219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3573 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2774  HWE histidine kinase  87.82 
 
 		 552 aa  976    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.893668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4707  signal transduction histidine kinase  70.73 
 
 		 556 aa  786    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1385  signal transduction histidine kinase  70.67 
 
 		 554 aa  762    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4031  signal transduction histidine kinase  73.64 
 
 		 557 aa  804    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1365  signal transduction histidine kinase  71.04 
 
 		 551 aa  773    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3573  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 556 aa  1119    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.640887  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7004  signal transduction histidine kinase  74.18 
 
 		 552 aa  834    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0703386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 601 aa  103  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 662 aa  100  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 503 aa  100  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2070  signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 		 358 aa  92.8  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.315094  normal  0.359428 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 725 aa  92.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2264  putative PAS/PAC sensor protein  24.05 
 
 		 1165 aa  92.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.620072  normal  0.0600346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 571 aa  90.9  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2229  methylesterase CheB/methylase CheR  26.42 
 
 		 1170 aa  90.5  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840236  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 339 aa  90.5  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 409 aa  90.1  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 488 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  28.02 
 
 		 488 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0905  putative PAS/PAC sensor protein  26.97 
 
 		 1170 aa  89  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.968727 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0950  Signal transduction histidine kinase protein  30.52 
 
 		 334 aa  88.2  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 491 aa  87.8  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.48 
 
 		 1167 aa  87.8  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 387 aa  87.8  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2814  putative sensor histidine kinase  23.31 
 
 		 505 aa  87.4  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  32.38 
 
 		 846 aa  86.7  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  28.71 
 
 		 463 aa  86.7  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  28.71 
 
 		 463 aa  86.7  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0743  HWE histidine kinase  33.53 
 
 		 483 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 465 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  29.63 
 
 		 1027 aa  86.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9083  bacteriophytochrome protein  29.27 
 
 		 856 aa  85.1  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0007  signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 482 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.489749  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 		 583 aa  84.3  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  27.86 
 
 		 583 aa  84.3  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0249  sensor histidine kinase  25.6 
 
 		 342 aa  83.6  0.000000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6531  signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 		 338 aa  83.2  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1944  signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 		 507 aa  82.8  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0183597  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 488 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2607  signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 		 489 aa  81.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 		 341 aa  81.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3416  signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813211  normal  0.0120926 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 		 583 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2160  signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.31354  normal  0.0264622 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1301  signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 		 588 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 		 840 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0678  two-component sensor histidine kinase  25.36 
 
 		 460 aa  81.3  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5593  two component sensor kinase  35.26 
 
 		 352 aa  81.3  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 		 372 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0615  signal transduction histidine kinase  26.9 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 		 934 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1153  signal transduction histidine kinase  25.26 
 
 		 275 aa  79  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.614752  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 489 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  26.29 
 
 		 346 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 		 930 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1337  signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5515  hypothetical protein  29.15 
 
 		 703 aa  78.2  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 713 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  28.8 
 
 		 872 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3666  signal transduction histidine kinase  27.5 
 
 		 550 aa  77.4  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123232  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3264  HWE histidine kinase  29.69 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440778 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0487  signal transduction histidine kinase  23.84 
 
 		 555 aa  76.6  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3364  signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 		 550 aa  76.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1753  sensor histidine kinase  26.77 
 
 		 364 aa  76.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4271  histidine kinase  27.57 
 
 		 692 aa  75.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  0.0625064 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 577 aa  75.5  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5219  signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 512 aa  75.5  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 559 aa  75.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4311  signal transduction histidine kinase  26.24 
 
 		 365 aa  76.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.801495  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  27.06 
 
 		 930 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 639 aa  75.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0167  signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3626  signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 792 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0746201  normal  0.0102319 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  30.24 
 
 		 847 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1074  signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 481 aa  74.7  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  26.04 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0180  signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012775  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 		 488 aa  74.3  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  27.09 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  28.65 
 
 		 1160 aa  74.3  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0507  signal transduction histidine kinase  26.55 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1888  PAS sensor protein  26.97 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  25.1 
 
 		 850 aa  73.9  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 571 aa  73.9  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  31.18 
 
 		 847 aa  73.9  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3344  signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 		 336 aa  73.6  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3027  signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.452199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  31.18 
 
 		 847 aa  73.6  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  26.6 
 
 		 907 aa  73.6  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2030  putative sensor histidine kinase  25.49 
 
 		 313 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 352 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5263  hypothetical protein  24.77 
 
 		 345 aa  73.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1244  signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 336 aa  72.8  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 602 aa  73.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 		 759 aa  73.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0218  signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 		 867 aa  72  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269004 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0851  signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 1124 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.596817 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  24.1 
 
 		 1190 aa  71.6  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3755  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.41 
 
 		 1063 aa  71.6  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>