More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0748 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0748  ABC transporter transmembrane region  100 
 
 		 593 aa  1125    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8453  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  48.04 
 
 		 564 aa  480  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00619084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3041  ABC transporter transmembrane region  47.83 
 
 		 615 aa  479  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327338 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28420  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  50 
 
 		 607 aa  476  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.520014 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0698  ABC transporter transmembrane region  48.39 
 
 		 612 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2573  ABC transporter related protein  53.14 
 
 		 619 aa  442  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0847371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5182  ABC transporter related  47.92 
 
 		 578 aa  441  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.459442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2082  ABC transporter transmembrane region  45.94 
 
 		 575 aa  436  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  49.05 
 
 		 588 aa  412  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3727  ABC transporter related  45.69 
 
 		 578 aa  408  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202459  normal  0.0336359 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0647  ABC transporter transmembrane region  41.53 
 
 		 589 aa  392  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.415337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0419  ABC transporter related protein  42.98 
 
 		 574 aa  383  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.937876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4060  ABC transporter related protein  40.79 
 
 		 570 aa  374  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.282527  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4196  ABC transporter transmembrane region  43.22 
 
 		 580 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00643785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1127  ABC transporter transmembrane region  46.8 
 
 		 580 aa  352  8e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3472  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.52 
 
 		 564 aa  203  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00244165  hitchhiker  0.00122928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2406  ABC transporter related  33.03 
 
 		 570 aa  182  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5067  ABC transporter related  37.32 
 
 		 549 aa  178  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6064  ABC transporter related protein  32.84 
 
 		 575 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0856  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  31.81 
 
 		 566 aa  174  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3689  ABC transporter related protein  32.38 
 
 		 560 aa  167  5.9999999999999996e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01280  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.99 
 
 		 530 aa  166  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1593  ABC transporter related protein  33.64 
 
 		 587 aa  160  9e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.317799  normal  0.0625099 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  24.02 
 
 		 579 aa  157  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.81 
 
 		 582 aa  155  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  31.6 
 
 		 581 aa  154  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.97 
 
 		 609 aa  154  5.9999999999999996e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  27.97 
 
 		 610 aa  153  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  31.77 
 
 		 631 aa  153  8e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1959  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.37 
 
 		 582 aa  151  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278742  normal  0.389818 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2577  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.37 
 
 		 582 aa  151  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.436168  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2665  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.37 
 
 		 582 aa  151  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789085  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  30.06 
 
 		 581 aa  150  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  26.28 
 
 		 582 aa  148  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.28 
 
 		 582 aa  148  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.28 
 
 		 582 aa  148  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.28 
 
 		 582 aa  148  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.28 
 
 		 582 aa  148  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.28 
 
 		 582 aa  148  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.28 
 
 		 582 aa  148  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  26.28 
 
 		 582 aa  148  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.28 
 
 		 582 aa  148  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11248  ABC transporter, ATP-binding protein  24.18 
 
 		 566 aa  146  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  24.69 
 
 		 587 aa  146  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.24 
 
 		 582 aa  146  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0583  ABC transporter related  22.07 
 
 		 583 aa  145  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  31.25 
 
 		 641 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  23.52 
 
 		 582 aa  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  28.24 
 
 		 596 aa  145  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  23.41 
 
 		 597 aa  144  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2251  ABC transporter related  25.68 
 
 		 586 aa  144  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  25.23 
 
 		 586 aa  144  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0552  ABC transporter related  23.99 
 
 		 589 aa  144  5e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.1 
 
 		 582 aa  144  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.1 
 
 		 582 aa  144  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.1 
 
 		 582 aa  144  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26 
 
 		 597 aa  144  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.1 
 
 		 582 aa  144  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.1 
 
 		 582 aa  144  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4445  ABC transporter related  31.29 
 
 		 650 aa  144  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4532  ABC transporter related  31.29 
 
 		 650 aa  144  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.329885  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  24.62 
 
 		 579 aa  144  7e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  29.63 
 
 		 580 aa  143  7e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  27.22 
 
 		 608 aa  143  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.64 
 
 		 614 aa  143  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  30.5 
 
 		 601 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  24.18 
 
 		 584 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.4 
 
 		 579 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0115  ABC transporter related  22.06 
 
 		 609 aa  142  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0303  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  22.09 
 
 		 575 aa  141  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1158  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  27.86 
 
 		 614 aa  141  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0064562  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25.93 
 
 		 582 aa  142  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  22.76 
 
 		 608 aa  140  6e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  28.15 
 
 		 566 aa  140  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  27.94 
 
 		 606 aa  140  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1274  ABC transporter related protein  23.36 
 
 		 572 aa  140  7.999999999999999e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37360  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.94 
 
 		 619 aa  140  7.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1665  ABC transporter related  30.65 
 
 		 632 aa  140  7.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0337818  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  22.77 
 
 		 598 aa  140  8.999999999999999e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1001  ABC transporter related protein  28.76 
 
 		 593 aa  139  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  25.29 
 
 		 601 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  28.45 
 
 		 600 aa  139  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2041  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25.05 
 
 		 582 aa  139  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  26.38 
 
 		 591 aa  139  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1433  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.08 
 
 		 582 aa  139  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.855683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  24.95 
 
 		 591 aa  139  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  23.26 
 
 		 586 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0902  ABC transporter related  24.66 
 
 		 579 aa  139  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00896089  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3033  ABC transporter related  32.33 
 
 		 598 aa  139  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.275745  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  23.92 
 
 		 727 aa  139  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0880  ABC transporter related  24.66 
 
 		 579 aa  139  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000184481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  25.92 
 
 		 596 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  25.12 
 
 		 601 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  22.49 
 
 		 577 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  24.35 
 
 		 579 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  22.32 
 
 		 594 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1685  ABC transporter related protein  19.37 
 
 		 574 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01535  lipid transporter ATP-binding/permease protein  23.56 
 
 		 583 aa  138  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2928  ABC transporter, HlyB/MsbA family  30.25 
 
 		 602 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.807188  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1395  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.31 
 
 		 610 aa  138  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.507365  hitchhiker  0.000128889 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>