More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0647 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0647  ABC transporter transmembrane region  100 
 
 
589 aa  1174    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.415337 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28420  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  53.9 
 
 
607 aa  587  1e-166  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.520014 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0698  ABC transporter transmembrane region  51.08 
 
 
612 aa  513  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3041  ABC transporter transmembrane region  48.75 
 
 
615 aa  507  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327338 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2573  ABC transporter related protein  52.09 
 
 
619 aa  494  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0847371  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3727  ABC transporter related  38.82 
 
 
578 aa  368  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202459  normal  0.0336359 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0748  ABC transporter transmembrane region  41.55 
 
 
593 aa  357  5e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8453  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  38.31 
 
 
564 aa  347  5e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00619084  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.1 
 
 
588 aa  344  2.9999999999999997e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2082  ABC transporter transmembrane region  36.84 
 
 
575 aa  335  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5182  ABC transporter related  37.14 
 
 
578 aa  323  4e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.459442  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0419  ABC transporter related protein  33.86 
 
 
574 aa  296  6e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.937876  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4196  ABC transporter transmembrane region  33.98 
 
 
580 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00643785  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4060  ABC transporter related protein  32.63 
 
 
570 aa  284  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.282527  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1127  ABC transporter transmembrane region  37 
 
 
580 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6064  ABC transporter related protein  29.71 
 
 
575 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3472  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  29.95 
 
 
564 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00244165  hitchhiker  0.00122928 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1593  ABC transporter related protein  29.47 
 
 
587 aa  159  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.317799  normal  0.0625099 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  25.94 
 
 
594 aa  156  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  26.12 
 
 
584 aa  154  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  26.07 
 
 
583 aa  153  8e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  22.98 
 
 
582 aa  151  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0115  ABC transporter related  22.15 
 
 
609 aa  149  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1033  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.41 
 
 
586 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0018  ABC transporter related  23.89 
 
 
581 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.23 
 
 
586 aa  147  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  27.15 
 
 
589 aa  147  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  25.81 
 
 
578 aa  147  6e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  26.23 
 
 
586 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0757  ABC transporter related  25.53 
 
 
586 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000135449  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  26.96 
 
 
581 aa  146  9e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0809  ABC transporter ATP-binding/permease  26.23 
 
 
586 aa  146  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00766142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0852  ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.23 
 
 
586 aa  146  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  28.77 
 
 
579 aa  146  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0906  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.84 
 
 
586 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000129836  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.62 
 
 
593 aa  145  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0942  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.91 
 
 
586 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785069  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  24.53 
 
 
583 aa  144  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  26.06 
 
 
586 aa  144  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  27.25 
 
 
584 aa  144  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  21.64 
 
 
573 aa  144  6e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4432  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.67 
 
 
548 aa  143  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000325117  normal  0.0473884 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  23.67 
 
 
589 aa  142  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1782  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  24.72 
 
 
588 aa  142  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  29.84 
 
 
631 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.19 
 
 
583 aa  141  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1947  multidrug ABC transporter ATPase/permease  25.7 
 
 
652 aa  140  7.999999999999999e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0369658  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.84 
 
 
583 aa  140  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003564  ATP-binding component of a transport system  25.34 
 
 
579 aa  139  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0900  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.56 
 
 
583 aa  139  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0510675  normal  0.909726 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02524  hypothetical protein  26.27 
 
 
579 aa  139  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1783  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  24.34 
 
 
588 aa  139  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0833  ABC transporter related  26.82 
 
 
612 aa  138  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0369945  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3696  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.19 
 
 
583 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000188932 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3385  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  24.36 
 
 
583 aa  137  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  22.81 
 
 
608 aa  137  4e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11248  ABC transporter, ATP-binding protein  23.1 
 
 
566 aa  138  4e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3048  ABC transporter related  27.16 
 
 
584 aa  137  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.522258  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  24.19 
 
 
583 aa  137  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  24.19 
 
 
583 aa  137  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  24.19 
 
 
583 aa  137  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  23.41 
 
 
578 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5067  ABC transporter related  29.83 
 
 
549 aa  137  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1636  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  23.79 
 
 
586 aa  137  7.000000000000001e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  25.87 
 
 
610 aa  137  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.87 
 
 
609 aa  137  8e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3715  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.73 
 
 
583 aa  136  8e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000980876  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3720  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.73 
 
 
583 aa  137  8e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  25.52 
 
 
588 aa  136  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2406  ABC transporter related  28.23 
 
 
570 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0802  ABC transporter-like protein  25.7 
 
 
572 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1657  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.91 
 
 
555 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1274  ABC transporter related protein  23.74 
 
 
572 aa  135  3e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  23.76 
 
 
598 aa  135  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25 
 
 
582 aa  135  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  22.4 
 
 
581 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  28.24 
 
 
641 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  22.99 
 
 
606 aa  134  5e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  24.44 
 
 
1016 aa  133  6.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  24.08 
 
 
582 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.08 
 
 
582 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  25.53 
 
 
600 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  23.99 
 
 
582 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.08 
 
 
582 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.08 
 
 
582 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.08 
 
 
582 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  23.99 
 
 
582 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  23.99 
 
 
582 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.08 
 
 
582 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.08 
 
 
582 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  23.84 
 
 
606 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  23.99 
 
 
582 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  24.56 
 
 
595 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  24.08 
 
 
582 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  23.99 
 
 
582 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.08 
 
 
582 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  25.39 
 
 
602 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  22.96 
 
 
581 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  26.68 
 
 
581 aa  132  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06455  RTX toxin transporter  25.17 
 
 
714 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>