More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_01280 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_01280  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  100 
 
 		 530 aa  1029    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4060  ABC transporter related protein  35.74 
 
 		 570 aa  256  9e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.282527  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0419  ABC transporter related protein  36.94 
 
 		 574 aa  229  8e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.937876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8453  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  33.27 
 
 		 564 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00619084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2082  ABC transporter transmembrane region  35.88 
 
 		 575 aa  199  7.999999999999999e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28420  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.8 
 
 		 607 aa  193  5e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.520014 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3041  ABC transporter transmembrane region  31.98 
 
 		 615 aa  186  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327338 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0698  ABC transporter transmembrane region  31.06 
 
 		 612 aa  179  9e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5182  ABC transporter related  33.2 
 
 		 578 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.459442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0748  ABC transporter transmembrane region  36.38 
 
 		 593 aa  177  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3727  ABC transporter related  34.38 
 
 		 578 aa  170  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202459  normal  0.0336359 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.5 
 
 		 588 aa  166  6.9999999999999995e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0647  ABC transporter transmembrane region  27.36 
 
 		 589 aa  166  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.415337 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2573  ABC transporter related protein  31.99 
 
 		 619 aa  159  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0847371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1127  ABC transporter transmembrane region  34.91 
 
 		 580 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4196  ABC transporter transmembrane region  32.56 
 
 		 580 aa  148  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00643785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3472  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33 
 
 		 564 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00244165  hitchhiker  0.00122928 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3689  ABC transporter related protein  30.87 
 
 		 560 aa  133  9e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5067  ABC transporter related  35.1 
 
 		 549 aa  123  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1593  ABC transporter related protein  31.76 
 
 		 587 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.317799  normal  0.0625099 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1258  hypothetical protein  23.35 
 
 		 578 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  27.05 
 
 		 620 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  26.81 
 
 		 598 aa  111  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3048  ABC transporter related  28.75 
 
 		 584 aa  110  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.522258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.08 
 
 		 632 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  28.02 
 
 		 581 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3400  ABC transporter related  22.84 
 
 		 573 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1070  ABC transporter related protein  27.68 
 
 		 582 aa  107  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0856  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  32.71 
 
 		 566 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  24.39 
 
 		 598 aa  103  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  28.8 
 
 		 623 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6064  ABC transporter related protein  27.49 
 
 		 575 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  26.23 
 
 		 594 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  22.67 
 
 		 582 aa  102  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1737  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  21.15 
 
 		 576 aa  102  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000364888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  24.28 
 
 		 721 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0786  ABC transporter related  27.94 
 
 		 577 aa  100  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757117  hitchhiker  0.00608544 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2746  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.75 
 
 		 627 aa  100  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0546982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2406  ABC transporter related  28.77 
 
 		 570 aa  99.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  21.61 
 
 		 582 aa  98.6  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0360  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  21.59 
 
 		 580 aa  98.2  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000217109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3696  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25 
 
 		 583 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000188932 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  22.85 
 
 		 594 aa  98.2  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0303  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.13 
 
 		 575 aa  97.8  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_49993  ABC(ABCB) family transporter: multidrug (P-glycoprotein-like protein) (ABCB)  26.62 
 
 		 521 aa  98.2  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  25 
 
 		 583 aa  97.4  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  25 
 
 		 583 aa  97.4  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  25 
 
 		 583 aa  97.4  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0736  ABC transporter related  28.05 
 
 		 578 aa  97.4  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  25.44 
 
 		 579 aa  97.1  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  23.6 
 
 		 600 aa  96.3  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0149  ABC transporter related  22.26 
 
 		 584 aa  96.3  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29338  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3385  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  25 
 
 		 583 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.29 
 
 		 573 aa  96.3  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  20.89 
 
 		 577 aa  96.3  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  25.82 
 
 		 598 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0134  ABC transporter related  23.73 
 
 		 574 aa  96.3  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10196  drug ABC transporter ATP-binding protein  32.87 
 
 		 1194 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  27.89 
 
 		 601 aa  95.9  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2796  ABC transporter related  30.02 
 
 		 580 aa  95.5  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00139459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.87 
 
 		 641 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.26 
 
 		 639 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0039  putative ATP-binding component of a transport system  25.47 
 
 		 588 aa  95.1  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0738965  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3033  ABC transporter related  27.34 
 
 		 598 aa  95.1  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.275745  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.25 
 
 		 574 aa  94.7  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  22.34 
 
 		 637 aa  94.7  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.25 
 
 		 574 aa  94.4  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  22.4 
 
 		 566 aa  94.4  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1274  ABC transporter related protein  23.24 
 
 		 572 aa  94  5e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1440  ABC transporter related protein  31.85 
 
 		 596 aa  93.6  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.531129 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02052  ABC multidrug transporter (Eurofung)  23.94 
 
 		 782 aa  93.2  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4431  ABC transporter related  29.79 
 
 		 581 aa  93.2  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  24.06 
 
 		 600 aa  93.2  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  25.17 
 
 		 592 aa  92.8  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4203  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  26.84 
 
 		 650 aa  93.2  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.089699 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  22.81 
 
 		 566 aa  92.8  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1385  ABC transporter related  21.21 
 
 		 579 aa  92.8  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000408144  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.03 
 
 		 585 aa  93.2  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2050  ABC transporter related protein  28.41 
 
 		 581 aa  92.4  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.382467  normal  0.714233 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  24.36 
 
 		 577 aa  92  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  27.56 
 
 		 631 aa  92.4  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  27.34 
 
 		 585 aa  92.4  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3720  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.91 
 
 		 583 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  22 
 
 		 583 aa  92  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  21.62 
 
 		 594 aa  91.7  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  23.91 
 
 		 583 aa  91.7  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  26.13 
 
 		 619 aa  91.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2277  ABC transporter related  23.54 
 
 		 598 aa  91.7  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.977834 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3307  ABC transporter related  24.18 
 
 		 585 aa  92  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.233866  decreased coverage  0.00000537626 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3252  ABC transporter related  29.62 
 
 		 577 aa  92  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  24.83 
 
 		 575 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1221  ABC transporter related protein  20.66 
 
 		 576 aa  91.3  4e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0625  ABC transporter related  24.13 
 
 		 577 aa  91.3  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  22.88 
 
 		 571 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2330  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.8 
 
 		 593 aa  91.3  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.273025 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  28.18 
 
 		 592 aa  90.9  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5649  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.37 
 
 		 583 aa  90.9  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3940  ABC transporter related  28.08 
 
 		 595 aa  90.9  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4014  ABC transporter related  28.08 
 
 		 595 aa  90.9  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3954  ABC transporter related  28.08 
 
 		 595 aa  90.9  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.320073  decreased coverage  0.00177663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>