More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2406 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2406  ABC transporter related  100 
 
 		 570 aa  1097    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3472  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  51.44 
 
 		 564 aa  436  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00244165  hitchhiker  0.00122928 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5067  ABC transporter related  48.16 
 
 		 549 aa  333  4e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6064  ABC transporter related protein  42.47 
 
 		 575 aa  314  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1593  ABC transporter related protein  42.8 
 
 		 587 aa  281  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.317799  normal  0.0625099 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37360  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.97 
 
 		 619 aa  270  4e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3689  ABC transporter related protein  39.54 
 
 		 560 aa  266  7e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0856  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  36.7 
 
 		 566 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3048  ABC transporter related  37.86 
 
 		 584 aa  239  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.522258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3041  ABC transporter transmembrane region  35.83 
 
 		 615 aa  214  3.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327338 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28420  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.15 
 
 		 607 aa  209  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.520014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4060  ABC transporter related protein  34.52 
 
 		 570 aa  207  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.282527  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0698  ABC transporter transmembrane region  33.65 
 
 		 612 aa  201  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8453  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  32.96 
 
 		 564 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00619084  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2573  ABC transporter related protein  34.39 
 
 		 619 aa  196  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0847371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2082  ABC transporter transmembrane region  32.81 
 
 		 575 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3727  ABC transporter related  32.23 
 
 		 578 aa  185  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202459  normal  0.0336359 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3025  ABC transporter transmembrane region  39.04 
 
 		 619 aa  180  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.946814  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0419  ABC transporter related protein  33.04 
 
 		 574 aa  179  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.937876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0748  ABC transporter transmembrane region  33.03 
 
 		 593 aa  177  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5182  ABC transporter related  33.74 
 
 		 578 aa  176  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.459442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.83 
 
 		 588 aa  175  2.9999999999999996e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  29.75 
 
 		 585 aa  171  3e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  26.14 
 
 		 581 aa  171  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3249  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  29.27 
 
 		 600 aa  170  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305361 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  29.29 
 
 		 598 aa  169  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0647  ABC transporter transmembrane region  28.15 
 
 		 589 aa  166  6.9999999999999995e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.415337 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10196  drug ABC transporter ATP-binding protein  29.98 
 
 		 1194 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  27 
 
 		 597 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  27.27 
 
 		 600 aa  163  7e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3546  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  27.77 
 
 		 600 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  27.59 
 
 		 598 aa  160  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  26.46 
 
 		 582 aa  160  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1548  ABC transporter related  31.04 
 
 		 593 aa  159  9e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.985805  normal  0.0736759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  30.59 
 
 		 620 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.58 
 
 		 580 aa  159  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  27.73 
 
 		 610 aa  158  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2533  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.87 
 
 		 590 aa  159  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.611222  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  27.29 
 
 		 601 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  27.29 
 
 		 601 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2270  ABC transporter related  27.59 
 
 		 619 aa  159  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.903332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.73 
 
 		 609 aa  158  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  27.35 
 
 		 572 aa  158  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  27.78 
 
 		 579 aa  157  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0377  ABC transporter related  29.9 
 
 		 1264 aa  157  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.843886  normal  0.12564 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3262  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  27.64 
 
 		 764 aa  157  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  27.08 
 
 		 586 aa  157  6e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0163  toxin secretion ATP-binding protein  23.73 
 
 		 712 aa  157  6e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  30.08 
 
 		 581 aa  157  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  24.86 
 
 		 589 aa  157  7e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2765  ABC transporter related protein  30.85 
 
 		 695 aa  156  8e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2002  type I secretion system ATPase  28.33 
 
 		 712 aa  156  9e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  25.27 
 
 		 586 aa  156  9e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  28.57 
 
 		 712 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  29.39 
 
 		 598 aa  156  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3551  ABC transporter related  27.14 
 
 		 632 aa  156  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127969 
 
 
-
 
NC_004310  BR1715  ABC transporter, ATP binding/permease protein  30.36 
 
 		 599 aa  155  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.6745  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0519  ABC transporter related  32.83 
 
 		 589 aa  155  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00043092  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3017  ABC transporter related protein  27.32 
 
 		 639 aa  155  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.89 
 
 		 1000 aa  155  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1417  ABC transporter related  28.15 
 
 		 782 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  22.78 
 
 		 582 aa  155  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2584  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.33 
 
 		 600 aa  155  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.544743  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  27.49 
 
 		 986 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8741  carbohydrate ABC transporter  27.17 
 
 		 577 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  29.17 
 
 		 636 aa  154  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  28.14 
 
 		 620 aa  154  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  25.47 
 
 		 930 aa  154  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  25.65 
 
 		 580 aa  153  7e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  27.5 
 
 		 768 aa  153  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2422  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.33 
 
 		 601 aa  153  7e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2492  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.33 
 
 		 601 aa  153  7e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677361  normal  0.121232 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1371  ABC transporter-related protein  28.25 
 
 		 613 aa  153  7e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  23.12 
 
 		 581 aa  153  8e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  23.84 
 
 		 584 aa  153  8.999999999999999e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  24.08 
 
 		 597 aa  153  8.999999999999999e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  27.63 
 
 		 596 aa  153  8.999999999999999e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1274  ABC transporter related protein  25.55 
 
 		 572 aa  152  1e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  28.31 
 
 		 575 aa  152  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  27.65 
 
 		 579 aa  152  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  26.82 
 
 		 604 aa  151  2e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0802  ABC transporter-like protein  27.89 
 
 		 572 aa  151  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1657  ABC transporter, ATP binding/permease protein  30.36 
 
 		 681 aa  152  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  29.52 
 
 		 581 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  29.07 
 
 		 578 aa  151  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  26.18 
 
 		 592 aa  151  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0647  ABC transporter related  27.07 
 
 		 641 aa  151  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2313  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  30.57 
 
 		 622 aa  151  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0680321 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  28.72 
 
 		 611 aa  151  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  26.45 
 
 		 583 aa  151  4e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2258  type I secretion system ATPase  28.1 
 
 		 712 aa  151  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1391  ABC transporter related  26.65 
 
 		 598 aa  151  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.310591  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  26.3 
 
 		 601 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.25 
 
 		 641 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  22.94 
 
 		 582 aa  150  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1240  hypothetical protein  24.21 
 
 		 603 aa  150  6e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.82 
 
 		 572 aa  150  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2802  ABC transporter, ATP-binding protein MsbA  26.49 
 
 		 601 aa  150  8e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  28.79 
 
 		 634 aa  150  8e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  24.28 
 
 		 594 aa  150  8e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>