More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1593 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1593  ABC transporter related protein  100 
 
 		 587 aa  1108    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.317799  normal  0.0625099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3472  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  47.3 
 
 		 564 aa  343  5.999999999999999e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00244165  hitchhiker  0.00122928 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0856  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  39.08 
 
 		 566 aa  329  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6064  ABC transporter related protein  40.7 
 
 		 575 aa  303  5.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2406  ABC transporter related  43.7 
 
 		 570 aa  291  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37360  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.9 
 
 		 619 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5067  ABC transporter related  46.03 
 
 		 549 aa  242  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3048  ABC transporter related  39.21 
 
 		 584 aa  241  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.522258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.63 
 
 		 597 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3025  ABC transporter transmembrane region  41.23 
 
 		 619 aa  234  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.946814  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3041  ABC transporter transmembrane region  35.37 
 
 		 615 aa  221  3e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8453  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  33.22 
 
 		 564 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00619084  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3689  ABC transporter related protein  38.73 
 
 		 560 aa  216  7e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3727  ABC transporter related  35.43 
 
 		 578 aa  214  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202459  normal  0.0336359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0419  ABC transporter related protein  33.45 
 
 		 574 aa  214  4.9999999999999996e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.937876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2082  ABC transporter transmembrane region  34.38 
 
 		 575 aa  209  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4060  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 570 aa  200  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.282527  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28420  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.62 
 
 		 607 aa  193  6e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.520014 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0698  ABC transporter transmembrane region  36.4 
 
 		 612 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0647  ABC transporter transmembrane region  30.64 
 
 		 589 aa  191  4e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.415337 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  30.72 
 
 		 625 aa  184  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  34.4 
 
 		 595 aa  180  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.53 
 
 		 579 aa  179  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.76 
 
 		 588 aa  179  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5182  ABC transporter related  34.75 
 
 		 578 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.459442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2573  ABC transporter related protein  34.15 
 
 		 619 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0847371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  29.82 
 
 		 613 aa  166  8e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  28.23 
 
 		 596 aa  166  9e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1371  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.45 
 
 		 587 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680862  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2881  ABC transporter related protein  32.67 
 
 		 608 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000328864  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4196  ABC transporter transmembrane region  33.27 
 
 		 580 aa  163  9e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00643785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1395  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.01 
 
 		 610 aa  163  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.507365  hitchhiker  0.000128889 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  24.08 
 
 		 588 aa  162  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0748  ABC transporter transmembrane region  33.8 
 
 		 593 aa  162  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0921  phospholipid-lipopolysaccharide ABC transporter  26.77 
 
 		 596 aa  162  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  23.5 
 
 		 583 aa  162  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  28.42 
 
 		 638 aa  162  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1094  lipid A export permease/ATP-binding protein MsbA  26.77 
 
 		 588 aa  161  3e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  24.68 
 
 		 588 aa  160  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  24.31 
 
 		 594 aa  160  7e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  26.78 
 
 		 764 aa  160  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  26.55 
 
 		 598 aa  160  8e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0828  ABC transporter related  25.34 
 
 		 596 aa  159  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2019  ABC transporter related  30.52 
 
 		 590 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.990408 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  24.04 
 
 		 586 aa  158  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  29.95 
 
 		 620 aa  158  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  29.69 
 
 		 611 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  25.19 
 
 		 556 aa  157  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  24.74 
 
 		 589 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  23.78 
 
 		 571 aa  157  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  23.78 
 
 		 571 aa  157  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0246  ABC lipid efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  30.16 
 
 		 590 aa  156  8e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1889  ABC transporter related  30.16 
 
 		 590 aa  156  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.19709  normal  0.932579 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10871  multidrug ABC transporter  23.59 
 
 		 596 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.405422 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2199  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  25.54 
 
 		 600 aa  155  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  23.3 
 
 		 604 aa  155  2e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  34.58 
 
 		 1522 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3979  ABC transporter-related protein  27.35 
 
 		 773 aa  155  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.34 
 
 		 567 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2674  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.09 
 
 		 602 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0832532  normal  0.0804565 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  30.34 
 
 		 611 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  28.13 
 
 		 660 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14811  multidrug ABC transporter  23.58 
 
 		 596 aa  154  4e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.25024  normal  0.341749 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  24.02 
 
 		 575 aa  154  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.35 
 
 		 571 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  24.35 
 
 		 571 aa  153  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  24.35 
 
 		 571 aa  153  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.35 
 
 		 571 aa  153  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1055  ABC transporter related protein  25.16 
 
 		 571 aa  153  7e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  26.22 
 
 		 579 aa  153  7e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2826  ABC transporter, ATP-binding protein MsbA  24.61 
 
 		 604 aa  153  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.070781 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1548  ABC transporter related  29.96 
 
 		 593 aa  153  8e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.985805  normal  0.0736759 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1515  ABC transporter related  24 
 
 		 577 aa  153  8e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1705  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.87 
 
 		 602 aa  153  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.433379  normal  0.881057 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1668  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.87 
 
 		 602 aa  153  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1683  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.87 
 
 		 602 aa  153  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  25.67 
 
 		 575 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.42 
 
 		 571 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1209  ABC transporter related  29.07 
 
 		 584 aa  153  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  26.39 
 
 		 582 aa  152  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  26.53 
 
 		 577 aa  152  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  24.14 
 
 		 571 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.82 
 
 		 578 aa  152  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.6 
 
 		 571 aa  152  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5527  ABC transporter related protein  29.52 
 
 		 604 aa  152  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  22.49 
 
 		 585 aa  152  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.35 
 
 		 571 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.23 
 
 		 639 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  22.07 
 
 		 578 aa  152  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0389  ABC transporter ATP-binding protein  27.74 
 
 		 582 aa  152  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  26.05 
 
 		 603 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  25.99 
 
 		 572 aa  152  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  22.07 
 
 		 578 aa  152  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1316  lipid/multidrug ABC transporter MsbA ATPase and inner membrane domains  26.11 
 
 		 595 aa  151  3e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  26.72 
 
 		 650 aa  151  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  25.57 
 
 		 572 aa  151  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  29.06 
 
 		 566 aa  151  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  30.91 
 
 		 641 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0672  ABC transporter related  25.55 
 
 		 777 aa  151  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.264122  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  28.92 
 
 		 619 aa  151  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.676963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>