More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2014 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3675  porphobilinogen deaminase  85.53 
 
 		 380 aa  642    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2014  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 378 aa  751    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.898337  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1105  porphobilinogen deaminase  67.58 
 
 		 377 aa  493  9.999999999999999e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.101851  normal  0.473763 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2252  porphobilinogen deaminase  61.54 
 
 		 385 aa  436  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.10668  normal  0.034816 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0927  porphobilinogen deaminase  59.45 
 
 		 373 aa  404  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0460194  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1226  porphobilinogen deaminase  38.48 
 
 		 309 aa  229  5e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000455197  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1465  porphobilinogen deaminase  37.23 
 
 		 316 aa  200  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0899  porphobilinogen deaminase  34.36 
 
 		 308 aa  193  3e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.28159  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  35.38 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0863  porphobilinogen deaminase  34.89 
 
 		 313 aa  190  4e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0113254  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  35.42 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1124  porphobilinogen deaminase  33.88 
 
 		 311 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.417261 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0691  porphobilinogen deaminase  33.52 
 
 		 303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.411778  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0983  porphobilinogen deaminase  38.67 
 
 		 294 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.188272  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  33.05 
 
 		 309 aa  179  9e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1249  porphobilinogen deaminase  36.29 
 
 		 313 aa  177  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.280442 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  34.75 
 
 		 311 aa  177  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1125  porphobilinogen deaminase  35.71 
 
 		 270 aa  177  4e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0176422  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1259  porphobilinogen deaminase  36.09 
 
 		 308 aa  176  7e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.925729  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1891  porphobilinogen deaminase  35.73 
 
 		 312 aa  176  9e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24400  hydroxymethylbilane synthase  41.12 
 
 		 358 aa  175  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.485393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2621  porphobilinogen deaminase  38.16 
 
 		 316 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.995581  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1251  porphobilinogen deaminase  32.4 
 
 		 309 aa  172  9e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1273  porphobilinogen deaminase  35.28 
 
 		 315 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2660  porphobilinogen deaminase  33.8 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1322  porphobilinogen deaminase  33.88 
 
 		 314 aa  171  3e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000625497  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  34.08 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2791  porphobilinogen deaminase  33.52 
 
 		 309 aa  170  4e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1374  porphobilinogen deaminase  37.14 
 
 		 308 aa  169  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212718  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  34.25 
 
 		 312 aa  169  6e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0526  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  35.22 
 
 		 542 aa  169  7e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.654893 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  33.52 
 
 		 313 aa  169  7e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12370  porphobilinogen deaminase  34.06 
 
 		 313 aa  169  8e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  35.14 
 
 		 317 aa  169  9e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  33.52 
 
 		 326 aa  169  9e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0491  porphobilinogen deaminase  31.58 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0649  porphobilinogen deaminase  31.55 
 
 		 307 aa  168  1e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.485602  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  33.89 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  34.97 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2559  porphobilinogen deaminase  36.7 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  33.8 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0570  porphobilinogen deaminase  31.55 
 
 		 307 aa  168  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1347  porphobilinogen deaminase  35.49 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  32.5 
 
 		 309 aa  168  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  34.44 
 
 		 313 aa  168  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4582  porphobilinogen deaminase  34.44 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0688  porphobilinogen deaminase  33.89 
 
 		 311 aa  166  4e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.256859 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3180  porphobilinogen deaminase  34.53 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1385  porphobilinogen deaminase  31.83 
 
 		 307 aa  167  4e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2670  porphobilinogen deaminase  34.45 
 
 		 308 aa  166  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000635996 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0767  porphobilinogen deaminase  31.46 
 
 		 308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0933  porphobilinogen deaminase  31.69 
 
 		 313 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4600  porphobilinogen deaminase  33.89 
 
 		 309 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4551  porphobilinogen deaminase  34.45 
 
 		 309 aa  166  8e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  33.8 
 
 		 317 aa  166  8e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  34.17 
 
 		 310 aa  166  8e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  33.24 
 
 		 313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  34.97 
 
 		 318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  34.44 
 
 		 311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4361  porphobilinogen deaminase  34.45 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.448902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0652  porphobilinogen deaminase  34.17 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  33.99 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4696  porphobilinogen deaminase  34.45 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  36.36 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  34.93 
 
 		 322 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1234  porphobilinogen deaminase  34.01 
 
 		 294 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.33164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0044  porphobilinogen deaminase  36.05 
 
 		 307 aa  164  3e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0780784  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  32.87 
 
 		 309 aa  164  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8325  porphobilinogen deaminase  37.05 
 
 		 317 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4208  porphobilinogen deaminase  34.17 
 
 		 309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0062  porphobilinogen deaminase  32.42 
 
 		 313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1048  porphobilinogen deaminase  32.4 
 
 		 309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0191591  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69450  porphobilinogen deaminase  32.87 
 
 		 313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  34.28 
 
 		 312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1715  porphobilinogen deaminase  35.29 
 
 		 315 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0767  porphobilinogen deaminase  33.89 
 
 		 311 aa  163  5.0000000000000005e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3591  porphobilinogen deaminase  33.62 
 
 		 326 aa  163  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4197  porphobilinogen deaminase  34.07 
 
 		 309 aa  162  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0208  porphobilinogen deaminase  33.88 
 
 		 320 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3109  hydroxymethylbilane synthase  36.24 
 
 		 311 aa  162  7e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1121  porphobilinogen deaminase  32.75 
 
 		 305 aa  162  7e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.878665 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4555  porphobilinogen deaminase  33.89 
 
 		 309 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03640  porphobilinogen deaminase  30.45 
 
 		 305 aa  162  8.000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3587  porphobilinogen deaminase  33.62 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  35.39 
 
 		 320 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0262  porphobilinogen deaminase  38.38 
 
 		 303 aa  161  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.207863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1725  porphobilinogen deaminase  36.12 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  32.15 
 
 		 317 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  33.61 
 
 		 317 aa  161  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  33.06 
 
 		 318 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  33.06 
 
 		 318 aa  161  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1978  porphobilinogen deaminase  36.13 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000417837  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  33.24 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  33.24 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  33.24 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0256  porphobilinogen deaminase  32.24 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  33.24 
 
 		 310 aa  160  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0093  porphobilinogen deaminase  33.79 
 
 		 309 aa  160  4e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  31.87 
 
 		 310 aa  160  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6006  porphobilinogen deaminase  32.58 
 
 		 313 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.254392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>