1337  alpha amylase catalytic region  23.19 
 
 		 678 aa  61.6  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.367678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3071  alpha amylase catalytic region  27.6 
 
 		 674 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.224313  normal  0.685148 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2379  alpha amylase catalytic region  28.57 
 
 		 671 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4100  alpha amylase catalytic region  25.97 
 
 		 687 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2798  alpha amylase, catalytic region  26.04 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.242606  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2771  alpha amylase, catalytic region  25.97 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.473519  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2815  alpha amylase, catalytic region  25.97 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.896664  normal  0.115274 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0386  alpha amylase, catalytic region  27.89 
 
 		 493 aa  62  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1641  hypothetical protein  27 
 
 		 700 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2760  alpha-amylase family protein  25.39 
 
 		 672 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302132  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1634  hypothetical protein  27 
 
 		 701 aa  60.8  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2534  Alpha amylase, catalytic region  24.42 
 
 		 664 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6072  alpha amylase catalytic region  25.11 
 
 		 659 aa  60.8  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2758  alpha amylase catalytic region  23.94 
 
 		 579 aa  60.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435679  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3176  alpha amylase catalytic region  25.83 
 
 		 682 aa  60.5  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000122162  hitchhiker  0.0000126185 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2295  alpha amylase, catalytic region  26.94 
 
 		 660 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0369553  hitchhiker  0.000002386 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2858  alpha amylase catalytic region  22.77 
 
 		 681 aa  60.5  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3476  alpha amylase catalytic region  27.62 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.179577  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2489  Alpha amylase, catalytic region  25.12 
 
 		 672 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1604  Alpha amylase, catalytic region  26.46 
 
 		 688 aa  60.5  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0314  alpha amylase, catalytic region  22.66 
 
 		 646 aa  60.5  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1809  alpha amylase, catalytic region  27.98 
 
 		 670 aa  60.5  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.341723  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4301  alpha amylase, catalytic region  26.01 
 
 		 696 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844806 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  22.97 
 
 		 562 aa  59.7  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1984  alpha amylase domain-containing protein  20.95 
 
 		 671 aa  59.7  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  22.14 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2115  alpha amylase catalytic region  27.1 
 
 		 553 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  0.0296214 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4031  alpha amylase catalytic region  25.11 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0102813 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1176  alpha amylase catalytic region  23.98 
 
 		 647 aa  58.2  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>