More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0698 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_28420  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  57.99 
 
 
607 aa  641    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.520014 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0698  ABC transporter transmembrane region  100 
 
 
612 aa  1189    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2573  ABC transporter related protein  65.89 
 
 
619 aa  634  1e-180  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0847371  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3041  ABC transporter transmembrane region  55.18 
 
 
615 aa  603  1.0000000000000001e-171  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327338 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0647  ABC transporter transmembrane region  51.08 
 
 
589 aa  515  1e-144  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.415337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8453  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  43.91 
 
 
564 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00619084  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0748  ABC transporter transmembrane region  47.42 
 
 
593 aa  412  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5182  ABC transporter related  43.76 
 
 
578 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.459442  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3727  ABC transporter related  41.16 
 
 
578 aa  367  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202459  normal  0.0336359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2082  ABC transporter transmembrane region  38.51 
 
 
575 aa  339  9.999999999999999e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  41.11 
 
 
588 aa  330  6e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4060  ABC transporter related protein  36.93 
 
 
570 aa  327  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.282527  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4196  ABC transporter transmembrane region  41.75 
 
 
580 aa  325  2e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00643785  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0419  ABC transporter related protein  37.48 
 
 
574 aa  322  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.937876  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1127  ABC transporter transmembrane region  40.93 
 
 
580 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3472  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.14 
 
 
564 aa  194  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00244165  hitchhiker  0.00122928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2406  ABC transporter related  33.65 
 
 
570 aa  171  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5067  ABC transporter related  35.35 
 
 
549 aa  166  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02524  hypothetical protein  26.62 
 
 
579 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003564  ATP-binding component of a transport system  26.51 
 
 
579 aa  162  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1593  ABC transporter related protein  33.65 
 
 
587 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.317799  normal  0.0625099 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  29.75 
 
 
631 aa  158  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  26.7 
 
 
583 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  26.7 
 
 
583 aa  157  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.7 
 
 
583 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3385  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  26.7 
 
 
583 aa  157  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.35 
 
 
583 aa  157  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3696  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.53 
 
 
583 aa  156  8e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000188932 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3059  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  26.77 
 
 
588 aa  155  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  25.13 
 
 
586 aa  155  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3253  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  27.05 
 
 
589 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.052561  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5006  ABC transporter-related protein  27.98 
 
 
634 aa  155  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  28.03 
 
 
650 aa  154  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1058  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  27.24 
 
 
588 aa  153  8e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.61208  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  24.74 
 
 
586 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.18 
 
 
583 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.74 
 
 
586 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0906  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.91 
 
 
586 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000129836  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  24.87 
 
 
584 aa  152  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0942  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25 
 
 
586 aa  152  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785069  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6064  ABC transporter related protein  30.19 
 
 
575 aa  151  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1033  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.74 
 
 
586 aa  151  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0809  ABC transporter ATP-binding/permease  24.74 
 
 
586 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00766142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0852  ABC transporter permease/ATP-binding protein  24.74 
 
 
586 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  25.61 
 
 
583 aa  150  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  26.96 
 
 
644 aa  150  8e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0830  ABC transporter related  28.83 
 
 
612 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000934514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  28.99 
 
 
1522 aa  149  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  30.06 
 
 
1301 aa  149  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0757  ABC transporter related  24.87 
 
 
586 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000135449  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1274  ABC transporter related protein  22.4 
 
 
572 aa  149  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  27.45 
 
 
589 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  23.28 
 
 
582 aa  148  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  24.65 
 
 
587 aa  147  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  28.21 
 
 
585 aa  147  6e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3720  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.34 
 
 
583 aa  147  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  25.97 
 
 
579 aa  147  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  23.79 
 
 
585 aa  147  8.000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  25.43 
 
 
583 aa  146  9e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3715  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.34 
 
 
583 aa  146  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000980876  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  24.46 
 
 
597 aa  145  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4432  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.37 
 
 
548 aa  145  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000325117  normal  0.0473884 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.28 
 
 
586 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3182  ABC transporter related  30.17 
 
 
602 aa  145  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0802  ABC transporter-like protein  26.41 
 
 
572 aa  144  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.51 
 
 
586 aa  144  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  23.67 
 
 
581 aa  144  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1107  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  26.91 
 
 
591 aa  144  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349072  hitchhiker  0.00000399844 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.92 
 
 
1257 aa  144  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  23.1 
 
 
586 aa  144  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  30.42 
 
 
1284 aa  144  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.01 
 
 
600 aa  143  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  27.37 
 
 
581 aa  143  8e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  22.98 
 
 
586 aa  143  8e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3183  ABC transporter related protein  30.72 
 
 
615 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0496576  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  22.55 
 
 
581 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  26.09 
 
 
575 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  23.77 
 
 
583 aa  143  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  26.97 
 
 
603 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01280  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.55 
 
 
530 aa  142  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  27.7 
 
 
614 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3222  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  26.7 
 
 
588 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  25.69 
 
 
589 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3041  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  26.7 
 
 
588 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.33 
 
 
586 aa  142  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  24.11 
 
 
578 aa  141  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  22.34 
 
 
598 aa  141  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  27.35 
 
 
603 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3080  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  26.53 
 
 
588 aa  140  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0856  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  30.06 
 
 
566 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2225  ABC transporter related  27.03 
 
 
612 aa  140  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164174  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0491  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  25.34 
 
 
590 aa  140  8.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.961143  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  30.3 
 
 
1436 aa  140  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3161  ABC transporter related protein  25.86 
 
 
590 aa  139  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  25.18 
 
 
592 aa  139  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  24.56 
 
 
585 aa  139  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2849  ABC transporter related  25.78 
 
 
595 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104844  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  26.76 
 
 
660 aa  139  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4445  ABC transporter related  27.22 
 
 
650 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789394  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1070  ABC transporter related protein  26.57 
 
 
582 aa  139  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>