More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3689 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3689  ABC transporter related protein  100 
 
 		 560 aa  1073    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6064  ABC transporter related protein  44 
 
 		 575 aa  375  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3472  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.01 
 
 		 564 aa  281  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00244165  hitchhiker  0.00122928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2406  ABC transporter related  39.54 
 
 		 570 aa  259  9e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3048  ABC transporter related  37.21 
 
 		 584 aa  255  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.522258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37360  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.96 
 
 		 619 aa  230  6e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5067  ABC transporter related  40.72 
 
 		 549 aa  222  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1593  ABC transporter related protein  39.38 
 
 		 587 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.317799  normal  0.0625099 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4060  ABC transporter related protein  31.95 
 
 		 570 aa  180  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.282527  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3727  ABC transporter related  33.4 
 
 		 578 aa  179  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202459  normal  0.0336359 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28420  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.16 
 
 		 607 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.520014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0856  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  32.06 
 
 		 566 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2082  ABC transporter transmembrane region  31.81 
 
 		 575 aa  166  9e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3041  ABC transporter transmembrane region  30.66 
 
 		 615 aa  165  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8453  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  31.16 
 
 		 564 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00619084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0748  ABC transporter transmembrane region  32.76 
 
 		 593 aa  164  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.26 
 
 		 597 aa  163  8.000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0698  ABC transporter transmembrane region  30.22 
 
 		 612 aa  148  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3696  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.15 
 
 		 583 aa  147  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000188932 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0419  ABC transporter related protein  29 
 
 		 574 aa  146  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.937876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.97 
 
 		 583 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3025  ABC transporter transmembrane region  35.98 
 
 		 619 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.946814  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  26.97 
 
 		 583 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  26.97 
 
 		 583 aa  145  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.97 
 
 		 583 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3385  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  26.97 
 
 		 583 aa  145  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.32 
 
 		 588 aa  143  9e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  25.88 
 
 		 589 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.98 
 
 		 593 aa  143  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.5 
 
 		 583 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0647  ABC transporter transmembrane region  29.17 
 
 		 589 aa  139  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.415337 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  26.2 
 
 		 586 aa  138  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  26.57 
 
 		 588 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  26.7 
 
 		 583 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  29.04 
 
 		 579 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  28.66 
 
 		 581 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3720  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.79 
 
 		 583 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3715  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.61 
 
 		 583 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000980876  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  26.75 
 
 		 583 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  24.64 
 
 		 583 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5182  ABC transporter related  29.55 
 
 		 578 aa  133  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.459442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2573  ABC transporter related protein  30.19 
 
 		 619 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0847371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27200  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.38 
 
 		 702 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.663509  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  23.34 
 
 		 582 aa  131  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  27.72 
 
 		 591 aa  131  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  29.62 
 
 		 1284 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1657  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  23.72 
 
 		 555 aa  130  7.000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1274  ABC transporter related protein  23.87 
 
 		 572 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  28.23 
 
 		 596 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1226  ABC transporter, transmembrane region  29.7 
 
 		 595 aa  127  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.56473  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  26.4 
 
 		 660 aa  127  6e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  29.46 
 
 		 1522 aa  127  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1432  ABC transporter related protein  25.7 
 
 		 661 aa  126  8.000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.590543  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  26.71 
 
 		 579 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1440  ABC transporter related protein  31.05 
 
 		 596 aa  126  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.531129 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  25.92 
 
 		 614 aa  126  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  28.18 
 
 		 584 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  25.27 
 
 		 604 aa  124  4e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  25.26 
 
 		 598 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1002  ABC transporter related  32.38 
 
 		 722 aa  124  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3407  ABC transporter related  31.36 
 
 		 625 aa  124  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0356305 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10196  drug ABC transporter ATP-binding protein  27.36 
 
 		 1194 aa  124  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  25.71 
 
 		 578 aa  124  7e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  27.51 
 
 		 586 aa  123  8e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1889  ABC transporter related  29.91 
 
 		 590 aa  123  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.19709  normal  0.932579 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  27.77 
 
 		 606 aa  123  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0276  ABC transporter related  25.7 
 
 		 583 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1515  ABC transporter related  23.45 
 
 		 577 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2270  ABC transporter related  26.44 
 
 		 619 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.903332  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0460  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.55 
 
 		 581 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  27.49 
 
 		 601 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  27.82 
 
 		 644 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.76 
 
 		 609 aa  121  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  26.41 
 
 		 601 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  27.76 
 
 		 610 aa  121  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  27.56 
 
 		 641 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  25.98 
 
 		 650 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3551  ABC transporter related  26.31 
 
 		 632 aa  120  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127969 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  24.81 
 
 		 575 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  26.23 
 
 		 663 aa  120  6e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1058  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  25.52 
 
 		 588 aa  120  9e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.61208  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1636  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.68 
 
 		 586 aa  120  9e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3181  ABC transporter related  32.82 
 
 		 625 aa  120  9e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  25.53 
 
 		 601 aa  120  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1818  ABC transporter related  26.34 
 
 		 601 aa  120  9e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000170896 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0246  ABC lipid efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  29.67 
 
 		 590 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  25.53 
 
 		 601 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3183  ABC transporter related protein  26.76 
 
 		 615 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0496576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1564  ABC transporter related  24.19 
 
 		 577 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02020  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.82 
 
 		 676 aa  119  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.428609  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  26.39 
 
 		 587 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4445  ABC transporter related  27.34 
 
 		 650 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789394  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0802  ABC transporter-like protein  26.46 
 
 		 572 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4532  ABC transporter related  27.34 
 
 		 650 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.329885  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4572  ABC transporter, transmembrane region  25.38 
 
 		 546 aa  118  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1402  ATPase  28.02 
 
 		 619 aa  118  3e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.387875  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  27.45 
 
 		 738 aa  118  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  27.37 
 
 		 636 aa  118  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  23.76 
 
 		 649 aa  118  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2019  ABC transporter related  29.21 
 
 		 590 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.990408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>