More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8453 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8453  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  100 
 
 		 564 aa  1098    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00619084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5182  ABC transporter related  57.61 
 
 		 578 aa  577  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.459442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2082  ABC transporter transmembrane region  50.79 
 
 		 575 aa  517  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1127  ABC transporter transmembrane region  57.45 
 
 		 580 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4060  ABC transporter related protein  46.81 
 
 		 570 aa  462  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.282527  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0419  ABC transporter related protein  47.6 
 
 		 574 aa  455  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.937876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3041  ABC transporter transmembrane region  46.57 
 
 		 615 aa  436  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327338 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0748  ABC transporter transmembrane region  48.04 
 
 		 593 aa  434  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28420  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  44.5 
 
 		 607 aa  434  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.520014 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0698  ABC transporter transmembrane region  44.36 
 
 		 612 aa  424  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  45.61 
 
 		 588 aa  417  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2573  ABC transporter related protein  47.4 
 
 		 619 aa  414  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0847371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3727  ABC transporter related  41.04 
 
 		 578 aa  368  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202459  normal  0.0336359 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4196  ABC transporter transmembrane region  43.28 
 
 		 580 aa  363  3e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00643785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0647  ABC transporter transmembrane region  38.19 
 
 		 589 aa  347  4e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.415337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3472  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.55 
 
 		 564 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00244165  hitchhiker  0.00122928 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6064  ABC transporter related protein  32.58 
 
 		 575 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  26.98 
 
 		 584 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1593  ABC transporter related protein  32.73 
 
 		 587 aa  180  7e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.317799  normal  0.0625099 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2406  ABC transporter related  33.71 
 
 		 570 aa  177  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  26.64 
 
 		 586 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0942  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.34 
 
 		 586 aa  171  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785069  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01280  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.2 
 
 		 530 aa  170  7e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  26.29 
 
 		 586 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0906  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.47 
 
 		 586 aa  169  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000129836  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  26.03 
 
 		 608 aa  168  2e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0757  ABC transporter related  26.64 
 
 		 586 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000135449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.29 
 
 		 586 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1033  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.29 
 
 		 586 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.49 
 
 		 593 aa  166  8e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0809  ABC transporter ATP-binding/permease  26.11 
 
 		 586 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00766142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0852  ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.11 
 
 		 586 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3048  ABC transporter related  30.59 
 
 		 584 aa  164  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.522258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5067  ABC transporter related  37.86 
 
 		 549 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4432  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.31 
 
 		 548 aa  161  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000325117  normal  0.0473884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  28.17 
 
 		 641 aa  160  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  25.61 
 
 		 589 aa  160  8e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  27.44 
 
 		 579 aa  160  8e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0018  ABC transporter related  26.55 
 
 		 573 aa  159  1e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0115  ABC transporter related  24.62 
 
 		 609 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4445  ABC transporter related  27.73 
 
 		 650 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4532  ABC transporter related  27.73 
 
 		 650 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.329885  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2077  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.21 
 
 		 597 aa  157  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0851764  normal  0.0377374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0830  ABC transporter related  28.78 
 
 		 612 aa  157  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000934514 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  29.11 
 
 		 585 aa  155  1e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27 
 
 		 582 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003564  ATP-binding component of a transport system  26.29 
 
 		 579 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  29.46 
 
 		 581 aa  154  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0856  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  31.51 
 
 		 566 aa  154  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3530  ABC transporter, ATP-binding/permease  26.02 
 
 		 590 aa  151  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.672415 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  29.17 
 
 		 631 aa  151  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25.93 
 
 		 582 aa  151  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  24.44 
 
 		 583 aa  150  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25.32 
 
 		 582 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25.32 
 
 		 582 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25.32 
 
 		 582 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25.32 
 
 		 582 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25.32 
 
 		 582 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1747  ABC transporter related  27.95 
 
 		 633 aa  150  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.33 
 
 		 600 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1705  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.86 
 
 		 602 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.433379  normal  0.881057 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  25.4 
 
 		 582 aa  149  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2674  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.86 
 
 		 602 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0832532  normal  0.0804565 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1668  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.86 
 
 		 602 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1683  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.86 
 
 		 602 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  24.46 
 
 		 582 aa  148  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.46 
 
 		 582 aa  148  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1719  ABC transporter ATP-binding protein  27.02 
 
 		 616 aa  148  3e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.46 
 
 		 582 aa  148  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  24.46 
 
 		 582 aa  148  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.46 
 
 		 582 aa  148  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.46 
 
 		 582 aa  148  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.46 
 
 		 582 aa  148  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.46 
 
 		 582 aa  148  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  24.3 
 
 		 583 aa  148  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.46 
 
 		 582 aa  148  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1697  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  29.68 
 
 		 631 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02524  hypothetical protein  25.75 
 
 		 579 aa  147  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3228  ABC transporter related protein  32.32 
 
 		 591 aa  147  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1157  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  28.6 
 
 		 638 aa  147  6e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0429798  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  23.81 
 
 		 589 aa  147  6e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.3 
 
 		 583 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3474  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.13 
 
 		 596 aa  146  9e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3290  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  29.76 
 
 		 597 aa  146  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  27.88 
 
 		 603 aa  146  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0900  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.2 
 
 		 583 aa  145  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0510675  normal  0.909726 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  23.01 
 
 		 586 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2823  ABC transporter related protein  28.77 
 
 		 585 aa  145  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2689  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  25.32 
 
 		 579 aa  145  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000864453  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5527  ABC transporter related protein  28.87 
 
 		 604 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0985  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  27.65 
 
 		 596 aa  145  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.426098  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2388  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.48 
 
 		 600 aa  145  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.496768  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.31 
 
 		 590 aa  145  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3184  ABC transporter related protein  27.29 
 
 		 671 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0347906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  28.6 
 
 		 603 aa  145  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0594  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.27 
 
 		 613 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2199  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  24.12 
 
 		 600 aa  144  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25.05 
 
 		 582 aa  144  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2125  lipid ABC transporter, ATP-binding/permease protein MsbA  25.42 
 
 		 602 aa  144  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0153506  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1912  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.61 
 
 		 574 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0734969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>