125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3668 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3668  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  345  2e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0138  hypothetical protein  58.99 
 
 		 171 aa  180  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.480574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  58.74 
 
 		 168 aa  174  5e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4963  protein of unknown function DUF336  59.87 
 
 		 165 aa  167  8e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4258  hypothetical protein  56.52 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  50.75 
 
 		 167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2495  hypothetical protein  50.33 
 
 		 171 aa  136  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2430  hypothetical protein  46.06 
 
 		 168 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2811  hypothetical protein  48.52 
 
 		 170 aa  117  7.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.222867 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1142  protein of unknown function DUF336  42.21 
 
 		 169 aa  110  7.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.081676  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  43.31 
 
 		 165 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3127  protein of unknown function DUF336  43.61 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0212  hypothetical protein  38.1 
 
 		 166 aa  100  8e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1741  protein of unknown function DUF336  38.1 
 
 		 168 aa  96.7  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.457669 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0840  hypothetical protein  48.17 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.121554  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1731  hypothetical protein  37.36 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1122  hypothetical protein  43.38 
 
 		 167 aa  88.6  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4732  protein of unknown function DUF336  31.58 
 
 		 181 aa  87.4  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.718897  normal  0.662354 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4125  hypothetical protein  40.91 
 
 		 160 aa  87  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.817005  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1027  hypothetical protein  34.75 
 
 		 167 aa  85.1  5e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.737574  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2120  hypothetical protein  33.75 
 
 		 174 aa  84.7  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1201  hypothetical protein  40.8 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0522  hypothetical protein  34.75 
 
 		 180 aa  80.9  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0280  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000675862  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2446  hypothetical protein  41.13 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1763  protein of unknown function DUF336  34.84 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.879783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4102  hypothetical protein  32.12 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0487  hypothetical protein  45.54 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296207  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0644  protein of unknown function DUF336  50 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3813  hypothetical protein  40.82 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574474 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0087  protein of unknown function DUF336  40.18 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  36.59 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  29.58 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  37.84 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  34.59 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1203  hypothetical protein  30.86 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0926  hypothetical protein  43.28 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  40.35 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2147  hypothetical protein  43.61 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  37.82 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0150  hypothetical protein  32.85 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  40.91 
 
 		 145 aa  57  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1553  hypothetical protein  35.98 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  30.71 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  39.8 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0201  hypothetical protein  38.94 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  35.29 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  34.09 
 
 		 150 aa  52.4  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3856  hypothetical protein  45.88 
 
 		 143 aa  52.8  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.515837  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  34.81 
 
 		 164 aa  52  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  36.7 
 
 		 135 aa  52  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  32.31 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  33.58 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30820  hypothetical protein  37.4 
 
 		 133 aa  49.3  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0603  hypothetical protein  33.61 
 
 		 135 aa  49.3  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  34.15 
 
 		 133 aa  48.9  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3547  protein of unknown function DUF336  39.09 
 
 		 150 aa  48.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4623  protein of unknown function DUF336  39.09 
 
 		 150 aa  48.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  30.66 
 
 		 139 aa  48.5  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  31.3 
 
 		 134 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  31.3 
 
 		 134 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  31.19 
 
 		 170 aa  48.1  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  32.59 
 
 		 144 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  32.59 
 
 		 144 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  32.59 
 
 		 144 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1418  hypothetical protein  34.38 
 
 		 146 aa  47.8  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.377769 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2788  hypothetical protein  35.4 
 
 		 141 aa  47.8  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3193  hypothetical protein  33.81 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  33.64 
 
 		 136 aa  47.4  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3414  hypothetical protein  37.04 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00846619  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3164  hypothetical protein  33.61 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  30.23 
 
 		 132 aa  46.2  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  35.78 
 
 		 134 aa  45.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  34.31 
 
 		 149 aa  46.2  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  32.73 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  33.64 
 
 		 135 aa  45.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  33.83 
 
 		 144 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  32.67 
 
 		 158 aa  45.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  30.71 
 
 		 139 aa  45.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2120  protein of unknown function DUF336  32.59 
 
 		 137 aa  45.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309036  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1967  GLCG protein  34.17 
 
 		 137 aa  45.1  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.282053 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0030  hypothetical protein  32.11 
 
 		 134 aa  45.1  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2156  hypothetical protein  35.56 
 
 		 132 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0998153 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  32.73 
 
 		 183 aa  44.7  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1796  protein of unknown function DUF336  31.85 
 
 		 137 aa  44.7  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240895  normal  0.714082 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  26.24 
 
 		 174 aa  44.7  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3190  hypothetical protein  33.93 
 
 		 134 aa  44.7  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2963  hypothetical protein  43.64 
 
 		 149 aa  44.3  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193953  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  35.56 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2775  hypothetical protein  33.94 
 
 		 135 aa  43.9  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  32.71 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4567  hypothetical protein  32.11 
 
 		 134 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335545 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43300  glyoxylate glcG protein  34.26 
 
 		 121 aa  43.5  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384329  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2410  hypothetical protein  36.11 
 
 		 135 aa  43.5  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.834158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  35.56 
 
 		 132 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4626  hypothetical protein  34.26 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000345923 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1438  protein of unknown function DUF336  36.11 
 
 		 135 aa  43.5  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6395  protein of unknown function DUF336  32.38 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1978  protein of unknown function DUF336  32.38 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.72681  normal  0.810178 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>