More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5067 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5067  ABC transporter related  100 
 
 		 549 aa  1014    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3472  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  59.1 
 
 		 564 aa  499  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00244165  hitchhiker  0.00122928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2406  ABC transporter related  48.16 
 
 		 570 aa  379  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6064  ABC transporter related protein  42.8 
 
 		 575 aa  312  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0856  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  38.84 
 
 		 566 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1593  ABC transporter related protein  45.56 
 
 		 587 aa  272  9e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.317799  normal  0.0625099 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3689  ABC transporter related protein  41.65 
 
 		 560 aa  258  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3048  ABC transporter related  39.69 
 
 		 584 aa  247  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.522258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37360  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.57 
 
 		 619 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3041  ABC transporter transmembrane region  36.46 
 
 		 615 aa  232  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327338 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0698  ABC transporter transmembrane region  35.53 
 
 		 612 aa  230  5e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4060  ABC transporter related protein  35.17 
 
 		 570 aa  227  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.282527  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8453  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  38 
 
 		 564 aa  220  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00619084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28420  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.26 
 
 		 607 aa  219  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.520014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2082  ABC transporter transmembrane region  33.87 
 
 		 575 aa  216  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0419  ABC transporter related protein  33.96 
 
 		 574 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.937876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5182  ABC transporter related  35.66 
 
 		 578 aa  207  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.459442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0748  ABC transporter transmembrane region  36.46 
 
 		 593 aa  203  7e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2573  ABC transporter related protein  35.38 
 
 		 619 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0847371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  32.84 
 
 		 598 aa  200  6e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0647  ABC transporter transmembrane region  29.83 
 
 		 589 aa  194  4e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.415337 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3727  ABC transporter related  36.36 
 
 		 578 aa  194  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202459  normal  0.0336359 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  34.71 
 
 		 581 aa  193  7e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  25.97 
 
 		 585 aa  192  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.19 
 
 		 588 aa  191  2.9999999999999997e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  29.11 
 
 		 650 aa  190  7e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  27.53 
 
 		 580 aa  188  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  27.47 
 
 		 588 aa  187  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  35.96 
 
 		 1284 aa  187  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2635  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  37.8 
 
 		 618 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.239281 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  29.7 
 
 		 579 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2356  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38.02 
 
 		 618 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2313  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  35.87 
 
 		 622 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0680321 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  28.12 
 
 		 583 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  28.32 
 
 		 601 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  29.49 
 
 		 741 aa  184  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  28.32 
 
 		 601 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  31.95 
 
 		 581 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0828  ABC transporter related  28 
 
 		 596 aa  184  5.0000000000000004e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  31.6 
 
 		 611 aa  182  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0844  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.81 
 
 		 605 aa  182  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  28.76 
 
 		 644 aa  182  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  25.91 
 
 		 589 aa  181  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  34.58 
 
 		 634 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  27.12 
 
 		 589 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  26.36 
 
 		 586 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  27.86 
 
 		 575 aa  180  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  26.5 
 
 		 578 aa  180  4.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  31.73 
 
 		 608 aa  180  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  24.21 
 
 		 592 aa  180  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1107  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  29.21 
 
 		 591 aa  180  7e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349072  hitchhiker  0.00000399844 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  26.92 
 
 		 577 aa  180  7e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  31.37 
 
 		 601 aa  179  8e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1402  ATPase  31.13 
 
 		 619 aa  179  1e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.387875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  29.89 
 
 		 603 aa  179  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0647  ABC transporter related  29.73 
 
 		 641 aa  178  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14811  multidrug ABC transporter  25.52 
 
 		 596 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.25024  normal  0.341749 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0649  ATPase  25.78 
 
 		 596 aa  178  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.110083  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.72 
 
 		 632 aa  178  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  27.42 
 
 		 578 aa  177  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  29.36 
 
 		 592 aa  177  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  28.45 
 
 		 739 aa  177  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12051  multidrug ABC transporter  27.29 
 
 		 590 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  29.15 
 
 		 660 aa  177  5e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.53 
 
 		 583 aa  177  6e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3696  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.9 
 
 		 583 aa  176  7e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000188932 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  27.91 
 
 		 583 aa  176  7e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  27.91 
 
 		 583 aa  176  7e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.91 
 
 		 583 aa  176  7e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  25.05 
 
 		 587 aa  176  8e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3385  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  27.9 
 
 		 583 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  24.73 
 
 		 594 aa  176  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  26.37 
 
 		 577 aa  176  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  25.93 
 
 		 571 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0918  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.44 
 
 		 616 aa  176  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.624051  normal  0.180079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  27.77 
 
 		 596 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  31.72 
 
 		 865 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1274  ABC transporter related protein  25.86 
 
 		 572 aa  175  1.9999999999999998e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3326  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  36.67 
 
 		 600 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  30.15 
 
 		 584 aa  175  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1657  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.44 
 
 		 555 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  28.54 
 
 		 594 aa  174  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  26.6 
 
 		 590 aa  174  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0625  ABC transporter related  26.4 
 
 		 577 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.08 
 
 		 571 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0519  ABC transporter related  32.91 
 
 		 589 aa  174  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00043092  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.21 
 
 		 571 aa  174  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.33 
 
 		 1257 aa  174  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3249  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  33.15 
 
 		 600 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305361 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4790  ABC transporter related  27.94 
 
 		 550 aa  173  5.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187036  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0093  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.21 
 
 		 610 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  30.54 
 
 		 625 aa  173  6.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  30.69 
 
 		 585 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  30.04 
 
 		 583 aa  173  6.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1110  ATPase  26.67 
 
 		 590 aa  173  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.551514  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0124  ABC transporter related  26.21 
 
 		 573 aa  173  7.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.2 
 
 		 583 aa  173  9e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.26 
 
 		 571 aa  173  9e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0018  ABC transporter related  25.96 
 
 		 581 aa  173  9e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12061  multidrug ABC transporter  26.67 
 
 		 590 aa  173  9e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>