More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1088 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1088  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 
397 aa  827    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1890  AAA ATPase central domain protein  51.79 
 
 
367 aa  402  1e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.439906  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1672  ATPase central domain-containing protein  49.49 
 
 
369 aa  404  1e-111  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00463679  normal  0.710335 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03061  vacuolar sorting ATPase Vps4, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09360)  32.55 
 
 
434 aa  205  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.548011  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26031  predicted protein  33.03 
 
 
442 aa  199  6e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.392811  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30898  vacuolar protein  31.62 
 
 
422 aa  198  1.0000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9005  predicted protein  39.6 
 
 
337 aa  196  5.000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.299979  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00460  ATPase, putative  32.47 
 
 
439 aa  191  2e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60303  predicted protein  30.81 
 
 
433 aa  190  2.9999999999999997e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03691  AAA family ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12560)  38.24 
 
 
803 aa  186  7e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_6399  predicted protein  37.2 
 
 
290 aa  179  5.999999999999999e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.458224  normal  0.109876 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.15 
 
 
740 aa  178  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.46 
 
 
740 aa  178  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  34.31 
 
 
804 aa  178  1e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  36.25 
 
 
764 aa  178  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.47 
 
 
742 aa  178  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.39 
 
 
718 aa  176  5e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.43 
 
 
754 aa  176  7e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.03 
 
 
738 aa  176  7e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.69 
 
 
727 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.3 
 
 
732 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  35.56 
 
 
814 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.12 
 
 
742 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  34.5 
 
 
775 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.6 
 
 
759 aa  173  5e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86369  member of the AAA ATPase family of proteins  37.99 
 
 
810 aa  173  5e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.435802 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.69 
 
 
739 aa  172  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.92 
 
 
743 aa  172  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  35.96 
 
 
607 aa  171  2e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.42 
 
 
721 aa  171  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.03 
 
 
768 aa  171  3e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.61 
 
 
760 aa  170  3e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  39.22 
 
 
763 aa  171  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  35.03 
 
 
754 aa  169  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.02 
 
 
723 aa  169  6e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.71 
 
 
756 aa  169  9e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.04 
 
 
754 aa  169  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  34.73 
 
 
810 aa  169  1e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  35.13 
 
 
713 aa  168  1e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.14 
 
 
754 aa  169  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.47 
 
 
757 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.24 
 
 
800 aa  167  4e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30513  predicted protein  36.22 
 
 
408 aa  166  5e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.436051  normal  0.665929 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.78 
 
 
808 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  33.86 
 
 
829 aa  165  1.0000000000000001e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.21 
 
 
731 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.59 
 
 
704 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.12 
 
 
731 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_006686  CND04040  ATPase, putative  38.64 
 
 
370 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.07 
 
 
754 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.23 
 
 
731 aa  164  3e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.9 
 
 
781 aa  164  3e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.92 
 
 
784 aa  164  3e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.49 
 
 
736 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.24 
 
 
781 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  38.25 
 
 
405 aa  163  6e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.81 
 
 
737 aa  162  8.000000000000001e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.08 
 
 
735 aa  162  9e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.8 
 
 
737 aa  162  1e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0634  ATPase central domain-containing protein  33.8 
 
 
599 aa  162  1e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.527117  normal  0.730431 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.48 
 
 
757 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  35.08 
 
 
930 aa  161  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.22 
 
 
731 aa  160  3e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.01 
 
 
763 aa  160  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.5 
 
 
769 aa  160  4e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.25 
 
 
755 aa  160  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.01 
 
 
773 aa  159  7e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  34.74 
 
 
699 aa  158  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.56 
 
 
738 aa  158  1e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  33.22 
 
 
810 aa  157  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  37.45 
 
 
722 aa  158  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  39.92 
 
 
404 aa  158  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.8 
 
 
738 aa  157  2e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  37.45 
 
 
403 aa  157  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_2208  predicted protein  37.11 
 
 
303 aa  157  3e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  39.43 
 
 
715 aa  156  7e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.91 
 
 
757 aa  156  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1223  AAA family ATPase  29.97 
 
 
721 aa  156  8e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07047  membrane-spanning ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03990)  34.3 
 
 
410 aa  155  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.186153  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  39.59 
 
 
393 aa  155  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1429  ATPase central domain-containing protein  39.48 
 
 
464 aa  155  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.99 
 
 
736 aa  155  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.09 
 
 
852 aa  155  1e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  38.04 
 
 
408 aa  155  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33 
 
 
772 aa  155  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_41850  predicted protein  32.31 
 
 
685 aa  154  2.9999999999999998e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.77 
 
 
806 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  34.12 
 
 
412 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  36.09 
 
 
407 aa  153  4e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  37.3 
 
 
407 aa  153  4e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  35.71 
 
 
407 aa  154  4e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  35.34 
 
 
407 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  38.81 
 
 
746 aa  153  5.9999999999999996e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  37.87 
 
 
410 aa  152  7e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.96 
 
 
753 aa  152  8e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  33.33 
 
 
703 aa  151  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.61 
 
 
719 aa  151  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  34.77 
 
 
806 aa  150  3e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  36.07 
 
 
429 aa  150  3e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.95 
 
 
709 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>