133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2831 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2831  metallophosphoesterase  100 
 
 		 408 aa  821    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1185  metallophosphoesterase  72.17 
 
 		 408 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3627  metallophosphoesterase  68.87 
 
 		 407 aa  589  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0630322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0161  metallophosphoesterase  45.7 
 
 		 410 aa  357  1.9999999999999998e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0726  metallophosphoesterase  46.29 
 
 		 412 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2340  metallophosphoesterase  44.39 
 
 		 423 aa  327  2.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187911 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1148  metallophosphoesterase  43.01 
 
 		 416 aa  300  4e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.809261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1052  metallophosphoesterase  42.18 
 
 		 416 aa  291  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1271  metallophosphoesterase  45.56 
 
 		 411 aa  290  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1460  metallophosphoesterase  39.66 
 
 		 419 aa  288  1e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1563  metallophosphoesterase  41.71 
 
 		 430 aa  283  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7589  metallophosphoesterase  41.41 
 
 		 418 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691136 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5337  metallophosphoesterase  42.86 
 
 		 416 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542986 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2263  metallophosphoesterase  43.49 
 
 		 412 aa  278  1e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1000  phosphoesterase YhaO-putative DNA repair exonuclease  41.15 
 
 		 416 aa  277  2e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3015  metallophosphoesterase  38.66 
 
 		 449 aa  276  5e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.499435  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0443  metallophosphoesterase  42.58 
 
 		 411 aa  276  5e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1093  putative exonuclease  39.22 
 
 		 434 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.144475  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5979  metallophosphoesterase  40.51 
 
 		 416 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6697  metallophosphoesterase  40.76 
 
 		 416 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000065461  normal  0.239788 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6632  metallophosphoesterase  41.01 
 
 		 416 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000403777  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5855  metallophosphoesterase  40.51 
 
 		 416 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663703  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6221  metallophosphoesterase  40.51 
 
 		 416 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799134  hitchhiker  0.00232711 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5734  metallophosphoesterase  40.52 
 
 		 416 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5506  metallophosphoesterase  40.79 
 
 		 425 aa  267  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  hitchhiker  0.0000451519 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  44.18 
 
 		 429 aa  261  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4580  metallophosphoesterase  40.96 
 
 		 429 aa  253  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0050  metallophosphoesterase  44.28 
 
 		 416 aa  252  1e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3539  metallophosphoesterase  37.06 
 
 		 404 aa  241  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.892373 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2438  metallophosphoesterase  39.26 
 
 		 405 aa  240  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1990  metallophosphoesterase  41.16 
 
 		 425 aa  230  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.217213  normal  0.336367 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0878  metallophosphoesterase  33.74 
 
 		 425 aa  203  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  34.77 
 
 		 422 aa  202  6e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3493  metallophosphoesterase  34.88 
 
 		 410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0346  metallophosphoesterase  35.15 
 
 		 418 aa  201  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.45133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6381  metallophosphoesterase  33.33 
 
 		 422 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1260  metallophosphoesterase  32.37 
 
 		 436 aa  180  4e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00868935  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3216  putative DNA repair exonuclease  32.11 
 
 		 418 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3955  metallophosphoesterase  32.84 
 
 		 418 aa  176  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  31.58 
 
 		 413 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  36 
 
 		 394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1745  metallophosphoesterase  29.92 
 
 		 420 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  35.78 
 
 		 413 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  30.56 
 
 		 413 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  35.78 
 
 		 413 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  30.2 
 
 		 432 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  30.23 
 
 		 413 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  30.87 
 
 		 432 aa  161  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  30.56 
 
 		 432 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  30.56 
 
 		 413 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  29.93 
 
 		 413 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3623  Ser/Thr protein phosphatase family protein  34.46 
 
 		 465 aa  158  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27860  DNA repair exonuclease  29.93 
 
 		 420 aa  150  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0902  DNA repair exonuclease  32.89 
 
 		 413 aa  150  5e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.175576  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  32.77 
 
 		 413 aa  150  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2891  metallophosphoesterase  35.63 
 
 		 448 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1245  metallophosphoesterase  31.01 
 
 		 436 aa  139  7e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  31.53 
 
 		 428 aa  137  4e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0736  metallophosphoesterase  30.7 
 
 		 435 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00547019  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0728  DNA repair exonuclease  31.52 
 
 		 390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.040475  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1897  metallophosphoesterase  25.67 
 
 		 398 aa  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1931  metallophosphoesterase  25.67 
 
 		 398 aa  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  26.08 
 
 		 407 aa  125  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2312  metallophosphoesterase  33.21 
 
 		 513 aa  123  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1380  DNA repair exonuclease family protein  28.95 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00026771  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  30.88 
 
 		 464 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3236  metallophosphoesterase  29.07 
 
 		 434 aa  86.7  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  24.91 
 
 		 379 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  31.1 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0031  metallophosphoesterase  24.11 
 
 		 379 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  24.19 
 
 		 379 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  28.52 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1873  metallophosphoesterase  26.86 
 
 		 435 aa  75.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0776  metallophosphoesterase  23.81 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  23.51 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1573  metallophosphoesterase  28.79 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.331746  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0828  metallophosphoesterase  26.75 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  26.15 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1407  nuclease SbcCD, D subunit  25.1 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0164036  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1434  nuclease SbcCD, D subunit  25.1 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.395711  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1710  metallophosphoesterase  27.69 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0479  metallophosphoesterase  29.03 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  25.58 
 
 		 415 aa  66.2  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3282  metallophosphoesterase  26.52 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0712  metallophosphoesterase  25.58 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000226711  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  24.23 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  22.26 
 
 		 414 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1689  metallophosphoesterase  27.64 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  26.14 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0940  metallophosphoesterase  25.34 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.282172  normal  0.704888 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  25.27 
 
 		 382 aa  55.5  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  24.6 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  23.56 
 
 		 421 aa  54.3  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4995  metallophosphoesterase  26.15 
 
 		 378 aa  53.9  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1724  nuclease SbcCD, D subunit, putative  25.76 
 
 		 418 aa  53.5  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559554  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1789  metallophosphoesterase  26.34 
 
 		 409 aa  53.1  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0749  metallophosphoesterase  25.21 
 
 		 397 aa  52.4  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1212  metallophosphoesterase  25.76 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  22.91 
 
 		 380 aa  52  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1227  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.31 
 
 		 371 aa  51.2  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>