More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3184 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1157  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  67.04 
 
 		 638 aa  713    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0429798  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1925  ABC transporter related  53.33 
 
 		 726 aa  654    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2881  ABC transporter related protein  62.17 
 
 		 608 aa  681    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000328864  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3184  ABC transporter related protein  100 
 
 		 671 aa  1318    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0347906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5718  ABC transporter related  56.51 
 
 		 589 aa  649    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1444  ABC transporter-like protein  57.55 
 
 		 613 aa  650    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0895961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2928  ABC transporter, HlyB/MsbA family  60.2 
 
 		 602 aa  677    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.807188  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3979  ABC transporter related protein  54.17 
 
 		 609 aa  614  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3034  ABC transporter related  55.76 
 
 		 597 aa  611  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624415  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3407  ABC transporter related  55.85 
 
 		 625 aa  600  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0356305 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3228  ABC transporter related protein  54.87 
 
 		 591 aa  595  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3181  ABC transporter related  56.41 
 
 		 625 aa  580  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4360  ABC transporter related  52.25 
 
 		 610 aa  565  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12840  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  47.46 
 
 		 617 aa  546  1e-154  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.376239  normal  0.0776203 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1995  ABC transporter related protein  50.58 
 
 		 635 aa  494  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1493  ABC transporter related protein  47.49 
 
 		 605 aa  486  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.625489  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27260  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  43.04 
 
 		 730 aa  483  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0467711  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  47.31 
 
 		 606 aa  476  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2231  ABC transporter related  46.59 
 
 		 608 aa  451  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1209  ABC transporter related  40.81 
 
 		 584 aa  406  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3763  ABC transporter related  38.64 
 
 		 984 aa  278  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.849502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  36.72 
 
 		 631 aa  276  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  35.35 
 
 		 1522 aa  272  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  28.75 
 
 		 594 aa  268  2e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  34.37 
 
 		 581 aa  263  6e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  28.47 
 
 		 585 aa  261  4e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1516  ABC transporter related  38.91 
 
 		 1231 aa  258  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.347232 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  28.62 
 
 		 575 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4445  ABC transporter related  34.94 
 
 		 650 aa  252  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4532  ABC transporter related  34.94 
 
 		 650 aa  252  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.329885  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0830  ABC transporter related  34.35 
 
 		 612 aa  251  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000934514 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  34.57 
 
 		 641 aa  251  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  27.44 
 
 		 606 aa  251  4e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  30.26 
 
 		 586 aa  251  4e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  30.14 
 
 		 586 aa  250  6e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3639  ABC transporter related  35.49 
 
 		 582 aa  250  6e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  31.81 
 
 		 618 aa  247  4e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  30.32 
 
 		 591 aa  245  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.12 
 
 		 573 aa  244  3e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  31.09 
 
 		 579 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  26.06 
 
 		 582 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2782  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.09 
 
 		 596 aa  243  6e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0170515  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  34.97 
 
 		 1301 aa  243  7e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0971  ABC transporter related  32.77 
 
 		 577 aa  243  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.474508 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  32.24 
 
 		 601 aa  243  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  34.47 
 
 		 606 aa  242  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02160  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.95 
 
 		 608 aa  242  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  29.68 
 
 		 768 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  31.29 
 
 		 582 aa  241  4e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  31.37 
 
 		 589 aa  240  6.999999999999999e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  34.12 
 
 		 640 aa  240  6.999999999999999e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  26.99 
 
 		 589 aa  239  1e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1226  ABC transporter, transmembrane region  35.87 
 
 		 595 aa  239  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.56473  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1747  ABC transporter related  32.5 
 
 		 633 aa  239  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  34.94 
 
 		 620 aa  238  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.73 
 
 		 622 aa  239  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0591  ABC transporter-related protein  26.53 
 
 		 566 aa  238  3e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0347  ABC transporter related  29.31 
 
 		 647 aa  238  3e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.836066 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  33.55 
 
 		 1284 aa  238  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  29.35 
 
 		 583 aa  237  4e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0353  ABC transporter related  31.31 
 
 		 639 aa  238  4e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.32 
 
 		 585 aa  238  4e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  26.71 
 
 		 598 aa  237  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  33.02 
 
 		 654 aa  237  6e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0519  ABC transporter related  35.7 
 
 		 589 aa  236  9e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00043092  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1034  ABC transporter related  35.21 
 
 		 1321 aa  236  9e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.229722 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  28.37 
 
 		 578 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1440  ABC transporter related protein  34.87 
 
 		 596 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.531129 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  31.53 
 
 		 641 aa  234  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  28.74 
 
 		 588 aa  234  3e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  28.17 
 
 		 581 aa  234  3e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14811  multidrug ABC transporter  28.49 
 
 		 596 aa  234  3e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.25024  normal  0.341749 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  32.09 
 
 		 581 aa  233  6e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3356  ABC transporter related  35.9 
 
 		 577 aa  233  6e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  32.02 
 
 		 583 aa  233  6e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3298  ABC transporter related  31.88 
 
 		 658 aa  233  6e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106307  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  31.53 
 
 		 640 aa  233  7.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  25.37 
 
 		 596 aa  233  8.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0649  ATPase  28.14 
 
 		 596 aa  232  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.110083  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09400  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.66 
 
 		 578 aa  233  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.780202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  32.9 
 
 		 1436 aa  232  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6413  ABC transporter related  33.76 
 
 		 577 aa  232  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.637608  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35 
 
 		 1257 aa  232  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  28.52 
 
 		 577 aa  232  2e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1304  ABC transporter related  28.85 
 
 		 602 aa  232  2e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  27.84 
 
 		 590 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5527  ABC transporter related protein  33.03 
 
 		 604 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  30.13 
 
 		 603 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  32.36 
 
 		 578 aa  231  3e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  30.82 
 
 		 583 aa  231  4e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  27.5 
 
 		 585 aa  231  4e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4165  ABC transporter related  35.4 
 
 		 607 aa  231  4e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131788  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1482  ATPase  29.18 
 
 		 632 aa  230  5e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.412364  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27200  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.04 
 
 		 702 aa  230  5e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.663509  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1984  ABC transporter related  33.27 
 
 		 605 aa  230  6e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0832804 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  27.86 
 
 		 577 aa  230  6e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.83 
 
 		 602 aa  230  8e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2251  ABC transporter related  34.21 
 
 		 586 aa  230  8e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30 
 
 		 582 aa  229  9e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.62 
 
 		 577 aa  229  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>