More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4620 on replicon NC_007961
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  100 
 
 		 130 aa  266  8e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  77.69 
 
 		 130 aa  211  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  69.05 
 
 		 128 aa  180  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  64.29 
 
 		 130 aa  169  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  64.06 
 
 		 128 aa  167  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  47.93 
 
 		 136 aa  127  7.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  48.74 
 
 		 136 aa  126  8.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  48.33 
 
 		 134 aa  124  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  48.8 
 
 		 140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  45.74 
 
 		 140 aa  114  6e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  45.9 
 
 		 141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  45.31 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  43.2 
 
 		 138 aa  110  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  43.55 
 
 		 129 aa  110  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  44.35 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  45.67 
 
 		 141 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  42.74 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  45.24 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  44.63 
 
 		 130 aa  107  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  44.44 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2310  rhodanese-like protein  42.61 
 
 		 127 aa  103  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  43.2 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  43.7 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  40.5 
 
 		 131 aa  100  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  39.67 
 
 		 131 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  40.16 
 
 		 126 aa  98.6  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  39.67 
 
 		 131 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  38.02 
 
 		 131 aa  97.1  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2299  rhodanese-like protein  41.32 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.688081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  42.62 
 
 		 126 aa  90.5  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2110  rhodanese-like protein  44.21 
 
 		 133 aa  89.7  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.972039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  36.8 
 
 		 130 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  41.18 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  41.53 
 
 		 323 aa  85.9  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  33.6 
 
 		 130 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  39.17 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  39.52 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  39.52 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1936  rhodanese-like protein  39.52 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.060767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  34.71 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  39.42 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  35.19 
 
 		 345 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  36.15 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  34.68 
 
 		 361 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  37.07 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.13 
 
 		 389 aa  70.5  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  33.9 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  38.71 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  31.67 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  33.05 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  33.63 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  33.96 
 
 		 346 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  34.71 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  32.81 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  33.59 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  37.25 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  32.35 
 
 		 346 aa  63.5  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0291  Rhodanese domain protein  34.19 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.49635 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1483  rhodanese-like protein  31.25 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197506  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  35.45 
 
 		 476 aa  62.4  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  32.08 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  34.78 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  34.45 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0944  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000864682  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3082  Rhodanese domain protein  28.81 
 
 		 131 aa  60.1  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal  0.0783096 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  33.62 
 
 		 116 aa  60.1  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4874  Rhodanese domain protein  31.45 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.05 
 
 		 480 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1109  rhodanese-like  45.45 
 
 		 71 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  31.03 
 
 		 388 aa  58.9  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3323  Rhodanese domain protein  29.66 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  27.91 
 
 		 354 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  33.04 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  31.45 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.2 
 
 		 393 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11084  hypothetical protein  34.41 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.7245e-55  normal  0.140954 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4389  rhodanese domain-containing protein  28.93 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2034  rhodanese domain-containing protein  36.05 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4167  rhodanese-like protein  28.93 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.02 
 
 		 380 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4233  rhodanese domain-containing protein  28.93 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  35.96 
 
 		 344 aa  57.4  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1960  rhodanese-like protein  28.95 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000451081  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3209  rhodanese domain-containing protein  32.38 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  34.48 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1689  Rhodanese domain-containing protein  30.58 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168466  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  32.52 
 
 		 438 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4148  cysteine dioxygenase type I  33.91 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  27.83 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4982  rhodanese domain-containing protein  31.87 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01280  hypothetical protein  32.61 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000449614  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  29.03 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2887  rhodanese-like protein  35 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52776  hitchhiker  0.0000448823 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  36.17 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4940  Rhodanese domain protein  32.18 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  26.96 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  28.57 
 
 		 185 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1862  Rhodanese domain protein  26.32 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.364067  normal  0.0328946 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  31.03 
 
 		 459 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  31.63 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>